RNA–Protein interactions for RNA: YMR088C

VBA1, Transcript of Permease of basic amino acids in the vacuolar membrane, yeast

Gene VBA1, Length 1,689 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VBA1	YMR088C	ASE1	P50275	885 aa		5.62	□□□□□ -1.51
VBA1	YMR088C	MNT4	P53745	580 aa		5.62	□□□□□ -1.51
VBA1	YMR088C	ORC4	P54791	529 aa		5.62	□□□□□ -1.51
VBA1	YMR088C	MAK10	Q02197	733 aa		5.62	□□□□□ -1.51
VBA1	YMR088C	NUT2	Q06213	157 aa		5.62	□□□□□ -1.51
VBA1	YMR088C	DIN7	Q12086	430 aa		5.62	□□□□□ -1.51
VBA1	YMR088C	SRF1	Q12516	437 aa		5.62	□□□□□ -1.51
VBA1	YMR088C	FRT1	Q99332	602 aa		5.62	□□□□□ -1.51
VBA1	YMR088C	IQG1	Q12280	1495 aa		5.61	□□□□□ -1.51
VBA1	YMR088C	YLR358C	O13565	187 aa		5.61	□□□□□ -1.51
VBA1	YMR088C	TDH1	P00360	332 aa	Known RBP	5.61	□□□□□ -1.51
VBA1	YMR088C	SST2	P11972	698 aa	Known RBP	5.61	□□□□□ -1.51
VBA1	YMR088C	PMR1	P13586	950 aa		5.61	□□□□□ -1.51
VBA1	YMR088C	FUR1	P18562	216 aa	Known RBP	5.61	□□□□□ -1.51
VBA1	YMR088C	MRPL33	P20084	86 aa		5.61	□□□□□ -1.51
VBA1	YMR088C	SEC62	P21825	274 aa		5.61	□□□□□ -1.51
VBA1	YMR088C	BUD23	P25627	275 aa	Predicted RBP	5.61	□□□□□ -1.51
VBA1	YMR088C	PTP2	P29461	750 aa		5.61	□□□□□ -1.51
VBA1	YMR088C	SIN4	P32259	974 aa		5.61	□□□□□ -1.51
VBA1	YMR088C	TDA11	P38854	504 aa		5.61	□□□□□ -1.51
VBA1	YMR088C	MTG2	P38860	518 aa		5.61	□□□□□ -1.51
VBA1	YMR088C	CCC2	P38995	1004 aa		5.61	□□□□□ -1.51
VBA1	YMR088C	GIM4	P40005	111 aa	Known RBP	5.61	□□□□□ -1.51
VBA1	YMR088C	GVP36	P40531	326 aa	Known RBP	5.61	□□□□□ -1.51
VBA1	YMR088C	POL31	P46957	487 aa		5.61	□□□□□ -1.51
VBA1	YMR088C	THI11	P47183	340 aa		5.61	□□□□□ -1.51
VBA1	YMR088C	YGL082W	P53155	381 aa		5.61	□□□□□ -1.51
VBA1	YMR088C	PIB2	P53191	635 aa		5.61	□□□□□ -1.51
VBA1	YMR088C	YGR111W	P53265	400 aa		5.61	□□□□□ -1.51
VBA1	YMR088C	YNL165W	P53891	406 aa		5.61	□□□□□ -1.51
VBA1	YMR088C	HDA1	P53973	706 aa		5.61	□□□□□ -1.51
VBA1	YMR088C	KTR6	P54070	446 aa		5.61	□□□□□ -1.51
VBA1	YMR088C	RSM24	Q03976	319 aa		5.61	□□□□□ -1.51
VBA1	YMR088C	YDR514C	Q04408	483 aa		5.61	□□□□□ -1.51
VBA1	YMR088C	ECM38	Q05902	660 aa	Predicted RBP	5.61	□□□□□ -1.51
VBA1	YMR088C	YLR455W	Q06188	304 aa		5.61	□□□□□ -1.51
VBA1	YMR088C	RRT8	Q08219	342 aa		5.61	□□□□□ -1.51
VBA1	YMR088C	DDC1	Q08949	612 aa		5.61	□□□□□ -1.51
VBA1	YMR088C	WRS1	Q12109	432 aa	Known RBP	5.61	□□□□□ -1.51
VBA1	YMR088C	SNU23	Q12368	194 aa	Predicted RBP	5.61	□□□□□ -1.51
VBA1	YMR088C	SCC2	Q04002	1493 aa		5.61	□□□□□ -1.51
VBA1	YMR088C	AUS1	Q08409	1394 aa		5.6	□□□□□ -1.51
VBA1	YMR088C	MRP7	P12687	371 aa		5.6	□□□□□ -1.51
VBA1	YMR088C	GCN3	P14741	305 aa		5.6	□□□□□ -1.51
VBA1	YMR088C	UTR1	P21373	530 aa		5.6	□□□□□ -1.51
VBA1	YMR088C	RPB10	P22139	70 aa		5.6	□□□□□ -1.51
VBA1	YMR088C	RAD57	P25301	460 aa		5.6	□□□□□ -1.51
VBA1	YMR088C	SEC1	P30619	724 aa	Known RBP	5.6	□□□□□ -1.51
VBA1	YMR088C	FUN30	P31380	1131 aa		5.6	□□□□□ -1.51
