RNA–Protein interactions for RNA: YJL096W

MRPL49, Transcript of Mitochondrial ribosomal protein of the large subunit, yeast

Gene MRPL49, Length 486 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MRPL49	YJL096W	THI6	P41835	540 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MRPL49	YJL096W	NMD5	P46970	1048 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MRPL49	YJL096W	YLR407W	Q06070	228 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MRPL49	YJL096W	RPL7B	Q12213	244 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
MRPL49	YJL096W	HIF1	Q12373	385 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MRPL49	YJL096W	ZPS1	Q12512	249 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MRPL49	YJL096W	NUC1	P08466	329 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MRPL49	YJL096W	SWI6	P09959	803 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MRPL49	YJL096W	IMG2	P25642	146 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
MRPL49	YJL096W	MRPL9	P31334	269 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MRPL49	YJL096W	SLC1	P33333	303 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MRPL49	YJL096W	YBR138C	P38277	524 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MRPL49	YJL096W	PIH1	P38768	344 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MRPL49	YJL096W	SAW1	P39735	261 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MRPL49	YJL096W	SNO3	P43544	222 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MRPL49	YJL096W	SRB7	P47822	140 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MRPL49	YJL096W	SCW4	P53334	386 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
MRPL49	YJL096W	NOP15	P53927	220 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
MRPL49	YJL096W	YPS7	Q06325	596 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MRPL49	YJL096W	OPY2	Q06810	360 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MRPL49	YJL096W	PRS5	Q12265	496 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
MRPL49	YJL096W	ARP7	Q12406	477 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MRPL49	YJL096W	PAH1	P32567	862 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MRPL49	YJL096W	NUP120	P35729	1037 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MRPL49	YJL096W	DHR2	P36009	735 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
MRPL49	YJL096W	SWD1	P39706	426 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MRPL49	YJL096W	PCI8	P40512	444 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MRPL49	YJL096W	LYS14	P40971	790 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MRPL49	YJL096W	IRC5	P43610	853 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MRPL49	YJL096W	HOL1	P53389	586 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MRPL49	YJL096W	RCR2	Q03446	210 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
MRPL49	YJL096W	YKU80	Q04437	629 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MRPL49	YJL096W	PSR1	Q07800	427 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MRPL49	YJL096W	CPA2	P03965	1118 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
MRPL49	YJL096W	YEL076C-A	P0CX16	216 aa		4.12	□□□□□ -1.75
MRPL49	YJL096W	YLR464W	P0CX17	216 aa		4.12	□□□□□ -1.75
MRPL49	YJL096W	SPO16	P17122	198 aa		4.12	□□□□□ -1.75
MRPL49	YJL096W	CBP3	P21560	335 aa		4.12	□□□□□ -1.75
MRPL49	YJL096W	VMA8	P32610	256 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
MRPL49	YJL096W	TGL1	P34163	548 aa		4.12	□□□□□ -1.75
MRPL49	YJL096W	ASK1	P35734	292 aa		4.12	□□□□□ -1.75
MRPL49	YJL096W	SPC97	P38863	823 aa		4.12	□□□□□ -1.75
MRPL49	YJL096W	BEM4	P39011	633 aa		4.12	□□□□□ -1.75
MRPL49	YJL096W	STL1	P39932	569 aa		4.12	□□□□□ -1.75
