RNA–Protein interactions for RNA: YOL054W

PSH1, Transcript of E3 ubiquitin ligase targeting centromere-binding protein Cse4p, yeast

Gene PSH1, Length 1,221 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PSH1	YOL054W	POA1	P38218	177 aa		5.94	□□□□□ -1.46
PSH1	YOL054W	YNL320W	P42840	284 aa		5.94	□□□□□ -1.46
PSH1	YOL054W	VID30	P53076	958 aa		5.94	□□□□□ -1.46
PSH1	YOL054W	MFM1	Q02783	413 aa		5.94	□□□□□ -1.46
PSH1	YOL054W	RIX7	Q07844	837 aa	Known RBP	5.94	□□□□□ -1.46
PSH1	YOL054W	TAF10	Q12030	206 aa		5.94	□□□□□ -1.46
PSH1	YOL054W	MED1	Q12321	566 aa		5.94	□□□□□ -1.46
PSH1	YOL054W	RIB2	Q12362	591 aa	Known RBP	5.94	□□□□□ -1.46
PSH1	YOL054W	MPD2	Q99316	277 aa		5.94	□□□□□ -1.46
PSH1	YOL054W	CTT1	P06115	562 aa		5.93	□□□□□ -1.46
PSH1	YOL054W	GCD1	P09032	578 aa	Predicted RBP	5.93	□□□□□ -1.46
PSH1	YOL054W	MIH1	P23748	554 aa		5.93	□□□□□ -1.46
PSH1	YOL054W	YCR051W	P25631	222 aa		5.93	□□□□□ -1.46
PSH1	YOL054W	CHS3	P29465	1165 aa		5.93	□□□□□ -1.46
PSH1	YOL054W	NIP1	P32497	812 aa	Known RBP	5.93	□□□□□ -1.46
PSH1	YOL054W	SWI3	P32591	825 aa		5.93	□□□□□ -1.46
PSH1	YOL054W	SWE1	P32944	819 aa		5.93	□□□□□ -1.46
PSH1	YOL054W	BLI1	P35727	113 aa		5.93	□□□□□ -1.46
PSH1	YOL054W	YKR051W	P36142	418 aa		5.93	□□□□□ -1.46
PSH1	YOL054W	OMA1	P36163	345 aa		5.93	□□□□□ -1.46
PSH1	YOL054W	ABZ1	P37254	787 aa	Predicted RBP	5.93	□□□□□ -1.46
PSH1	YOL054W	PPS1	P38148	807 aa		5.93	□□□□□ -1.46
PSH1	YOL054W	PFF1	P38244	976 aa		5.93	□□□□□ -1.46
PSH1	YOL054W	SIP3	P38717	1229 aa		5.93	□□□□□ -1.46
PSH1	YOL054W	PMC1	P38929	1173 aa	Predicted RBP	5.93	□□□□□ -1.46
PSH1	YOL054W	GAA1	P39012	614 aa		5.93	□□□□□ -1.46
PSH1	YOL054W	CCT2	P39076	527 aa	Known RBP	5.93	□□□□□ -1.46
PSH1	YOL054W	SAP185	P40856	1058 aa		5.93	□□□□□ -1.46
PSH1	YOL054W	NIT2	P47016	307 aa		5.93	□□□□□ -1.46
PSH1	YOL054W	DUS1	P53759	423 aa	Known RBP	5.93	□□□□□ -1.46
PSH1	YOL054W	YNL034W	P53963	612 aa		5.93	□□□□□ -1.46
PSH1	YOL054W	YNL018C	P53976	612 aa		5.93	□□□□□ -1.46
PSH1	YOL054W	RPL22B	P56628	122 aa	Known RBP	5.93	□□□□□ -1.46
PSH1	YOL054W	PTA1	Q01329	785 aa	Predicted RBP	5.93	□□□□□ -1.46
PSH1	YOL054W	DIG1	Q03063	452 aa	Known RBP	5.93	□□□□□ -1.46
PSH1	YOL054W	YMR018W	Q04364	514 aa		5.93	□□□□□ -1.46
PSH1	YOL054W	YLH47	Q06493	454 aa		5.93	□□□□□ -1.46
PSH1	YOL054W	CDA1	Q06702	301 aa		5.93	□□□□□ -1.46
PSH1	YOL054W	CSR1	Q06705	408 aa	Known RBP	5.93	□□□□□ -1.46
PSH1	YOL054W	VTS1	Q08831	523 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.93	□□□□□ -1.46	not detected
PSH1	YOL054W	HAL9	Q12180	1030 aa		5.93	□□□□□ -1.46
PSH1	YOL054W	SEC39	Q12745	709 aa		5.93	□□□□□ -1.46
PSH1	YOL054W	TOM1	Q03280	3268 aa		5.92	□□□□□ -1.46
PSH1	YOL054W	CYC7	P00045	113 aa		5.92	□□□□□ -1.46
PSH1	YOL054W	ADH4	P10127	382 aa		5.92	□□□□□ -1.46
PSH1	YOL054W	SST2	P11972	698 aa	Known RBP	5.92	□□□□□ -1.46
PSH1	YOL054W	CAF20	P12962	161 aa	Known RBP	5.92	□□□□□ -1.46
PSH1	YOL054W	CMP2	P14747	604 aa		5.92	□□□□□ -1.46