VBA1	YMR088C	HXT3	P32466	567 aa	Known RBP	5.6	□□□□□ -1.51
VBA1	YMR088C	LOT5	P34234	306 aa		5.6	□□□□□ -1.51
VBA1	YMR088C	RIM4	P38741	713 aa		5.6	□□□□□ -1.51
VBA1	YMR088C	FRT2	P39734	528 aa		5.6	□□□□□ -1.51
VBA1	YMR088C	SLM1	P40485	686 aa		5.6	□□□□□ -1.51
VBA1	YMR088C	QRI1	P43123	477 aa	Known RBP	5.6	□□□□□ -1.51
VBA1	YMR088C	LSM1	P47017	172 aa	Known RBP	5.6	□□□□□ -1.51
VBA1	YMR088C	YJR054W	P47114	497 aa		5.6	□□□□□ -1.51
VBA1	YMR088C	IMD3	P50095	523 aa	Known RBP	5.6	□□□□□ -1.51
VBA1	YMR088C	PIP2	P52960	996 aa		5.6	□□□□□ -1.51
VBA1	YMR088C	GUP1	P53154	560 aa		5.6	□□□□□ -1.51
VBA1	YMR088C	RBG2	P53295	368 aa	Known RBP	5.6	□□□□□ -1.51
VBA1	YMR088C	TGL2	P54857	326 aa		5.6	□□□□□ -1.51
VBA1	YMR088C	PRO2	P54885	456 aa	Known RBP	5.6	□□□□□ -1.51
VBA1	YMR088C	KAP95	Q06142	861 aa	Known RBP	5.6	□□□□□ -1.51
VBA1	YMR088C	SSP2	Q08646	371 aa		5.6	□□□□□ -1.51
VBA1	YMR088C	KEL3	Q08979	651 aa	Predicted RBP	5.6	□□□□□ -1.51
VBA1	YMR088C	FAL1	Q12099	399 aa	Known RBP	5.6	□□□□□ -1.51
VBA1	YMR088C	ATG9	Q12142	997 aa		5.6	□□□□□ -1.51
VBA1	YMR088C	SKM1	Q12469	655 aa		5.6	□□□□□ -1.51
VBA1	YMR088C	RAD61	Q99359	647 aa		5.6	□□□□□ -1.51
VBA1	YMR088C	Q0182	Q9ZZW1	134 aa		5.6	□□□□□ -1.51
VBA1	YMR088C	SPT6	P23615	1451 aa	Known RBP	5.6	□□□□□ -1.51
VBA1	YMR088C	ADE6	P38972	1358 aa	Known RBP	5.6	□□□□□ -1.51
VBA1	YMR088C	CAR2	P07991	424 aa	Known RBP	5.59	□□□□□ -1.51
VBA1	YMR088C	KIN2	P13186	1147 aa	Known RBP	5.59	□□□□□ -1.51
VBA1	YMR088C	YAK1	P14680	807 aa		5.59	□□□□□ -1.51
VBA1	YMR088C	MSN4	P33749	630 aa		5.59	□□□□□ -1.51
VBA1	YMR088C	DHR2	P36009	735 aa	Predicted RBP	5.59	□□□□□ -1.51
VBA1	YMR088C	YKL133C	P36066	463 aa		5.59	□□□□□ -1.51
VBA1	YMR088C	MMS4	P38257	691 aa		5.59	□□□□□ -1.51
VBA1	YMR088C	GND1	P38720	489 aa	Known RBP	5.59	□□□□□ -1.51
VBA1	YMR088C	HPM1	P40481	377 aa		5.59	□□□□□ -1.51
VBA1	YMR088C	ELP2	P42935	788 aa		5.59	□□□□□ -1.51
VBA1	YMR088C	YFH7	P43591	353 aa		5.59	□□□□□ -1.51
VBA1	YMR088C	DLD2	P46681	530 aa	Known RBP	5.59	□□□□□ -1.51
VBA1	YMR088C	TMA22	P47089	198 aa	Predicted RBP	5.59	□□□□□ -1.51
VBA1	YMR088C	VPS9	P54787	451 aa		5.59	□□□□□ -1.51
VBA1	YMR088C	ARP4	P80428	489 aa		5.59	□□□□□ -1.51
VBA1	YMR088C	TIM50	Q02776	476 aa		5.59	□□□□□ -1.51
VBA1	YMR088C	PDS5	Q04264	1277 aa		5.59	□□□□□ -1.51
VBA1	YMR088C	GIM5	Q04493	163 aa		5.59	□□□□□ -1.51
VBA1	YMR088C	PPM2	Q08282	695 aa		5.59	□□□□□ -1.51
VBA1	YMR088C	PSF3	Q12146	194 aa		5.59	□□□□□ -1.51
VBA1	YMR088C	TY3A-G	Q12173	290 aa		5.59	□□□□□ -1.51
VBA1	YMR088C	TY3A-I	Q99219	290 aa		5.59	□□□□□ -1.51
VBA1	YMR088C	NUP170	P38181	1502 aa		5.59	□□□□□ -1.51
VBA1	YMR088C	MET5	P47169	1442 aa		5.59	□□□□□ -1.51
VBA1	YMR088C	CPA2	P03965	1118 aa	Known RBP	5.59	□□□□□ -1.52
VBA1	YMR088C	YMR085W	P0CF18	432 aa		5.59	□□□□□ -1.52
VBA1	YMR088C	GPA2	P10823	449 aa		5.59	□□□□□ -1.52

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 16.8 ms