RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000028157.8

Gtf3c5-201, Transcript of General transcription factor 3C polypeptide 5, mousemouse

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene Gtf3c5, Length 2,739 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ube2e2Q91W82 201 aa10.14□□□□□ -0.79
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Arid1bE9Q4N7 2244 aa10.13□□□□□ -0.79
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Fxyd7P59648 80 aa10.13□□□□□ -0.79
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Wfdc21Q8BTE6 63 aa10.13□□□□□ -0.79
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ceacam15A0A0B4J1L0 234 aa10.13□□□□□ -0.79
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gm5089A1L3C8 106 aa10.13□□□□□ -0.79
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 BC067074F6RXI4 2391 aa10.13□□□□□ -0.79
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 TcraP01849 138 aa10.13□□□□□ -0.79
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 NpsP0C0P8 89 aa10.13□□□□□ -0.79
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Snrpd3P62320 126 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 C1qcQ02105 246 aa10.13□□□□□ -0.79
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gm10775Q3V290 127 aa10.13□□□□□ -0.79
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Hnrnpa3Q8BG05 379 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Foxi1Q922I5 372 aa10.13□□□□□ -0.79
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Dynlrb2Q9DAJ5 96 aa10.13□□□□□ -0.79
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Trbv13-1A0A0B4J1P8 112 aa10.12□□□□□ -0.79
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gm45521A0A1B0GRK0 198 aa10.12□□□□□ -0.79
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Sdhaf1Q3U276 118 aa10.12□□□□□ -0.79
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Olfr1367Q8VFG2 316 aa10.12□□□□□ -0.79
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ndufc2Q9CQ54 120 aa10.12□□□□□ -0.79
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Slc25a20Q9Z2Z6 301 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Col7a1Q63870 2944 aa10.12□□□□□ -0.79
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 1810032O08RikE9PZV8 113 aa10.12□□□□□ -0.79
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 BC107364E9Q5A2 140 aa10.12□□□□□ -0.79
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Esp3J3QN49 87 aa10.12□□□□□ -0.79
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Thy1P01831 162 aa10.12□□□□□ -0.79
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gpx1P11352 201 aa10.12□□□□□ -0.79
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Defb2P82020 71 aa10.12□□□□□ -0.79
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Spink10Q8CAC8 162 aa10.12□□□□□ -0.79
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gnb1lQ9EQ15 326 aa10.12□□□□□ -0.79
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Nf1Q04690 2841 aa10.12□□□□□ -0.79
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Defa30E9QPZ2 93 aa10.11□□□□□ -0.79
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Slc35d2Q762D5 326 aa10.11□□□□□ -0.79
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Clec5aQ9R007 190 aa10.11□□□□□ -0.79
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Tmem238lA0A1B0GS74 79 aa10.11□□□□□ -0.79
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Defa6P50704 93 aa10.11□□□□□ -0.79
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Olfr313Q5NC55 308 aa10.11□□□□□ -0.79
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Cphx2Q8BX39 182 aa10.11□□□□□ -0.79
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Spcs1Q9D958 161 aa10.11□□□□□ -0.79
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Umad1E0CX23 159 aa10.1□□□□□ -0.79
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 ColqO35348 457 aa10.1□□□□□ -0.79
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Hoxd3P09027 433 aa10.1□□□□□ -0.79
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Clec4b2Q67DU8 208 aa10.1□□□□□ -0.79
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 AI854703Q8BIN3 203 aa10.1□□□□□ -0.79
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ankrd17Q99NH0 2603 aaKnown RBP10.1□□□□□ -0.79
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ighv12-3A0A075B5T1 117 aa10.1□□□□□ -0.79
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 BtcQ05928 177 aa10.1□□□□□ -0.79
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 CubnQ9JLB4 3623 aa10.09□□□□□ -0.79
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ighv1-63A0A075B5X2 117 aa10.09□□□□□ -0.79
