RNA–Protein interactions for RNA: YFR056C

YFR056C, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene YFR056C, Length 369 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YFR056C	YFR056C	HMG2	P12684	1045 aa		2.67	□□□□□ -1.98
YFR056C	YFR056C	MSM1	P22438	575 aa		2.67	□□□□□ -1.98
YFR056C	YFR056C	MSH1	P25846	959 aa		2.67	□□□□□ -1.98
YFR056C	YFR056C	MPE1	P35728	441 aa	Known RBP	2.67	□□□□□ -1.98
YFR056C	YFR056C	APM3	P38153	483 aa		2.67	□□□□□ -1.98
YFR056C	YFR056C	SRP68	P38687	599 aa	Known RBP	2.67	□□□□□ -1.98
YFR056C	YFR056C	SPC97	P38863	823 aa		2.67	□□□□□ -1.98
YFR056C	YFR056C	YEL076C	P39971	216 aa		2.67	□□□□□ -1.98
YFR056C	YFR056C	SCS2	P40075	244 aa	Known RBP	2.67	□□□□□ -1.98
YFR056C	YFR056C	IMA5	P40884	581 aa		2.67	□□□□□ -1.98
YFR056C	YFR056C	IRC5	P43610	853 aa		2.67	□□□□□ -1.98
YFR056C	YFR056C	MAD3	P47074	515 aa		2.67	□□□□□ -1.98
YFR056C	YFR056C	SAP4	P53036	818 aa		2.67	□□□□□ -1.98
YFR056C	YFR056C	IDP3	P53982	420 aa	Known RBP	2.67	□□□□□ -1.98
YFR056C	YFR056C	YPL068C	Q02749	293 aa		2.67	□□□□□ -1.98
YFR056C	YFR056C	BLS1	Q06071	122 aa		2.67	□□□□□ -1.98
YFR056C	YFR056C	ARR3	Q06598	404 aa		2.67	□□□□□ -1.98
YFR056C	YFR056C	BSP1	Q06604	576 aa		2.67	□□□□□ -1.98
YFR056C	YFR056C	CIR2	Q08822	631 aa		2.67	□□□□□ -1.98
YFR056C	YFR056C	ADH4	P10127	382 aa		2.66	□□□□□ -1.98
YFR056C	YFR056C	BET2	P20133	325 aa		2.66	□□□□□ -1.98
YFR056C	YFR056C	VPS33	P20795	691 aa		2.66	□□□□□ -1.98
YFR056C	YFR056C	CBP3	P21560	335 aa		2.66	□□□□□ -1.98
YFR056C	YFR056C	GFD2	P25370	566 aa	Known RBP	2.66	□□□□□ -1.98
YFR056C	YFR056C	GSY2	P27472	705 aa		2.66	□□□□□ -1.98
YFR056C	YFR056C	MCM10	P32354	571 aa		2.66	□□□□□ -1.98
YFR056C	YFR056C	PET309	P32522	965 aa	Predicted RBP	2.66	□□□□□ -1.98
YFR056C	YFR056C	ECM32	P32644	1121 aa	Known RBP	2.66	□□□□□ -1.98
YFR056C	YFR056C	TGL1	P34163	548 aa		2.66	□□□□□ -1.98
YFR056C	YFR056C	SDS22	P36047	338 aa		2.66	□□□□□ -1.98
YFR056C	YFR056C	SWD1	P39706	426 aa		2.66	□□□□□ -1.98
YFR056C	YFR056C	YDL183C	P48569	320 aa		2.66	□□□□□ -1.98
YFR056C	YFR056C	SCW4	P53334	386 aa	Known RBP	2.66	□□□□□ -1.98
YFR056C	YFR056C	RSC9	Q03124	581 aa		2.66	□□□□□ -1.98
YFR056C	YFR056C	USA1	Q03714	838 aa		2.66	□□□□□ -1.98
YFR056C	YFR056C	YMR018W	Q04364	514 aa		2.66	□□□□□ -1.98
YFR056C	YFR056C	CIA1	Q05583	330 aa		2.66	□□□□□ -1.98
YFR056C	YFR056C	TPO3	Q06451	622 aa		2.66	□□□□□ -1.98
YFR056C	YFR056C	NEW1	Q08972	1196 aa	Known RBP	2.66	□□□□□ -1.98
YFR056C	YFR056C	RTK1	Q12100	620 aa	Predicted RBP	2.66	□□□□□ -1.98
YFR056C	YFR056C	RDL1	Q12305	139 aa	Known RBP	2.66	□□□□□ -1.98
YFR056C	YFR056C	ARP7	Q12406	477 aa		2.66	□□□□□ -1.98
YFR056C	YFR056C	SSM4	P40318	1319 aa		2.66	□□□□□ -1.98
YFR056C	YFR056C	YPK1	P12688	680 aa	Known RBP	2.65	□□□□□ -1.99
YFR056C	YFR056C	CHS3	P29465	1165 aa		2.65	□□□□□ -1.99
YFR056C	YFR056C	PSY4	P38193	441 aa		2.65	□□□□□ -1.99
YFR056C	YFR056C	SPC72	P39723	622 aa		2.65	□□□□□ -1.99
YFR056C	YFR056C	PCI8	P40512	444 aa		2.65	□□□□□ -1.99
YFR056C	YFR056C	MNT2	P53059	558 aa		2.65	□□□□□ -1.99
