RNA–Protein interactions for RNA: YKL050C

YKL050C, Transcript of Protein of unknown function, yeastyeast

Gene YKL050C, Length 2,769 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YKL050CYKL050C ALY2P47029 1046 aa3.87□□□□□ -1.79
YKL050CYKL050C CUL3P53202 744 aa3.87□□□□□ -1.79
YKL050CYKL050C TOF2Q02208 771 aa3.87□□□□□ -1.79
YKL050CYKL050C CUS1Q02554 436 aaPredicted RBP3.87□□□□□ -1.79
YKL050CYKL050C SNZ1Q03148 297 aa3.87□□□□□ -1.79
YKL050CYKL050C RKM2Q03942 479 aa3.87□□□□□ -1.79
YKL050CYKL050C ADE13Q05911 482 aaKnown RBP3.87□□□□□ -1.79
YKL050CYKL050C CTI6Q08923 506 aa3.87□□□□□ -1.79
YKL050CYKL050C HER1Q12276 1246 aa3.87□□□□□ -1.79
YKL050CYKL050C ADF1Q2V2Q1 113 aa3.87□□□□□ -1.79
YKL050CYKL050C RPL19AP0CX82 189 aaKnown RBP3.87□□□□□ -1.79
YKL050CYKL050C RPL19BP0CX83 189 aaPredicted RBP3.87□□□□□ -1.79
YKL050CYKL050C APE1P14904 514 aa3.87□□□□□ -1.79
YKL050CYKL050C STE13P33894 931 aa3.87□□□□□ -1.79
YKL050CYKL050C YKT6P36015 200 aaKnown RBP3.87□□□□□ -1.79
YKL050CYKL050C STT3P39007 718 aaKnown RBP3.87□□□□□ -1.79
YKL050CYKL050C ALD5P40047 520 aaKnown RBP3.87□□□□□ -1.79
YKL050CYKL050C YJR061WP40355 935 aa3.87□□□□□ -1.79
YKL050CYKL050C AAD14P42884 376 aa3.87□□□□□ -1.79
YKL050CYKL050C LIA1P47120 325 aaKnown RBP3.87□□□□□ -1.79
YKL050CYKL050C SHE4P51534 789 aa3.87□□□□□ -1.79
YKL050CYKL050C MTD1Q02046 320 aaKnown RBP3.87□□□□□ -1.79
YKL050CYKL050C LUC7Q07508 261 aaPredicted RBP3.87□□□□□ -1.79
YKL050CYKL050C NOP6Q07623 225 aaKnown RBP3.87□□□□□ -1.79
YKL050CYKL050C YOR019WQ99248 730 aa3.87□□□□□ -1.79
YKL050CYKL050C TOR1P35169 2470 aa3.87□□□□□ -1.79
YKL050CYKL050C RPO41P13433 1351 aaKnown RBP3.86□□□□□ -1.79
YKL050CYKL050C AMS1P22855 1083 aa3.86□□□□□ -1.79
YKL050CYKL050C CLB3P24870 427 aa3.86□□□□□ -1.79
YKL050CYKL050C CDC12P32468 407 aaKnown RBP3.86□□□□□ -1.79
YKL050CYKL050C DPH5P32469 300 aaPredicted RBP3.86□□□□□ -1.79
YKL050CYKL050C WHI3P34761 661 aaKnown RBP3.86□□□□□ -1.79
YKL050CYKL050C MRPL40P36534 297 aa3.86□□□□□ -1.79
YKL050CYKL050C ARL1P38116 183 aaKnown RBP3.86□□□□□ -1.79
YKL050CYKL050C PFF1P38244 976 aa3.86□□□□□ -1.79
YKL050CYKL050C PNT1P38969 423 aa3.86□□□□□ -1.79
YKL050CYKL050C FUN12P39730 1002 aaKnown RBP3.86□□□□□ -1.79
YKL050CYKL050C AIM20P40451 204 aa3.86□□□□□ -1.79
YKL050CYKL050C MET12P46151 657 aa3.86□□□□□ -1.79
YKL050CYKL050C GYP7P48365 746 aa3.86□□□□□ -1.79
YKL050CYKL050C MRX6P48564 524 aa3.86□□□□□ -1.79
YKL050CYKL050C ADE16P54113 591 aaKnown RBP3.86□□□□□ -1.79
YKL050CYKL050C GTB1Q04924 702 aa3.86□□□□□ -1.79
YKL050CYKL050C DON1Q05610 365 aa3.86□□□□□ -1.79
YKL050CYKL050C YLR456WQ06199 204 aa3.86□□□□□ -1.79
YKL050CYKL050C IWR1Q07532 353 aaPredicted RBP3.86□□□□□ -1.79
YKL050CYKL050C RCN2Q12044 265 aa3.86□□□□□ -1.79
YKL050CYKL050C YBR126W-AQ8TGU7 68 aa3.86□□□□□ -1.79
YKL050CYKL050C SIR4P11978 1358 aa3.86□□□□□ -1.79