MRPL49	YJL096W	YEL076C	P39971	216 aa		4.12	□□□□□ -1.75
MRPL49	YJL096W	TPA1	P40032	644 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
MRPL49	YJL096W	YIP4	P53093	235 aa		4.12	□□□□□ -1.75
MRPL49	YJL096W	RBG2	P53295	368 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
MRPL49	YJL096W	MTD1	Q02046	320 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
MRPL49	YJL096W	MRPL13	Q02204	264 aa		4.12	□□□□□ -1.75
MRPL49	YJL096W	MEH1	Q02205	184 aa		4.12	□□□□□ -1.75
MRPL49	YJL096W	RSC9	Q03124	581 aa		4.12	□□□□□ -1.75
MRPL49	YJL096W	VID22	Q05934	901 aa		4.12	□□□□□ -1.75
MRPL49	YJL096W	RRG1	Q12167	365 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
MRPL49	YJL096W	PCD1	Q12524	340 aa		4.12	□□□□□ -1.75
MRPL49	YJL096W	HSH49	Q99181	213 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
MRPL49	YJL096W	RPS17A	P02407	136 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
MRPL49	YJL096W	AQY1	P0CD91	305 aa		4.11	□□□□□ -1.75
MRPL49	YJL096W	RPS17B	P14127	136 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
MRPL49	YJL096W	DAL5	P15365	543 aa		4.11	□□□□□ -1.75
MRPL49	YJL096W	PRP22	P24384	1145 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
MRPL49	YJL096W	RPC34	P32910	317 aa		4.11	□□□□□ -1.75
MRPL49	YJL096W	APD1	P38281	316 aa		4.11	□□□□□ -1.75
MRPL49	YJL096W	MAD2	P40958	196 aa		4.11	□□□□□ -1.75
MRPL49	YJL096W	CBK1	P53894	756 aa		4.11	□□□□□ -1.75
MRPL49	YJL096W	TFC6	Q06339	672 aa		4.11	□□□□□ -1.75
MRPL49	YJL096W	IMH1	Q06704	911 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
MRPL49	YJL096W	NAT1	P12945	854 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
MRPL49	YJL096W	MCM3	P24279	971 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
MRPL49	YJL096W	CLB4	P24871	460 aa		4.1	□□□□□ -1.75
MRPL49	YJL096W	YCL049C	P25577	312 aa		4.1	□□□□□ -1.75
MRPL49	YJL096W	DGR2	P32330	852 aa		4.1	□□□□□ -1.75
MRPL49	YJL096W	DPH2	P32461	534 aa		4.1	□□□□□ -1.75
MRPL49	YJL096W	YKR075C	P36155	307 aa		4.1	□□□□□ -1.75
MRPL49	YJL096W	STT3	P39007	718 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
MRPL49	YJL096W	PSF2	P40359	213 aa		4.1	□□□□□ -1.75
MRPL49	YJL096W	GPD2	P41911	440 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
MRPL49	YJL096W	YJL043W	P47053	257 aa		4.1	□□□□□ -1.75
MRPL49	YJL096W	BFA1	P47113	574 aa		4.1	□□□□□ -1.75
MRPL49	YJL096W	ACS1	Q01574	713 aa		4.1	□□□□□ -1.75
MRPL49	YJL096W	MFM1	Q02783	413 aa		4.1	□□□□□ -1.75
MRPL49	YJL096W	SNO4	Q04902	237 aa		4.1	□□□□□ -1.75
MRPL49	YJL096W	SPN1	Q06505	410 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
MRPL49	YJL096W	STP4	Q07351	490 aa		4.1	□□□□□ -1.75
MRPL49	YJL096W	PSK2	Q08217	1101 aa		4.1	□□□□□ -1.75
MRPL49	YJL096W	HSP33	Q08914	237 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
MRPL49	YJL096W	HSP32	Q08992	237 aa		4.1	□□□□□ -1.75
MRPL49	YJL096W	DIN7	Q12086	430 aa		4.1	□□□□□ -1.75
MRPL49	YJL096W	VPS5	Q92331	675 aa		4.1	□□□□□ -1.75
MRPL49	YJL096W	VAS1	P07806	1104 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
MRPL49	YJL096W	POL3	P15436	1097 aa		4.09	□□□□□ -1.75
MRPL49	YJL096W	FUR1	P18562	216 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
MRPL49	YJL096W	UBC1	P21734	215 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
MRPL49	YJL096W	PXL1	P36166	706 aa		4.09	□□□□□ -1.75
MRPL49	YJL096W	NOP16	P40007	231 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
MRPL49	YJL096W	JHD1	P40034	492 aa		4.09	□□□□□ -1.75
MRPL49	YJL096W	TMN3	P40071	706 aa		4.09	□□□□□ -1.75
MRPL49	YJL096W	FAF1	P40546	346 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
MRPL49	YJL096W	SGM1	P47166	707 aa		4.09	□□□□□ -1.75
MRPL49	YJL096W	COQ6	P53318	479 aa		4.09	□□□□□ -1.75

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