Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M1

Pdzd2, PDZ domain-containing 2, mousemouse

Predictions only

Length 2,796 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd2E9Q1M1 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC32.47■■■□□ 2.79
Pdzd2E9Q1M1 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Pdzd2E9Q1M1 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Pdzd2E9Q1M1 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Pdzd2E9Q1M1 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Pdzd2E9Q1M1 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Pdzd2E9Q1M1 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Pdzd2E9Q1M1 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Pdzd2E9Q1M1 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Pdzd2E9Q1M1 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Pdzd2E9Q1M1 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Pdzd2E9Q1M1 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Pdzd2E9Q1M1 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Pdzd2E9Q1M1 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Pdzd2E9Q1M1 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Pdzd2E9Q1M1 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Pdzd2E9Q1M1 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pdzd2E9Q1M1 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Pdzd2E9Q1M1 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Pdzd2E9Q1M1 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Pdzd2E9Q1M1 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pdzd2E9Q1M1 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Pdzd2E9Q1M1 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pdzd2E9Q1M1 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pdzd2E9Q1M1 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pdzd2E9Q1M1 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pdzd2E9Q1M1 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pdzd2E9Q1M1 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pdzd2E9Q1M1 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Pdzd2E9Q1M1 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pdzd2E9Q1M1 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Pdzd2E9Q1M1 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pdzd2E9Q1M1 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pdzd2E9Q1M1 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pdzd2E9Q1M1 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pdzd2E9Q1M1 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pdzd2E9Q1M1 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pdzd2E9Q1M1 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pdzd2E9Q1M1 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pdzd2E9Q1M1 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pdzd2E9Q1M1 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pdzd2E9Q1M1 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Pdzd2E9Q1M1 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Pdzd2E9Q1M1 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pdzd2E9Q1M1 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pdzd2E9Q1M1 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Pdzd2E9Q1M1 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Pdzd2E9Q1M1 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pdzd2E9Q1M1 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pdzd2E9Q1M1 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Pdzd2E9Q1M1 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pdzd2E9Q1M1 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Pdzd2E9Q1M1 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pdzd2E9Q1M1 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pdzd2E9Q1M1 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pdzd2E9Q1M1 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pdzd2E9Q1M1 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pdzd2E9Q1M1 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Pdzd2E9Q1M1 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Pdzd2E9Q1M1 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pdzd2E9Q1M1 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pdzd2E9Q1M1 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pdzd2E9Q1M1 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Pdzd2E9Q1M1 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pdzd2E9Q1M1 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pdzd2E9Q1M1 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pdzd2E9Q1M1 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pdzd2E9Q1M1 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pdzd2E9Q1M1 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Pdzd2E9Q1M1 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pdzd2E9Q1M1 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pdzd2E9Q1M1 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Pdzd2E9Q1M1 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pdzd2E9Q1M1 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Pdzd2E9Q1M1 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pdzd2E9Q1M1 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pdzd2E9Q1M1 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pdzd2E9Q1M1 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pdzd2E9Q1M1 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pdzd2E9Q1M1 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Pdzd2E9Q1M1 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pdzd2E9Q1M1 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pdzd2E9Q1M1 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pdzd2E9Q1M1 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pdzd2E9Q1M1 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pdzd2E9Q1M1 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pdzd2E9Q1M1 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pdzd2E9Q1M1 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pdzd2E9Q1M1 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pdzd2E9Q1M1 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pdzd2E9Q1M1 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pdzd2E9Q1M1 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pdzd2E9Q1M1 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pdzd2E9Q1M1 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pdzd2E9Q1M1 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pdzd2E9Q1M1 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Pdzd2E9Q1M1 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pdzd2E9Q1M1 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Pdzd2E9Q1M1 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pdzd2E9Q1M1 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
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