Protein–RNA interactions for Protein: F6RXI4

BC067074, cDNA sequence BC067074, mousemouse

Predictions only

Length 2,391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC067074F6RXI4 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC31.44■■■□□ 2.62
BC067074F6RXI4 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
BC067074F6RXI4 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
BC067074F6RXI4 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
BC067074F6RXI4 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
BC067074F6RXI4 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
BC067074F6RXI4 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
BC067074F6RXI4 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
BC067074F6RXI4 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
BC067074F6RXI4 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
BC067074F6RXI4 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
BC067074F6RXI4 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
BC067074F6RXI4 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
BC067074F6RXI4 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
BC067074F6RXI4 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
BC067074F6RXI4 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BC067074F6RXI4 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BC067074F6RXI4 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BC067074F6RXI4 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BC067074F6RXI4 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
BC067074F6RXI4 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BC067074F6RXI4 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BC067074F6RXI4 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
BC067074F6RXI4 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BC067074F6RXI4 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BC067074F6RXI4 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BC067074F6RXI4 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BC067074F6RXI4 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
BC067074F6RXI4 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BC067074F6RXI4 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BC067074F6RXI4 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BC067074F6RXI4 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BC067074F6RXI4 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
BC067074F6RXI4 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BC067074F6RXI4 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BC067074F6RXI4 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BC067074F6RXI4 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BC067074F6RXI4 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
BC067074F6RXI4 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BC067074F6RXI4 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BC067074F6RXI4 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BC067074F6RXI4 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
BC067074F6RXI4 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
BC067074F6RXI4 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
BC067074F6RXI4 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BC067074F6RXI4 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BC067074F6RXI4 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BC067074F6RXI4 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
BC067074F6RXI4 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
BC067074F6RXI4 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BC067074F6RXI4 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
BC067074F6RXI4 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BC067074F6RXI4 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
BC067074F6RXI4 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
BC067074F6RXI4 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BC067074F6RXI4 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
BC067074F6RXI4 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
BC067074F6RXI4 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BC067074F6RXI4 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BC067074F6RXI4 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BC067074F6RXI4 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BC067074F6RXI4 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BC067074F6RXI4 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BC067074F6RXI4 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BC067074F6RXI4 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BC067074F6RXI4 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BC067074F6RXI4 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BC067074F6RXI4 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BC067074F6RXI4 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BC067074F6RXI4 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BC067074F6RXI4 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BC067074F6RXI4 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BC067074F6RXI4 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BC067074F6RXI4 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BC067074F6RXI4 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BC067074F6RXI4 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BC067074F6RXI4 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BC067074F6RXI4 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BC067074F6RXI4 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BC067074F6RXI4 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BC067074F6RXI4 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
BC067074F6RXI4 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BC067074F6RXI4 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BC067074F6RXI4 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BC067074F6RXI4 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
BC067074F6RXI4 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
BC067074F6RXI4 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BC067074F6RXI4 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BC067074F6RXI4 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BC067074F6RXI4 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BC067074F6RXI4 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BC067074F6RXI4 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BC067074F6RXI4 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BC067074F6RXI4 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BC067074F6RXI4 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BC067074F6RXI4 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BC067074F6RXI4 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
BC067074F6RXI4 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
BC067074F6RXI4 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BC067074F6RXI4 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
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