RNA–Protein interactions for RNA: YMR138W

CIN4, Transcript of GTP-binding protein involved in beta-tubulin (Tub2p) folding, yeast

Gene CIN4, Length 576 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CIN4	YMR138W	YSH1	Q06224	779 aa	Predicted RBP	6.07	□□□□□ -1.44
CIN4	YMR138W	CDC73	Q06697	393 aa		6.07	□□□□□ -1.44
CIN4	YMR138W	SWC7	Q06707	132 aa		6.07	□□□□□ -1.44
CIN4	YMR138W	AAD15	Q08361	143 aa		6.07	□□□□□ -1.44
CIN4	YMR138W	APL5	Q08951	932 aa	Known RBP	6.07	□□□□□ -1.44
CIN4	YMR138W	OCA6	Q12454	224 aa		6.07	□□□□□ -1.44
CIN4	YMR138W	AFI1	Q99222	893 aa		6.07	□□□□□ -1.44
CIN4	YMR138W	SEY1	Q99287	776 aa		6.07	□□□□□ -1.44
CIN4	YMR138W	AI5_ALPHA	Q9ZZX1	630 aa		6.07	□□□□□ -1.44
CIN4	YMR138W	QCR6	P00127	147 aa		6.06	□□□□□ -1.44
CIN4	YMR138W	PYC1	P11154	1178 aa	Known RBP	6.06	□□□□□ -1.44
CIN4	YMR138W	HEM15	P16622	393 aa		6.06	□□□□□ -1.44
CIN4	YMR138W	MRM1	P25270	412 aa		6.06	□□□□□ -1.44
CIN4	YMR138W	SGF29	P25554	259 aa		6.06	□□□□□ -1.44
CIN4	YMR138W	LAS1	P36146	502 aa	Predicted RBP	6.06	□□□□□ -1.44
CIN4	YMR138W	URA8	P38627	578 aa	Predicted RBP	6.06	□□□□□ -1.44
CIN4	YMR138W	MSR1	P38714	643 aa		6.06	□□□□□ -1.44
CIN4	YMR138W	YHL041W	P38730	149 aa		6.06	□□□□□ -1.44
CIN4	YMR138W	OTU2	P38747	307 aa	Known RBP	6.06	□□□□□ -1.44
CIN4	YMR138W	IST3	P40565	148 aa	Predicted RBP	6.06	□□□□□ -1.44
CIN4	YMR138W	EMW1	P42842	904 aa	Known RBP	6.06	□□□□□ -1.44
CIN4	YMR138W	BUD13	P46947	266 aa	Predicted RBP	6.06	□□□□□ -1.44
CIN4	YMR138W	YJR039W	P47107	1121 aa		6.06	□□□□□ -1.44
CIN4	YMR138W	RSM26	P47141	266 aa		6.06	□□□□□ -1.44
CIN4	YMR138W	STR3	P53101	465 aa	Known RBP	6.06	□□□□□ -1.44
CIN4	YMR138W	YGR127W	P53275	312 aa		6.06	□□□□□ -1.44
CIN4	YMR138W	IMP4	P53941	290 aa	Known RBP	6.06	□□□□□ -1.44
CIN4	YMR138W	INA17	Q02888	182 aa		6.06	□□□□□ -1.44
CIN4	YMR138W	MSH6	Q03834	1242 aa		6.06	□□□□□ -1.44
CIN4	YMR138W	ARP9	Q05123	467 aa		6.06	□□□□□ -1.44
CIN4	YMR138W	YLR046C	Q12253	270 aa		6.06	□□□□□ -1.44
CIN4	YMR138W	COX5A	P00424	153 aa		6.05	□□□□□ -1.44
CIN4	YMR138W	ERR1	P0CX10	437 aa		6.05	□□□□□ -1.44
CIN4	YMR138W	ERR2	P0CX11	437 aa		6.05	□□□□□ -1.44
CIN4	YMR138W	CBF1	P17106	351 aa		6.05	□□□□□ -1.44
CIN4	YMR138W	MRPL32	P25348	183 aa		6.05	□□□□□ -1.44
CIN4	YMR138W	GEX1	P25596	615 aa		6.05	□□□□□ -1.44
CIN4	YMR138W	TPS2	P31688	896 aa	Known RBP	6.05	□□□□□ -1.44
CIN4	YMR138W	SMI1	P32566	505 aa		6.05	□□□□□ -1.44
CIN4	YMR138W	NFU1	P32860	256 aa		6.05	□□□□□ -1.44
CIN4	YMR138W	GEX2	P36173	615 aa		6.05	□□□□□ -1.44
CIN4	YMR138W	MRPL40	P36534	297 aa		6.05	□□□□□ -1.44
CIN4	YMR138W	PBP2	P38151	413 aa	Known RBP RIP-Chip data	6.05	□□□□□ -1.44	not detected
CIN4	YMR138W	OLA1	P38219	394 aa	Known RBP	6.05	□□□□□ -1.44
CIN4	YMR138W	SRP68	P38687	599 aa	Known RBP	6.05	□□□□□ -1.44
CIN4	YMR138W	SCC4	P40090	624 aa		6.05	□□□□□ -1.44
CIN4	YMR138W	OSW5	P40219	148 aa		6.05	□□□□□ -1.44
CIN4	YMR138W	DPH1	P40487	425 aa	Known RBP	6.05	□□□□□ -1.44