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gm29666A0A087WQ99 126 aa10.09□□□□□ -0.79
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Fhl2O70433 279 aa10.09□□□□□ -0.79
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ighv1-66A0A075B5X5 117 aa10.09□□□□□ -0.79
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ly6g5bQ8K1T4 194 aa10.09□□□□□ -0.79
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Fam216aQ9DB54 251 aa10.09□□□□□ -0.79
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Cd69P37217 199 aa10.08□□□□□ -0.8
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ormdl2Q9CQZ0 153 aa10.08□□□□□ -0.8
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Pdzd2E9Q1M1 2796 aa10.08□□□□□ -0.8
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ly86O88188 162 aa10.08□□□□□ -0.8
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gm5629P06327 117 aa10.08□□□□□ -0.8
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 P18527 97 aa10.08□□□□□ -0.8
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 1500011B03RikQ3TTH7 73 aa10.08□□□□□ -0.8
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Spag11Q8K4N2 71 aa10.08□□□□□ -0.8
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ube2v1Q9CZY3 147 aa10.07□□□□□ -0.8
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 PmvkQ9D1G2 192 aa10.07□□□□□ -0.8
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 AY761184Q9D848 116 aa10.07□□□□□ -0.8
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Iah1Q9DB29 249 aa10.07□□□□□ -0.8
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ank2Q8C8R3 3898 aa10.07□□□□□ -0.8
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gm16442D3YZG3 307 aa10.07□□□□□ -0.8
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gm17430F6RSK3 157 aa10.07□□□□□ -0.8
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gphb5Q812B2 130 aa10.07□□□□□ -0.8
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Cdpf1Q8R3A2 119 aa10.07□□□□□ -0.8
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ucn2Q99ML8 113 aa10.07□□□□□ -0.8
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 4930564D02RikQ9D4S4 103 aa10.07□□□□□ -0.8
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 CtrlQ9ER05 264 aa10.07□□□□□ -0.8
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Josd1Q9DBJ6 202 aa10.06□□□□□ -0.8
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Unc79Q0KK59 2596 aa10.06□□□□□ -0.8
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ighv5-9-1A0A0A6YVS4 126 aa10.06□□□□□ -0.8
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Egr2P08152 470 aa10.06□□□□□ -0.8
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 HampQ9EQ21 83 aa10.06□□□□□ -0.8
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 BsnO88737 3942 aa10.06□□□□□ -0.8
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gm10271F6WY25 52 aa10.06□□□□□ -0.8
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 8030423J24RikQ9CX45 142 aa10.06□□□□□ -0.8
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Rs1Q9Z1L4 224 aa10.06□□□□□ -0.8
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Chd6A3KFM7 2711 aa10.05□□□□□ -0.8
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gm20499D3Z4G5 72 aa10.05□□□□□ -0.8
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gm8439G3UWA7 96 aa10.05□□□□□ -0.8
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Psmb8P28063 276 aa10.05□□□□□ -0.8
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gm5464Q3UY29 175 aa10.05□□□□□ -0.8
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 G0s2Q61585 103 aa10.05□□□□□ -0.8
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Cotl1Q9CQI6 142 aa10.05□□□□□ -0.8
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 PpdpfQ9CR37 115 aa10.05□□□□□ -0.8
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Reg3gO09049 174 aa10.05□□□□□ -0.8
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Fgf6P21658 208 aa10.05□□□□□ -0.8
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Chac1Q8R3J5 223 aa10.05□□□□□ -0.8
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Mast4Q811L6 2618 aa10.04□□□□□ -0.8
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Trbv16A0A0B4J1H3 115 aa10.04□□□□□ -0.8
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Polr2kQ63871 58 aa10.04□□□□□ -0.8
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Synj2bpQ9D6K5 145 aa10.04□□□□□ -0.8
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Tex48Q9DA81 110 aa10.04□□□□□ -0.8
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 FlnaQ8BTM8 2647 aaKnown RBP10.04□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 12.1 ms