RNA–Protein interactions for RNA: YDL064W

UBC9, Transcript of SUMO-conjugating enzyme involved in the Smt3p conjugation pathway, yeast

Gene UBC9, Length 474 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
UBC9	YDL064W	PAC2	P39937	518 aa		4.2	□□□□□ -1.74
UBC9	YDL064W	UBP16	Q02863	499 aa		4.2	□□□□□ -1.74
UBC9	YDL064W	WAR1	Q03631	944 aa		4.2	□□□□□ -1.74
UBC9	YDL064W	RPL7B	Q12213	244 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
UBC9	YDL064W	RPN13	O13563	156 aa		4.19	□□□□□ -1.74
UBC9	YDL064W	AQY1	P0CD91	305 aa		4.19	□□□□□ -1.74
UBC9	YDL064W	YCL049C	P25577	312 aa		4.19	□□□□□ -1.74
UBC9	YDL064W	MRPL9	P31334	269 aa		4.19	□□□□□ -1.74
UBC9	YDL064W	RIX1	P38883	763 aa	Predicted RBP	4.19	□□□□□ -1.74
UBC9	YDL064W	PSF2	P40359	213 aa		4.19	□□□□□ -1.74
UBC9	YDL064W	SAP185	P40856	1058 aa		4.19	□□□□□ -1.74
UBC9	YDL064W	IMA1	P53051	589 aa		4.19	□□□□□ -1.74
UBC9	YDL064W	FMP30	Q02883	468 aa		4.19	□□□□□ -1.74
UBC9	YDL064W	ATG21	Q02887	496 aa		4.19	□□□□□ -1.74
UBC9	YDL064W	ARA2	Q04212	335 aa		4.19	□□□□□ -1.74
UBC9	YDL064W	YML053C	Q04978	212 aa		4.19	□□□□□ -1.74
UBC9	YDL064W	STP3	Q05937	343 aa		4.19	□□□□□ -1.74
UBC9	YDL064W	ARO10	Q06408	635 aa		4.19	□□□□□ -1.74
UBC9	YDL064W	PCD1	Q12524	340 aa		4.19	□□□□□ -1.74
UBC9	YDL064W	PEX2	P32800	271 aa		4.18	□□□□□ -1.74
UBC9	YDL064W	IFA38	P38286	347 aa		4.18	□□□□□ -1.74
UBC9	YDL064W	EXO1	P39875	702 aa		4.18	□□□□□ -1.74
UBC9	YDL064W	BNA1	P47096	177 aa		4.18	□□□□□ -1.74
UBC9	YDL064W	RRT6	P53117	311 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
UBC9	YDL064W	GTR1	Q00582	310 aa		4.18	□□□□□ -1.74
UBC9	YDL064W	TRS130	Q03660	1102 aa		4.18	□□□□□ -1.74
UBC9	YDL064W	ECM16	Q04217	1267 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
UBC9	YDL064W	RAD33	Q04231	177 aa		4.18	□□□□□ -1.74
UBC9	YDL064W	YDL242W	Q07746	117 aa		4.18	□□□□□ -1.74
UBC9	YDL064W	YER175W-A	Q8TGU4	54 aa		4.18	□□□□□ -1.74
UBC9	YDL064W	PNO1	Q99216	274 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
UBC9	YDL064W	TUB1	P09733	447 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
UBC9	YDL064W	BIK1	P11709	440 aa		4.17	□□□□□ -1.74
UBC9	YDL064W	RRP43	P25359	394 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
UBC9	YDL064W	YJU2	P28320	278 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
UBC9	YDL064W	LNP1	P38878	278 aa		4.17	□□□□□ -1.74
UBC9	YDL064W	SAP1	P39955	897 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
UBC9	YDL064W	MRK1	P50873	501 aa		4.17	□□□□□ -1.74
UBC9	YDL064W	MRPL13	Q02204	264 aa		4.17	□□□□□ -1.74
UBC9	YDL064W	YPL108W	Q02872	168 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
UBC9	YDL064W	AHA1	Q12449	350 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
UBC9	YDL064W	CHO2	P05374	869 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
UBC9	YDL064W	PET122	P10355	254 aa		4.16	□□□□□ -1.74
UBC9	YDL064W	UBC1	P21734	215 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
UBC9	YDL064W	URK1	P27515	501 aa		4.16	□□□□□ -1.74
UBC9	YDL064W	FSH1	P38777	243 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
UBC9	YDL064W	BST1	P43571	1029 aa		4.16	□□□□□ -1.74
UBC9	YDL064W	IMO32	P53219	342 aa		4.16	□□□□□ -1.74