YFR056C	YFR056C	MDR1	P53258	950 aa		2.65	□□□□□ -1.99
YFR056C	YFR056C	YPL071C	Q02864	156 aa		2.65	□□□□□ -1.99
YFR056C	YFR056C	TRS130	Q03660	1102 aa		2.65	□□□□□ -1.99
YFR056C	YFR056C	TDA9	Q04545	1251 aa		2.65	□□□□□ -1.99
YFR056C	YFR056C	CRC1	Q12289	327 aa		2.65	□□□□□ -1.99
YFR056C	YFR056C	DBP10	Q12389	995 aa	Known RBP	2.65	□□□□□ -1.99
YFR056C	YFR056C	AHA1	Q12449	350 aa	Known RBP	2.65	□□□□□ -1.99
YFR056C	YFR056C	AAC1	P04710	309 aa		2.64	□□□□□ -1.99
YFR056C	YFR056C	VAS1	P07806	1104 aa	Known RBP	2.64	□□□□□ -1.99
YFR056C	YFR056C	PCK1	P10963	549 aa		2.64	□□□□□ -1.99
YFR056C	YFR056C	YAP1	P19880	650 aa	Known RBP	2.64	□□□□□ -1.99
YFR056C	YFR056C	DSS4	P32601	143 aa		2.64	□□□□□ -1.99
YFR056C	YFR056C	RMA1	P36001	430 aa	Known RBP	2.64	□□□□□ -1.99
YFR056C	YFR056C	YPT10	P38146	199 aa		2.64	□□□□□ -1.99
YFR056C	YFR056C	NOC2	P39744	710 aa	Known RBP	2.64	□□□□□ -1.99
YFR056C	YFR056C	SMK1	P41808	388 aa		2.64	□□□□□ -1.99
YFR056C	YFR056C	TDA10	P42938	290 aa		2.64	□□□□□ -1.99
YFR056C	YFR056C	BST1	P43571	1029 aa		2.64	□□□□□ -1.99
YFR056C	YFR056C	IRC8	P47046	822 aa		2.64	□□□□□ -1.99
YFR056C	YFR056C	PEF1	P53238	335 aa		2.64	□□□□□ -1.99
YFR056C	YFR056C	ARC35	P53731	342 aa	Known RBP	2.64	□□□□□ -1.99
YFR056C	YFR056C	YNL058C	P53947	316 aa		2.64	□□□□□ -1.99
YFR056C	YFR056C	CRT10	Q08226	957 aa		2.64	□□□□□ -1.99
YFR056C	YFR056C	RRI2	Q12348	645 aa		2.64	□□□□□ -1.99
YFR056C	YFR056C	VPS5	Q92331	675 aa		2.64	□□□□□ -1.99
YFR056C	YFR056C	POL3	P15436	1097 aa		2.63	□□□□□ -1.99
YFR056C	YFR056C	STT3	P39007	718 aa	Known RBP	2.63	□□□□□ -1.99
YFR056C	YFR056C	MAD2	P40958	196 aa		2.63	□□□□□ -1.99
YFR056C	YFR056C	MEP2	P41948	499 aa		2.63	□□□□□ -1.99
YFR056C	YFR056C	PUS4	P48567	403 aa	Known RBP	2.63	□□□□□ -1.99
YFR056C	YFR056C	MEP3	P53390	489 aa		2.63	□□□□□ -1.99
YFR056C	YFR056C	CPR6	P53691	371 aa	Known RBP	2.63	□□□□□ -1.99
YFR056C	YFR056C	YNR071C	P53757	342 aa		2.63	□□□□□ -1.99
YFR056C	YFR056C	MDM1	Q01846	1127 aa		2.63	□□□□□ -1.99
YFR056C	YFR056C	MRPL1	Q04599	285 aa		2.63	□□□□□ -1.99
YFR056C	YFR056C	SPN1	Q06505	410 aa	Predicted RBP	2.63	□□□□□ -1.99
YFR056C	YFR056C	YDR056C	Q12025	205 aa		2.63	□□□□□ -1.99
YFR056C	YFR056C	YLR111W	Q12528	110 aa		2.63	□□□□□ -1.99
YFR056C	YFR056C	YOL087C	Q99247	1116 aa		2.63	□□□□□ -1.99
YFR056C	YFR056C	YPR089W	O13585	888 aa		2.62	□□□□□ -1.99
YFR056C	YFR056C	INH1	P01097	85 aa		2.62	□□□□□ -1.99
YFR056C	YFR056C	URA3	P03962	267 aa		2.62	□□□□□ -1.99
YFR056C	YFR056C	NCP1	P16603	691 aa	Known RBP	2.62	□□□□□ -1.99
YFR056C	YFR056C	ARG1	P22768	420 aa		2.62	□□□□□ -1.99
YFR056C	YFR056C	SWI4	P25302	1093 aa	Known RBP	2.62	□□□□□ -1.99
YFR056C	YFR056C	YCL049C	P25577	312 aa		2.62	□□□□□ -1.99
YFR056C	YFR056C	CWH43	P25618	953 aa		2.62	□□□□□ -1.99
YFR056C	YFR056C	SLC1	P33333	303 aa		2.62	□□□□□ -1.99
YFR056C	YFR056C	ASK1	P35734	292 aa		2.62	□□□□□ -1.99
YFR056C	YFR056C	TAF5	P38129	798 aa		2.62	□□□□□ -1.99
YFR056C	YFR056C	PUG1	P40100	303 aa		2.62	□□□□□ -1.99

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