RNA–Protein interactions for RNA: YDL117W

CYK3, Transcript of SH3-domain protein located in the bud neck and cytokinetic actin ring, yeastyeast

Gene CYK3, Length 2,658 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CYK3YDL117W GLN4P13188 809 aaKnown RBP5.24□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W VMA16P23968 213 aa5.24□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W PEP3P27801 918 aa5.24□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W KTR1P27810 393 aaKnown RBP5.24□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W RFS1P38234 210 aaKnown RBP5.24□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W GND1P38720 489 aaKnown RBP5.24□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W PTC2P39966 464 aaKnown RBP5.24□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W SER33P40510 469 aa5.24□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W AIP1P46680 615 aaKnown RBP5.24□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W TGL2P54857 326 aa5.24□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W ECM7Q06200 448 aa5.24□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W RGA2Q06407 1009 aa5.24□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W NYV1Q12255 253 aa5.24□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W ATG11Q12527 1178 aa5.24□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W BNR1P40450 1375 aa5.24□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W SNT2P53127 1403 aa5.24□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W CIT1P00890 479 aa5.23□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W RPL6BP05739 176 aaKnown RBP5.23□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W ENA1P13587 1091 aa5.23□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W COQ8P27697 501 aa5.23□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W SSH4P32343 579 aa5.23□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W RDH54P38086 958 aa5.23□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W YAP5P40574 245 aa5.23□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W RSM26P47141 266 aa5.23□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W YJR120WP47157 116 aa5.23□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W THI11P47183 340 aa5.23□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W MLC1P53141 149 aa5.23□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W TOF1P53840 1238 aa5.23□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W ENA2Q01896 1091 aa5.23□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W PML39Q03760 334 aa5.23□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W ARO10Q06408 635 aa5.23□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W WHI4Q07655 649 aaKnown RBP5.23□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W OSW1Q08692 278 aa5.23□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W MUM3Q08750 479 aa5.23□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W APL4Q12028 832 aa5.23□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W ENA5Q12691 1091 aa5.23□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W TDH1P00360 332 aaKnown RBP5.23□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W RNR2P09938 399 aaKnown RBP5.23□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W FUS3P16892 353 aaKnown RBP5.23□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W SIN4P32259 974 aa5.23□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W TGL4P36165 910 aa5.23□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W MRPL7P36519 292 aa5.23□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W IMD2P38697 523 aaKnown RBP5.23□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W GPP1P41277 250 aaKnown RBP5.23□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W UBX4P54730 416 aa5.23□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W THI3Q07471 609 aa5.23□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W MEU1Q07938 337 aaKnown RBP RIP-Chip data5.23□□□□□ -1.57not detected
CYK3YDL117W YAP7Q08182 245 aa5.23□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W TAF10Q12030 206 aa5.23□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W WRS1Q12109 432 aaKnown RBP5.23□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W MMP1Q12372 583 aa5.23□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W NCA2Q12374 616 aa5.23□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W EMP46Q12396 444 aa5.23□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W SPO21Q12411 609 aa5.23□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W AVL9Q12500 764 aa5.23□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W TMA17Q12513 150 aa5.23□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W POM152P39685 1337 aa5.23□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W GDB1Q06625 1536 aa5.23□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W ATP6P00854 259 aa5.22□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W MET3P08536 511 aa5.22□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W CDC24P11433 854 aaPredicted RBP5.22□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W SEC63P14906 663 aa5.22□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W RPL8AP17076 256 aaKnown RBP5.22□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W RPL8BP29453 256 aaKnown RBP5.22□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W ACH1P32316 526 aa5.22□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W TIM23P32897 222 aa5.22□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W HEK2P38199 381 aaKnown RBP RIP-Chip data5.22□□□□□ -1.57not detected
CYK3YDL117W RAD55P38953 406 aa5.22□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W YMR134WP40207 237 aa5.22□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W GUS1P46655 708 aaKnown RBP RIP-Chip data5.22□□□□□ -1.57not detected
CYK3YDL117W SAM50P53969 484 aa5.22□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W TRS130Q03660 1102 aa5.22□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W FMP42Q04991 504 aa5.22□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W AIM41Q12032 185 aa5.22□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W GET4Q12125 312 aa5.22□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W ARG3P05150 338 aa5.22□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W CHS2P14180 963 aa5.22□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W FRS2P15625 503 aaKnown RBP5.22□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W CDC15P27636 974 aa5.22□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W DAL1P32375 460 aa5.22□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W GDH2P33327 1092 aaKnown RBP5.22□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W YKL069WP36088 180 aa5.22□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W MGE1P38523 228 aa5.22□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W OSH7P38755 437 aa5.22□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W FLC2P39719 783 aa5.22□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W SPF1P39986 1215 aaKnown RBP5.22□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W EPS1P40557 701 aa5.22□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W IRC24P40580 263 aa5.22□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W UFE1P41834 346 aa5.22□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W THI12P42883 340 aa5.22□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W THI5P43534 340 aa5.22□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W AIM24P47127 394 aa5.22□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W ORC3P54790 616 aa5.22□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W ERV25P54837 211 aaKnown RBP5.22□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W CLU1Q03690 1277 aaKnown RBP5.22□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W BUD22Q04347 519 aaKnown RBP5.22□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W MHR1Q06630 226 aa5.22□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W YPR091CQ06833 770 aa5.22□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W THI13Q07748 340 aa5.22□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W PSF3Q12146 194 aa5.22□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 64.5 ms