RNA–Protein interactions for RNA: YNL171C

YNL171C, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene YNL171C, Length 369 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YNL171C	YNL171C	WAR1	Q03631	944 aa		4.66	□□□□□ -1.66
YNL171C	YNL171C	EIS1	Q05050	843 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
YNL171C	YNL171C	AIM6	Q07716	390 aa		4.66	□□□□□ -1.66
YNL171C	YNL171C	MRN1	Q08925	612 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.66	□□□□□ -1.66	not detected
YNL171C	YNL171C	ICL2	Q12031	575 aa		4.66	□□□□□ -1.66
YNL171C	YNL171C	RPL7A	P05737	244 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
YNL171C	YNL171C	ADE3	P07245	946 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
YNL171C	YNL171C	PMA2	P19657	947 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YNL171C	YNL171C	MSM1	P22438	575 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YNL171C	YNL171C	PWP2	P25635	923 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
YNL171C	YNL171C	VPS24	P36095	224 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
YNL171C	YNL171C	MTG2	P38860	518 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YNL171C	YNL171C	ESF2	P53743	316 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
YNL171C	YNL171C	RPL7B	Q12213	244 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
YNL171C	YNL171C	YER175W-A	Q8TGU4	54 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YNL171C	YNL171C	YMR084W	A2P2R3	262 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YNL171C	YNL171C	HEM1	P09950	548 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
YNL171C	YNL171C	CLB4	P24871	460 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YNL171C	YNL171C	SWI4	P25302	1093 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
YNL171C	YNL171C	DBF20	P32328	564 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YNL171C	YNL171C	MRS6	P32864	603 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
YNL171C	YNL171C	PUG1	P40100	303 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YNL171C	YNL171C	RPT2	P40327	437 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
YNL171C	YNL171C	YFL015C	P43578	164 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YNL171C	YNL171C	YPL108W	Q02872	168 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
YNL171C	YNL171C	AHA1	Q12449	350 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
YNL171C	YNL171C	LEU2	P04173	364 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
YNL171C	YNL171C	PTP1	P25044	335 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YNL171C	YNL171C	SWC3	P31376	625 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YNL171C	YNL171C	ARO9	P38840	513 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
YNL171C	YNL171C	MAM1	P40065	302 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YNL171C	YNL171C	LAS21	P40367	830 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YNL171C	YNL171C	OPT1	P40897	799 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YNL171C	YNL171C	UBP16	Q02863	499 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YNL171C	YNL171C	BLS1	Q06071	122 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YNL171C	YNL171C	GDA1	P32621	518 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YNL171C	YNL171C	RPC34	P32910	317 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YNL171C	YNL171C	XBP1	P40489	647 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YNL171C	YNL171C	SCS3	P53012	380 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YNL171C	YNL171C	COG2	P53271	262 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YNL171C	YNL171C	YNL092W	P53934	400 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YNL171C	YNL171C	YML119W	Q03208	357 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YNL171C	YNL171C	PCL8	Q08966	492 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YNL171C	YNL171C	SEC3	P33332	1336 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
YNL171C	YNL171C	PGK1	P00560	416 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
YNL171C	YNL171C	CHO2	P05374	869 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
YNL171C	YNL171C	NUC1	P08466	329 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YNL171C	YNL171C	NUP1	P20676	1076 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YNL171C	YNL171C	AMD2	P22580	549 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YNL171C	YNL171C	ARP2	P32381	391 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
YNL171C	YNL171C	FUI1	P38196	639 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YNL171C	YNL171C	EXO1	P39875	702 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YNL171C	YNL171C	IES5	P40060	125 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YNL171C	YNL171C	PSF2	P40359	213 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YNL171C	YNL171C	SAP185	P40856	1058 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YNL171C	YNL171C	SKP2	P42843	763 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YNL171C	YNL171C	NET1	P47035	1189 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YNL171C	YNL171C	YJL043W	P47053	257 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YNL171C	YNL171C	IMA1	P53051	589 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YNL171C	YNL171C	YGR021W	P53212	290 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YNL171C	YNL171C	RGT2	Q12300	763 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YNL171C	YNL171C	AI5_ALPHA	Q9ZZX1	630 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YNL171C	YNL171C	PET122	P10355	254 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YNL171C	YNL171C	NCP1	P16603	691 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
YNL171C	YNL171C	PDE1	P22434	369 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YNL171C	YNL171C	GCD7	P32502	381 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
YNL171C	YNL171C	SIP1	P32578	815 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YNL171C	YNL171C	MRPL36	P36531	177 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YNL171C	YNL171C	YBR138C	P38277	524 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YNL171C	YNL171C	FSH1	P38777	243 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
YNL171C	YNL171C	RAD26	P40352	1085 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YNL171C	YNL171C	ERR3	P42222	437 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YNL171C	YNL171C	AAT1	Q01802	451 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YNL171C	YNL171C	MRPL13	Q02204	264 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YNL171C	YNL171C	TRS130	Q03660	1102 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YNL171C	YNL171C	CIA1	Q05583	330 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YNL171C	YNL171C	YDL242W	Q07746	117 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YNL171C	YNL171C	PSR2	Q07949	397 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YNL171C	YNL171C	AQY1	P0CD91	305 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YNL171C	YNL171C	BIK1	P11709	440 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YNL171C	YNL171C	KGD2	P19262	463 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
YNL171C	YNL171C	LTP1	P40347	161 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YNL171C	YNL171C	TDA10	P42938	290 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YNL171C	YNL171C	TAX4	P47030	604 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YNL171C	YNL171C	RAD33	Q04231	177 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YNL171C	YNL171C	YML053C	Q04978	212 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YNL171C	YNL171C	SUL2	Q12325	893 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YNL171C	YNL171C	YCL049C	P25577	312 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YNL171C	YNL171C	RPF2	P36160	344 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
YNL171C	YNL171C	VPS8	P39702	1274 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YNL171C	YNL171C	SMK1	P41808	388 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YNL171C	YNL171C	BST1	P43571	1029 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YNL171C	YNL171C	ZAP1	P47043	880 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YNL171C	YNL171C	ARC35	P53731	342 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
YNL171C	YNL171C	PLM2	Q04383	521 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YNL171C	YNL171C	LCB4	Q12246	624 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YNL171C	YNL171C	RVB2	Q12464	471 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
YNL171C	YNL171C	YBR255C-A	Q3E776	120 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YNL171C	YNL171C	PNO1	Q99216	274 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
YNL171C	YNL171C	SSM4	P40318	1319 aa		4.57	□□□□□ -1.68

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 24.9 ms