RNA–Protein interactions for RNA: YFR049W

YMR31, Transcript of Mitochondrial ribosomal protein of the small subunit, yeast

Gene YMR31, Length 372 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YMR31	YFR049W	RAD30	Q04049	632 aa		2.9	□□□□□ -1.95
YMR31	YFR049W	TAF11	Q04226	346 aa		2.9	□□□□□ -1.95
YMR31	YFR049W	CRF1	Q04930	467 aa		2.9	□□□□□ -1.95
YMR31	YFR049W	UTP21	Q06078	939 aa	Predicted RBP	2.9	□□□□□ -1.95
YMR31	YFR049W	TMA10	Q06177	86 aa		2.9	□□□□□ -1.95
YMR31	YFR049W	YLR352W	Q06479	807 aa		2.9	□□□□□ -1.95
YMR31	YFR049W	ARR3	Q06598	404 aa		2.9	□□□□□ -1.95
YMR31	YFR049W	VAM6	Q07468	1049 aa		2.9	□□□□□ -1.95
YMR31	YFR049W	RVB2	Q12464	471 aa	Known RBP	2.9	□□□□□ -1.95
YMR31	YFR049W	GCN4	P03069	281 aa		2.89	□□□□□ -1.95
YMR31	YFR049W	ARG3	P05150	338 aa		2.89	□□□□□ -1.95
YMR31	YFR049W	MET17	P06106	444 aa		2.89	□□□□□ -1.95
YMR31	YFR049W	CKA1	P15790	372 aa		2.89	□□□□□ -1.95
YMR31	YFR049W	SPO16	P17122	198 aa		2.89	□□□□□ -1.95
YMR31	YFR049W	YCK1	P23291	538 aa		2.89	□□□□□ -1.95
YMR31	YFR049W	ERG8	P24521	451 aa		2.89	□□□□□ -1.95
YMR31	YFR049W	CDC60	P26637	1090 aa	Known RBP	2.89	□□□□□ -1.95
YMR31	YFR049W	PEX5	P35056	612 aa		2.89	□□□□□ -1.95
YMR31	YFR049W	MTH1	P35198	433 aa		2.89	□□□□□ -1.95
YMR31	YFR049W	YKL050C	P35736	922 aa		2.89	□□□□□ -1.95
YMR31	YFR049W	ELF1	P36053	145 aa		2.89	□□□□□ -1.95
YMR31	YFR049W	OMA1	P36163	345 aa		2.89	□□□□□ -1.95
YMR31	YFR049W	PSD1	P39006	500 aa		2.89	□□□□□ -1.95
YMR31	YFR049W	TPA1	P40032	644 aa	Known RBP	2.89	□□□□□ -1.95
YMR31	YFR049W	ELO3	P40319	345 aa		2.89	□□□□□ -1.95
YMR31	YFR049W	PFK26	P40433	827 aa	Known RBP	2.89	□□□□□ -1.95
YMR31	YFR049W	YIL161W	P40449	235 aa	Known RBP	2.89	□□□□□ -1.95
YMR31	YFR049W	ARC1	P46672	376 aa	Known RBP	2.89	□□□□□ -1.95
YMR31	YFR049W	SIP4	P46954	829 aa		2.89	□□□□□ -1.95
YMR31	YFR049W	MPS3	P47069	682 aa		2.89	□□□□□ -1.95
YMR31	YFR049W	ASE1	P50275	885 aa		2.89	□□□□□ -1.95
YMR31	YFR049W	PAN2	P53010	1115 aa	Predicted RBP	2.89	□□□□□ -1.95
YMR31	YFR049W	ARE2	P53629	642 aa	Known RBP	2.89	□□□□□ -1.95
YMR31	YFR049W	ERG5	P54781	538 aa		2.89	□□□□□ -1.95
YMR31	YFR049W	YSA1	Q01976	231 aa		2.89	□□□□□ -1.95
YMR31	YFR049W	YDR132C	Q03900	495 aa		2.89	□□□□□ -1.95
YMR31	YFR049W	SXM1	Q04175	944 aa	Known RBP	2.89	□□□□□ -1.95
YMR31	YFR049W	ENB1	Q08299	606 aa		2.89	□□□□□ -1.95
YMR31	YFR049W	IRC13	Q08630	104 aa		2.89	□□□□□ -1.95
YMR31	YFR049W	NUS1	Q12063	375 aa		2.89	□□□□□ -1.95
YMR31	YFR049W	TRP4	P07285	380 aa	Predicted RBP	2.88	□□□□□ -1.95
YMR31	YFR049W	OLE1	P21147	510 aa	Known RBP	2.88	□□□□□ -1.95
YMR31	YFR049W	FUB1	P25659	250 aa		2.88	□□□□□ -1.95
YMR31	YFR049W	DBF4	P32325	704 aa		2.88	□□□□□ -1.95
YMR31	YFR049W	SAC6	P32599	642 aa	Known RBP	2.88	□□□□□ -1.95
YMR31	YFR049W	LST4	P34239	828 aa		2.88	□□□□□ -1.95
YMR31	YFR049W	PHO11	P35842	467 aa		2.88	□□□□□ -1.95
YMR31	YFR049W	ALY1	P36117	915 aa		2.88	□□□□□ -1.95
YMR31	YFR049W	YBR053C	P38235	358 aa		2.88	□□□□□ -1.95