CIN4	YMR138W	YIR007W	P40566	764 aa		6.05	□□□□□ -1.44
CIN4	YMR138W	ERR3	P42222	437 aa		6.05	□□□□□ -1.44
CIN4	YMR138W	CNN1	P43618	361 aa		6.05	□□□□□ -1.44
CIN4	YMR138W	TAH11	P47112	604 aa		6.05	□□□□□ -1.44
CIN4	YMR138W	RTA1	P53047	317 aa		6.05	□□□□□ -1.44
CIN4	YMR138W	PCL10	P53124	433 aa		6.05	□□□□□ -1.44
CIN4	YMR138W	ART5	P53244	586 aa	Known RBP	6.05	□□□□□ -1.44
CIN4	YMR138W	YTP1	P53584	459 aa		6.05	□□□□□ -1.44
CIN4	YMR138W	YNR063W	P53749	607 aa		6.05	□□□□□ -1.44
CIN4	YMR138W	SLT2	Q00772	484 aa		6.05	□□□□□ -1.44
CIN4	YMR138W	RRB1	Q04225	511 aa	Known RBP	6.05	□□□□□ -1.44
CIN4	YMR138W	YCS4	Q06156	1176 aa		6.05	□□□□□ -1.44
CIN4	YMR138W	YPR084W	Q06821	456 aa		6.05	□□□□□ -1.44
CIN4	YMR138W	CMS1	Q07897	291 aa	Known RBP	6.05	□□□□□ -1.44
CIN4	YMR138W	ARF2	P19146	181 aa	Known RBP	6.04	□□□□□ -1.44
CIN4	YMR138W	ACO1	P19414	778 aa	Known RBP RIP-Chip data	6.04	□□□□□ -1.44	not detected
CIN4	YMR138W	MRPL8	P22353	238 aa		6.04	□□□□□ -1.44
CIN4	YMR138W	MIH1	P23748	554 aa		6.04	□□□□□ -1.44
CIN4	YMR138W	HEM12	P32347	362 aa	Predicted RBP	6.04	□□□□□ -1.44
CIN4	YMR138W	UTR2	P32623	467 aa		6.04	□□□□□ -1.44
CIN4	YMR138W	YME1	P32795	747 aa		6.04	□□□□□ -1.44
CIN4	YMR138W	ADD66	P36040	267 aa		6.04	□□□□□ -1.44
CIN4	YMR138W	AIM23	P47015	356 aa		6.04	□□□□□ -1.44
CIN4	YMR138W	AMA1	P50082	593 aa		6.04	□□□□□ -1.44
CIN4	YMR138W	PYK2	P52489	506 aa	Known RBP	6.04	□□□□□ -1.44
CIN4	YMR138W	VEL1	P53058	206 aa		6.04	□□□□□ -1.44
CIN4	YMR138W	YNR065C	P53751	1116 aa		6.04	□□□□□ -1.44
CIN4	YMR138W	PRM1	P53835	661 aa		6.04	□□□□□ -1.44
CIN4	YMR138W	TDA7	P53882	636 aa	Predicted RBP	6.04	□□□□□ -1.44
CIN4	YMR138W	TEP1	P53916	434 aa		6.04	□□□□□ -1.44
CIN4	YMR138W	ORC3	P54790	616 aa		6.04	□□□□□ -1.44
CIN4	YMR138W	CUE5	Q08412	411 aa	Known RBP	6.04	□□□□□ -1.44
CIN4	YMR138W	TRE2	Q08693	809 aa		6.04	□□□□□ -1.44
CIN4	YMR138W	PGC1	Q08959	321 aa		6.04	□□□□□ -1.44
CIN4	YMR138W	ACM1	Q08981	209 aa		6.04	□□□□□ -1.44
CIN4	YMR138W	PER33	Q12144	273 aa		6.04	□□□□□ -1.44
CIN4	YMR138W	HOS1	Q12214	470 aa		6.04	□□□□□ -1.44
CIN4	YMR138W	SFI1	Q12369	946 aa		6.04	□□□□□ -1.44
CIN4	YMR138W	PEX11	Q12462	236 aa		6.04	□□□□□ -1.44
CIN4	YMR138W	ADH4	P10127	382 aa		6.03	□□□□□ -1.44
CIN4	YMR138W	INO1	P11986	533 aa		6.03	□□□□□ -1.44
CIN4	YMR138W	SPO16	P17122	198 aa		6.03	□□□□□ -1.44
CIN4	YMR138W	DAL81	P21657	970 aa		6.03	□□□□□ -1.44
CIN4	YMR138W	MGT1	P26188	188 aa		6.03	□□□□□ -1.44
CIN4	YMR138W	CDC20	P26309	610 aa		6.03	□□□□□ -1.44
CIN4	YMR138W	PYC2	P32327	1180 aa	Known RBP	6.03	□□□□□ -1.44
CIN4	YMR138W	ALY1	P36117	915 aa		6.03	□□□□□ -1.44
CIN4	YMR138W	SPP381	P38282	291 aa	Predicted RBP	6.03	□□□□□ -1.44
CIN4	YMR138W	UBP7	P40453	1071 aa		6.03	□□□□□ -1.44
CIN4	YMR138W	INA22	P40576	216 aa		6.03	□□□□□ -1.44
CIN4	YMR138W	MIC19	P43594	170 aa		6.03	□□□□□ -1.44
CIN4	YMR138W	ROK1	P45818	564 aa	Predicted RBP	6.03	□□□□□ -1.44

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