RNA–Protein interactions for RNA: YHR184W

SSP1, Transcript of Protein involved in the control of meiotic nuclear division, yeast

Gene SSP1, Length 1,716 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SSP1	YHR184W	ZAP1	P47043	880 aa		3.18	□□□□□ -1.9
SSP1	YHR184W	SAP4	P53036	818 aa		3.18	□□□□□ -1.9
SSP1	YHR184W	TGS1	Q12052	315 aa		3.18	□□□□□ -1.9
SSP1	YHR184W	TAF3	Q12297	353 aa		3.18	□□□□□ -1.9
SSP1	YHR184W	YOL087C	Q99247	1116 aa		3.18	□□□□□ -1.9
SSP1	YHR184W	TPK1	P06244	397 aa		3.17	□□□□□ -1.9
SSP1	YHR184W	GCD7	P32502	381 aa	Predicted RBP	3.17	□□□□□ -1.9
SSP1	YHR184W	RPT3	P33298	428 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
SSP1	YHR184W	LOT5	P34234	306 aa		3.17	□□□□□ -1.9
SSP1	YHR184W	TEF4	P36008	412 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
SSP1	YHR184W	YMC2	P38087	329 aa		3.17	□□□□□ -1.9
SSP1	YHR184W	MOH1	P38191	138 aa		3.17	□□□□□ -1.9
SSP1	YHR184W	ARO9	P38840	513 aa	Predicted RBP	3.17	□□□□□ -1.9
SSP1	YHR184W	MNT3	P40549	630 aa		3.17	□□□□□ -1.9
SSP1	YHR184W	GND2	P53319	492 aa		3.17	□□□□□ -1.9
SSP1	YHR184W	CTF4	Q01454	927 aa		3.17	□□□□□ -1.9
SSP1	YHR184W	YDL073W	Q07454	984 aa		3.17	□□□□□ -1.9
SSP1	YHR184W	MRN1	Q08925	612 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.17	□□□□□ -1.9	not detected
SSP1	YHR184W	YDR056C	Q12025	205 aa		3.17	□□□□□ -1.9
SSP1	YHR184W	MDM20	Q12387	796 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
SSP1	YHR184W	PNO1	Q99216	274 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
SSP1	YHR184W	CDC43	P18898	376 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SSP1	YHR184W	CHS3	P29465	1165 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SSP1	YHR184W	SWC3	P31376	625 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SSP1	YHR184W	OAR1	P35731	278 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SSP1	YHR184W	LNP1	P38878	278 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SSP1	YHR184W	YER010C	P40011	234 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SSP1	YHR184W	SKP2	P42843	763 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SSP1	YHR184W	PSP1	P50896	841 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
SSP1	YHR184W	COG1	P53079	417 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SSP1	YHR184W	TMN2	Q04562	672 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SSP1	YHR184W	GSF2	Q04697	403 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
SSP1	YHR184W	STP3	Q05937	343 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SSP1	YHR184W	VAM6	Q07468	1049 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SSP1	YHR184W	MRH1	Q12117	320 aa	Predicted RBP	3.16	□□□□□ -1.9
SSP1	YHR184W	ZPS1	Q12512	249 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SSP1	YHR184W	YER175W-A	Q8TGU4	54 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SSP1	YHR184W	RPA135	P22138	1203 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
SSP1	YHR184W	CNS1	P33313	385 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SSP1	YHR184W	MTH1	P35198	433 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SSP1	YHR184W	ERP2	P39704	215 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SSP1	YHR184W	CBK1	P53894	756 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SSP1	YHR184W	YNL092W	P53934	400 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SSP1	YHR184W	SNO4	Q04902	237 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SSP1	YHR184W	HSP33	Q08914	237 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
SSP1	YHR184W	HSP32	Q08992	237 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SSP1	YHR184W	PNS1	Q12412	539 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SSP1	YHR184W	ATP2	P00830	511 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
SSP1	YHR184W	AAC1	P04710	309 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SSP1	YHR184W	WHI2	P12611	486 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SSP1	YHR184W	STE12	P13574	688 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SSP1	YHR184W	RNR3	P21672	869 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
SSP1	YHR184W	DMC1	P25453	334 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SSP1	YHR184W	URK1	P27515	501 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SSP1	YHR184W	NUP120	P35729	1037 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SSP1	YHR184W	MTG2	P38860	518 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SSP1	YHR184W	DPH1	P40487	425 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
SSP1	YHR184W	COQ6	P53318	479 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SSP1	YHR184W	UBP16	Q02863	499 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SSP1	YHR184W	MTG1	Q03151	367 aa	Predicted RBP	3.15	□□□□□ -1.91
SSP1	YHR184W	YML119W	Q03208	357 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SSP1	YHR184W	COG4	Q06096	861 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SSP1	YHR184W	CPA2	P03965	1118 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
SSP1	YHR184W	TPK2	P06245	380 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SSP1	YHR184W	TY2A-LR1	P0C2J4	438 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SSP1	YHR184W	TY2A-F	P0CX61	438 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SSP1	YHR184W	TY2A-GR2	P0CX62	438 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SSP1	YHR184W	PDE1	P22434	369 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SSP1	YHR184W	AMD2	P22580	549 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SSP1	YHR184W	TY2A-C	P25383	438 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SSP1	YHR184W	MUD2	P36084	527 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
SSP1	YHR184W	ASN1	P49089	572 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
SSP1	YHR184W	YGL117W	P53133	265 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SSP1	YHR184W	IMO32	P53219	342 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SSP1	YHR184W	CSL4	P53859	292 aa	Predicted RBP	3.14	□□□□□ -1.91
SSP1	YHR184W	TY2A-DR2	Q03483	438 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SSP1	YHR184W	TY2A-B	Q12260	438 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SSP1	YHR184W	TY2A-OR2	Q12293	438 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SSP1	YHR184W	TY2A-DR1	Q12392	438 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SSP1	YHR184W	TY2A-OR1	Q12439	438 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SSP1	YHR184W	RVB2	Q12464	471 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
SSP1	YHR184W	YBR255C-A	Q3E776	120 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SSP1	YHR184W	TY2A-DR3	Q99303	438 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SSP1	YHR184W	MRPL9	P31334	269 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SSP1	YHR184W	GDA1	P32621	518 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SSP1	YHR184W	EMP70	P32802	667 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SSP1	YHR184W	VPS8	P39702	1274 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SSP1	YHR184W	BUD16	P39988	312 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SSP1	YHR184W	MAM1	P40065	302 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SSP1	YHR184W	RIC1	P40395	1056 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SSP1	YHR184W	TMA108	P40462	946 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SSP1	YHR184W	IST3	P40565	148 aa	Predicted RBP	3.13	□□□□□ -1.91
SSP1	YHR184W	VPS73	P53142	486 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
SSP1	YHR184W	CPR8	P53728	308 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SSP1	YHR184W	CRT10	Q08226	957 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SSP1	YHR184W	TMA16	Q08687	178 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SSP1	YHR184W	RRI2	Q12348	645 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SSP1	YHR184W	YLR302C	O13544	120 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SSP1	YHR184W	FUM1	P08417	488 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
SSP1	YHR184W	RPN12	P32496	274 aa		3.13	□□□□□ -1.91

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