PSH1	YOL054W	ILV6	P25605	309 aa	Known RBP	5.92	□□□□□ -1.46
PSH1	YOL054W	YME1	P32795	747 aa		5.92	□□□□□ -1.46
PSH1	YOL054W	RAD5	P32849	1169 aa	Predicted RBP	5.92	□□□□□ -1.46
PSH1	YOL054W	HEL1	P36113	551 aa		5.92	□□□□□ -1.46
PSH1	YOL054W	MMS21	P38632	267 aa		5.92	□□□□□ -1.46
PSH1	YOL054W	VPS45	P38932	577 aa		5.92	□□□□□ -1.46
PSH1	YOL054W	SAK1	P38990	1142 aa		5.92	□□□□□ -1.46
PSH1	YOL054W	GPP2	P40106	250 aa	Known RBP	5.92	□□□□□ -1.46
PSH1	YOL054W	IRC24	P40580	263 aa		5.92	□□□□□ -1.46
PSH1	YOL054W	BNA2	P47125	453 aa		5.92	□□□□□ -1.46
PSH1	YOL054W	COS5	P47187	383 aa		5.92	□□□□□ -1.46
PSH1	YOL054W	NBP1	P52919	319 aa	Predicted RBP	5.92	□□□□□ -1.46
PSH1	YOL054W	LSB1	P53281	241 aa		5.92	□□□□□ -1.46
PSH1	YOL054W	ECM9	Q02202	377 aa		5.92	□□□□□ -1.46
PSH1	YOL054W	ADA2	Q02336	434 aa		5.92	□□□□□ -1.46
PSH1	YOL054W	ERO1	Q03103	563 aa		5.92	□□□□□ -1.46
PSH1	YOL054W	GIR2	Q03768	265 aa	Predicted RBP	5.92	□□□□□ -1.46
PSH1	YOL054W	YHM2	Q04013	314 aa		5.92	□□□□□ -1.46
PSH1	YOL054W	YLR297W	Q05899	129 aa		5.92	□□□□□ -1.46
PSH1	YOL054W	PIG1	Q06216	648 aa		5.92	□□□□□ -1.46
PSH1	YOL054W	ACK1	Q07622	623 aa	Predicted RBP	5.92	□□□□□ -1.46
PSH1	YOL054W	PCL8	Q08966	492 aa		5.92	□□□□□ -1.46
PSH1	YOL054W	THI21	Q08975	551 aa		5.92	□□□□□ -1.46
PSH1	YOL054W	NCA2	Q12374	616 aa		5.92	□□□□□ -1.46
PSH1	YOL054W	PEP5	P12868	1029 aa		5.91	□□□□□ -1.46
PSH1	YOL054W	PFK1	P16861	987 aa	Known RBP	5.91	□□□□□ -1.46
PSH1	YOL054W	ARG1	P22768	420 aa		5.91	□□□□□ -1.46
PSH1	YOL054W	PWP2	P25635	923 aa	Known RBP	5.91	□□□□□ -1.46
PSH1	YOL054W	ATG19	P35193	415 aa		5.91	□□□□□ -1.46
PSH1	YOL054W	YKR018C	P36114	725 aa		5.91	□□□□□ -1.46
PSH1	YOL054W	FLR1	P38124	548 aa		5.91	□□□□□ -1.46
PSH1	YOL054W	SIC1	P38634	284 aa		5.91	□□□□□ -1.46
PSH1	YOL054W	EMP65	P40085	556 aa		5.91	□□□□□ -1.46
PSH1	YOL054W	SMX2	P40204	77 aa	Known RBP	5.91	□□□□□ -1.46
PSH1	YOL054W	ILM1	P47155	203 aa		5.91	□□□□□ -1.46
PSH1	YOL054W	ZIP2	P53061	704 aa		5.91	□□□□□ -1.46
PSH1	YOL054W	TAN1	P53072	289 aa	Predicted RBP	5.91	□□□□□ -1.46
PSH1	YOL054W	SPC105	P53148	917 aa		5.91	□□□□□ -1.46
PSH1	YOL054W	ESBP6	P53918	673 aa		5.91	□□□□□ -1.46
PSH1	YOL054W	PRP3	Q03338	469 aa	Predicted RBP	5.91	□□□□□ -1.46
PSH1	YOL054W	USA1	Q03714	838 aa		5.91	□□□□□ -1.46
PSH1	YOL054W	SPC24	Q04477	213 aa		5.91	□□□□□ -1.46
PSH1	YOL054W	AIM33	Q04516	312 aa		5.91	□□□□□ -1.46
PSH1	YOL054W	SSL1	Q04673	461 aa	Predicted RBP	5.91	□□□□□ -1.46
PSH1	YOL054W	PHM6	Q05637	104 aa		5.91	□□□□□ -1.46
PSH1	YOL054W	YDL057W	Q07379	328 aa		5.91	□□□□□ -1.46
PSH1	YOL054W	YOR352W	Q08816	343 aa		5.91	□□□□□ -1.46
PSH1	YOL054W	AIM41	Q12032	185 aa		5.91	□□□□□ -1.46
PSH1	YOL054W	YPR027C	Q12079	277 aa		5.91	□□□□□ -1.46
PSH1	YOL054W	HIF1	Q12373	385 aa		5.91	□□□□□ -1.46
PSH1	YOL054W	SEY1	Q99287	776 aa		5.91	□□□□□ -1.46
PSH1	YOL054W	YLR462W	O13556	202 aa		5.9	□□□□□ -1.46

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