YMR31	YFR049W	AIM3	P38266	947 aa	Known RBP	2.88	□□□□□ -1.95
YMR31	YFR049W	PHO12	P38693	467 aa		2.88	□□□□□ -1.95
YMR31	YFR049W	RTS1	P38903	757 aa		2.88	□□□□□ -1.95
YMR31	YFR049W	HRB1	P38922	454 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.88	□□□□□ -1.95	not detected
YMR31	YFR049W	UBP7	P40453	1071 aa		2.88	□□□□□ -1.95
YMR31	YFR049W	RMD8	P43620	662 aa		2.88	□□□□□ -1.95
YMR31	YFR049W	UBC11	P52492	156 aa		2.88	□□□□□ -1.95
YMR31	YFR049W	DSD1	P53095	428 aa		2.88	□□□□□ -1.95
YMR31	YFR049W	CSL4	P53859	292 aa	Predicted RBP	2.88	□□□□□ -1.95
YMR31	YFR049W	YPL062W	Q02781	134 aa		2.88	□□□□□ -1.95
YMR31	YFR049W	MFM1	Q02783	413 aa		2.88	□□□□□ -1.95
YMR31	YFR049W	MTG1	Q03151	367 aa	Predicted RBP	2.88	□□□□□ -1.95
YMR31	YFR049W	YMR155W	Q03795	547 aa		2.88	□□□□□ -1.95
YMR31	YFR049W	RCO1	Q04779	684 aa		2.88	□□□□□ -1.95
YMR31	YFR049W	LAS17	Q12446	633 aa		2.88	□□□□□ -1.95
YMR31	YFR049W	SMC6	Q12749	1114 aa		2.88	□□□□□ -1.95
YMR31	YFR049W	YKL033W-A	Q86ZR7	236 aa		2.88	□□□□□ -1.95
YMR31	YFR049W	RPB2	P08518	1224 aa	Known RBP	2.87	□□□□□ -1.95
YMR31	YFR049W	RPL19A	P0CX82	189 aa	Known RBP	2.87	□□□□□ -1.95
YMR31	YFR049W	RPL19B	P0CX83	189 aa	Predicted RBP	2.87	□□□□□ -1.95
YMR31	YFR049W	VPS34	P22543	875 aa		2.87	□□□□□ -1.95
YMR31	YFR049W	CAP1	P28495	268 aa	Known RBP	2.87	□□□□□ -1.95
YMR31	YFR049W	EFT1	P32324	842 aa	Known RBP	2.87	□□□□□ -1.95
YMR31	YFR049W	MSS1	P32559	526 aa	Predicted RBP	2.87	□□□□□ -1.95
YMR31	YFR049W	TOD6	P34219	525 aa		2.87	□□□□□ -1.95
YMR31	YFR049W	MRPL7	P36519	292 aa		2.87	□□□□□ -1.95
YMR31	YFR049W	CTP1	P38152	299 aa		2.87	□□□□□ -1.95
YMR31	YFR049W	TDP1	P38319	544 aa		2.87	□□□□□ -1.95
YMR31	YFR049W	SRP72	P38688	640 aa	Known RBP	2.87	□□□□□ -1.95
YMR31	YFR049W	YHR097C	P38809	366 aa	Known RBP	2.87	□□□□□ -1.95
YMR31	YFR049W	FMP10	P40098	244 aa		2.87	□□□□□ -1.95
YMR31	YFR049W	ECL1	P48235	211 aa		2.87	□□□□□ -1.95
YMR31	YFR049W	MRX6	P48564	524 aa		2.87	□□□□□ -1.95
YMR31	YFR049W	VPS4	P52917	437 aa		2.87	□□□□□ -1.95
YMR31	YFR049W	MCM6	P53091	1017 aa	Known RBP	2.87	□□□□□ -1.95
YMR31	YFR049W	DIP5	P53388	608 aa		2.87	□□□□□ -1.95
YMR31	YFR049W	YNR061C	P53747	219 aa		2.87	□□□□□ -1.95
YMR31	YFR049W	VPS75	P53853	264 aa		2.87	□□□□□ -1.95
YMR31	YFR049W	EFR3	Q03653	782 aa	Known RBP	2.87	□□□□□ -1.95
YMR31	YFR049W	YDL086W	Q07505	273 aa		2.87	□□□□□ -1.95
YMR31	YFR049W	IZH3	Q07959	543 aa		2.87	□□□□□ -1.95
YMR31	YFR049W	FRE5	Q08908	694 aa		2.87	□□□□□ -1.95
YMR31	YFR049W	RCN2	Q12044	265 aa		2.87	□□□□□ -1.95
YMR31	YFR049W	SWT1	Q12104	458 aa		2.87	□□□□□ -1.95
YMR31	YFR049W	USV1	Q12132	391 aa		2.87	□□□□□ -1.95
YMR31	YFR049W	ABF1	P14164	731 aa		2.86	□□□□□ -1.95
YMR31	YFR049W	GAS1	P22146	559 aa	Known RBP	2.86	□□□□□ -1.95
YMR31	YFR049W	POL4	P25615	582 aa		2.86	□□□□□ -1.95
YMR31	YFR049W	YCR061W	P25639	631 aa		2.86	□□□□□ -1.95
YMR31	YFR049W	URK1	P27515	501 aa		2.86	□□□□□ -1.95
YMR31	YFR049W	MAL33	P38157	468 aa		2.86	□□□□□ -1.95

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