UBC9	YDL064W	GFD1	Q04839	188 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
UBC9	YDL064W	HRD3	Q05787	833 aa		4.16	□□□□□ -1.74
UBC9	YDL064W	TFC6	Q06339	672 aa		4.16	□□□□□ -1.74
UBC9	YDL064W	PSR2	Q07949	397 aa		4.16	□□□□□ -1.74
UBC9	YDL064W	CRT10	Q08226	957 aa		4.16	□□□□□ -1.74
UBC9	YDL064W	LCB4	Q12246	624 aa		4.16	□□□□□ -1.74
UBC9	YDL064W	COX17	Q12287	69 aa		4.16	□□□□□ -1.74
UBC9	YDL064W	AI5_ALPHA	Q9ZZX1	630 aa		4.16	□□□□□ -1.74
UBC9	YDL064W	HEM1	P09950	548 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
UBC9	YDL064W	MTF2	P10849	440 aa		4.15	□□□□□ -1.75
UBC9	YDL064W	MAM1	P40065	302 aa		4.15	□□□□□ -1.75
UBC9	YDL064W	SMK1	P41808	388 aa		4.15	□□□□□ -1.75
UBC9	YDL064W	TDA10	P42938	290 aa		4.15	□□□□□ -1.75
UBC9	YDL064W	TAX4	P47030	604 aa		4.15	□□□□□ -1.75
UBC9	YDL064W	ZAP1	P47043	880 aa		4.15	□□□□□ -1.75
UBC9	YDL064W	YJL043W	P47053	257 aa		4.15	□□□□□ -1.75
UBC9	YDL064W	YML131W	Q03102	365 aa		4.15	□□□□□ -1.75
UBC9	YDL064W	PSY4	P38193	441 aa		4.14	□□□□□ -1.75
UBC9	YDL064W	ERC1	P38767	581 aa		4.14	□□□□□ -1.75
UBC9	YDL064W	BUD16	P39988	312 aa		4.14	□□□□□ -1.75
UBC9	YDL064W	TRM8	Q12009	286 aa		4.14	□□□□□ -1.75
UBC9	YDL064W	RTC1	Q08281	1341 aa		4.14	□□□□□ -1.75
UBC9	YDL064W	COX1	P00401	534 aa		4.13	□□□□□ -1.75
UBC9	YDL064W	SNF1	P06782	633 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
UBC9	YDL064W	LAS21	P40367	830 aa		4.13	□□□□□ -1.75
UBC9	YDL064W	FAF1	P40546	346 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
UBC9	YDL064W	SAE2	P46946	345 aa		4.13	□□□□□ -1.75
UBC9	YDL064W	NPA3	P47122	385 aa		4.13	□□□□□ -1.75
UBC9	YDL064W	YGR079W	P53249	370 aa		4.13	□□□□□ -1.75
UBC9	YDL064W	COG2	P53271	262 aa		4.13	□□□□□ -1.75
UBC9	YDL064W	PLM2	Q04383	521 aa		4.13	□□□□□ -1.75
UBC9	YDL064W	MRI1	Q06489	411 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
UBC9	YDL064W	VAM6	Q07468	1049 aa		4.13	□□□□□ -1.75
UBC9	YDL064W	CYK3	Q07533	885 aa		4.13	□□□□□ -1.75
UBC9	YDL064W	SLK19	Q08581	821 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
UBC9	YDL064W	OSW1	Q08692	278 aa		4.13	□□□□□ -1.75
UBC9	YDL064W	PRS5	Q12265	496 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
UBC9	YDL064W	RVB2	Q12464	471 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
UBC9	YDL064W	YBR255C-A	Q3E776	120 aa		4.13	□□□□□ -1.75
UBC9	YDL064W	TAD3	Q9URQ3	322 aa		4.13	□□□□□ -1.75
UBC9	YDL064W	SSM4	P40318	1319 aa		4.13	□□□□□ -1.75
UBC9	YDL064W	KGD2	P19262	463 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
UBC9	YDL064W	PDE1	P22434	369 aa		4.12	□□□□□ -1.75
UBC9	YDL064W	GCD7	P32502	381 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
UBC9	YDL064W	RPC34	P32910	317 aa		4.12	□□□□□ -1.75
UBC9	YDL064W	GEX2	P36173	615 aa		4.12	□□□□□ -1.75
UBC9	YDL064W	AXL2	P38928	823 aa		4.12	□□□□□ -1.75
UBC9	YDL064W	YMR084W	A2P2R3	262 aa		4.11	□□□□□ -1.75
UBC9	YDL064W	SES1	P07284	462 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
UBC9	YDL064W	YML003W	P0CF16	290 aa		4.11	□□□□□ -1.75
UBC9	YDL064W	GUK1	P15454	187 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
UBC9	YDL064W	RFA2	P26754	273 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75

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