YKL050CYKL050C SWI6P09959 803 aa3.86□□□□□ -1.79
YKL050CYKL050C VPS3P23643 1011 aa3.86□□□□□ -1.79
YKL050CYKL050C DBP2P24783 546 aaKnown RBP3.86□□□□□ -1.79
YKL050CYKL050C YJU2P28320 278 aaPredicted RBP3.86□□□□□ -1.79
YKL050CYKL050C CYS3P31373 394 aaKnown RBP3.86□□□□□ -1.79
YKL050CYKL050C VRP1P37370 817 aa3.86□□□□□ -1.79
YKL050CYKL050C COS111P38308 924 aa3.86□□□□□ -1.79
YKL050CYKL050C SSP120P39931 234 aaKnown RBP3.86□□□□□ -1.79
YKL050CYKL050C AIM10P39965 576 aaKnown RBP3.86□□□□□ -1.79
YKL050CYKL050C YJL070CP40361 888 aa3.86□□□□□ -1.79
YKL050CYKL050C FET5P43561 622 aa3.86□□□□□ -1.79
YKL050CYKL050C ARC1P46672 376 aaKnown RBP3.86□□□□□ -1.79
YKL050CYKL050C STU2P46675 888 aa3.86□□□□□ -1.79
YKL050CYKL050C PPT1P53043 513 aa3.86□□□□□ -1.79
YKL050CYKL050C PNG1Q02890 363 aa3.86□□□□□ -1.79
YKL050CYKL050C UTP5Q04177 643 aaKnown RBP3.86□□□□□ -1.79
YKL050CYKL050C ECM22Q05958 814 aaPredicted RBP3.86□□□□□ -1.79
YKL050CYKL050C TSR1Q07381 788 aaKnown RBP3.86□□□□□ -1.79
YKL050CYKL050C SPE3Q12074 293 aaKnown RBP3.86□□□□□ -1.79
YKL050CYKL050C GET3Q12154 354 aaKnown RBP3.86□□□□□ -1.79
YKL050CYKL050C GRX6Q12438 231 aa3.86□□□□□ -1.79
YKL050CYKL050C YOR111WQ99210 232 aa3.86□□□□□ -1.79
YKL050CYKL050C CDC24P11433 854 aaPredicted RBP3.85□□□□□ -1.79
YKL050CYKL050C CTF13P35203 478 aa3.85□□□□□ -1.79
YKL050CYKL050C ALG3P38179 458 aa3.85□□□□□ -1.79
YKL050CYKL050C YDR089WP38966 869 aa3.85□□□□□ -1.79
YKL050CYKL050C IRC5P43610 853 aa3.85□□□□□ -1.79
YKL050CYKL050C YIL002W-AQ3E7Z5 69 aa3.85□□□□□ -1.79
YKL050CYKL050C ARG82P07250 355 aa3.85□□□□□ -1.79
YKL050CYKL050C FBP1P09201 348 aa3.85□□□□□ -1.79
YKL050CYKL050C ACO1P19414 778 aaKnown RBP RIP-Chip data3.85□□□□□ -1.79not detected
YKL050CYKL050C SIR1P21691 654 aa3.85□□□□□ -1.79
YKL050CYKL050C PEP3P27801 918 aa3.85□□□□□ -1.79
YKL050CYKL050C ICL1P28240 557 aaPredicted RBP3.85□□□□□ -1.79
YKL050CYKL050C SET3P36124 751 aa3.85□□□□□ -1.79
YKL050CYKL050C YBR138CP38277 524 aa3.85□□□□□ -1.79
YKL050CYKL050C FLC2P39719 783 aa3.85□□□□□ -1.79
YKL050CYKL050C EFM4P40516 257 aa3.85□□□□□ -1.79
YKL050CYKL050C INA22P40576 216 aa3.85□□□□□ -1.79
YKL050CYKL050C SIP4P46954 829 aa3.85□□□□□ -1.79
YKL050CYKL050C PSP1P50896 841 aaKnown RBP3.85□□□□□ -1.79
YKL050CYKL050C EFM5P53200 248 aaKnown RBP3.85□□□□□ -1.79
YKL050CYKL050C MDR1P53258 950 aa3.85□□□□□ -1.79
YKL050CYKL050C EGD1Q02642 157 aaKnown RBP3.85□□□□□ -1.79
YKL050CYKL050C INP2Q03824 705 aa3.85□□□□□ -1.79
YKL050CYKL050C KAP95Q06142 861 aaKnown RBP3.85□□□□□ -1.79
YKL050CYKL050C NGL1Q08213 363 aaKnown RBP3.85□□□□□ -1.79
YKL050CYKL050C PFK27Q12471 397 aaPredicted RBP3.85□□□□□ -1.79
YKL050CYKL050C DMC1P25453 334 aa3.85□□□□□ -1.79
YKL050CYKL050C CWH43P25618 953 aa3.85□□□□□ -1.79
YKL050CYKL050C PHO91P27514 894 aa3.85□□□□□ -1.79
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 232.8 ms