RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635865.1

ATRX-220, Transcript of ATRX, chromatin remodeler, humanhuman

TSL 5

Gene ATRX, Length 100 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRX-220ENST00000635865 A0A096LNI7 61 aa-0.15□□□□□ -2.43
ATRX-220ENST00000635865 DMDP11532 3685 aa-0.16□□□□□ -2.43
ATRX-220ENST00000635865 H3BUX3 64 aa-0.16□□□□□ -2.44
ATRX-220ENST00000635865 MUC3AQ02505 3323 aa-0.16□□□□□ -2.44
ATRX-220ENST00000635865 H3BSH0 61 aa-0.17□□□□□ -2.44
ATRX-220ENST00000635865 DEFB4AO15263 64 aa-0.17□□□□□ -2.44
ATRX-220ENST00000635865 DEFB124Q8NES8 71 aa-0.17□□□□□ -2.44
ATRX-220ENST00000635865 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP-0.17□□□□□ -2.44
ATRX-220ENST00000635865 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP-0.17□□□□□ -2.44
ATRX-220ENST00000635865 HTN1P15515 57 aa-0.18□□□□□ -2.44
ATRX-220ENST00000635865 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP-0.18□□□□□ -2.44
ATRX-220ENST00000635865 ITPR2Q14571 2701 aa-0.18□□□□□ -2.44
ATRX-220ENST00000635865 WDFY4Q6ZS81 3184 aa-0.18□□□□□ -2.44
ATRX-220ENST00000635865 HERC2O95714 4834 aa-0.18□□□□□ -2.44
ATRX-220ENST00000635865 FSIP2Q5CZC0 6907 aa-0.19□□□□□ -2.44
ATRX-220ENST00000635865 MT4P47944 62 aa-0.19□□□□□ -2.44
ATRX-220ENST00000635865 DEFB133Q30KQ1 61 aa-0.19□□□□□ -2.44
ATRX-220ENST00000635865 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa-0.19□□□□□ -2.44
ATRX-220ENST00000635865 MYO15AQ9UKN7 3530 aa-0.2□□□□□ -2.44
ATRX-220ENST00000635865 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP-0.2□□□□□ -2.44
ATRX-220ENST00000635865 DNAH12Q6ZR08 3092 aa-0.2□□□□□ -2.44
ATRX-220ENST00000635865 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa-0.2□□□□□ -2.44
ATRX-220ENST00000635865 BIRC6Q9NR09 4857 aa-0.21□□□□□ -2.44
ATRX-220ENST00000635865 CEP295Q9C0D2 2601 aa-0.21□□□□□ -2.44
ATRX-220ENST00000635865 XIRP2A4UGR9 3374 aa-0.22□□□□□ -2.44
ATRX-220ENST00000635865 RNF213Q63HN8 5207 aa-0.22□□□□□ -2.44
ATRX-220ENST00000635865 SZT2Q5T011 3432 aa-0.23□□□□□ -2.45
ATRX-220ENST00000635865 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP-0.25□□□□□ -2.45
ATRX-220ENST00000635865 PCNTO95613 3336 aa-0.25□□□□□ -2.45
ATRX-220ENST00000635865 MT1GP13640 62 aa-0.25□□□□□ -2.45
ATRX-220ENST00000635865 RPS29P62273 56 aaKnown RBP-0.25□□□□□ -2.45
ATRX-220ENST00000635865 FREM2Q5SZK8 3169 aa-0.25□□□□□ -2.45
ATRX-220ENST00000635865 CEP350Q5VT06 3117 aa-0.26□□□□□ -2.45
ATRX-220ENST00000635865 DCHS1Q96JQ0 3298 aa-0.27□□□□□ -2.45
ATRX-220ENST00000635865 MT1HL1P0DM35 61 aa-0.27□□□□□ -2.45
ATRX-220ENST00000635865 CD52P31358 61 aa-0.28□□□□□ -2.45
ATRX-220ENST00000635865 RPL39P5Q59GN2 51 aa-0.28□□□□□ -2.45
ATRX-220ENST00000635865 MT2AP02795 61 aa-0.29□□□□□ -2.46
ATRX-220ENST00000635865 MT1MQ8N339 61 aa-0.29□□□□□ -2.46
ATRX-220ENST00000635865 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa-0.29□□□□□ -2.46
ATRX-220ENST00000635865 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP-0.31□□□□□ -2.46
ATRX-220ENST00000635865 RYR3Q15413 4870 aa-0.31□□□□□ -2.46
ATRX-220ENST00000635865 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa-0.31□□□□□ -2.46
ATRX-220ENST00000635865 HYDINQ4G0P3 5121 aa-0.32□□□□□ -2.46
ATRX-220ENST00000635865 LOC400499M0QZD8 3231 aa-0.32□□□□□ -2.46
ATRX-220ENST00000635865 KIAA1109Q2LD37 5005 aa-0.32□□□□□ -2.46
ATRX-220ENST00000635865 DEFB108AA8MXU0 73 aa-0.33□□□□□ -2.46
ATRX-220ENST00000635865 CENPEQ02224 2701 aa-0.34□□□□□ -2.46
ATRX-220ENST00000635865 RYR2Q92736 4967 aa-0.35□□□□□ -2.47
ATRX-220ENST00000635865 ASPMQ8IZT6 3477 aa-0.37□□□□□ -2.47
ATRX-220ENST00000635865 APELAP0DMC3 54 aa-0.38□□□□□ -2.47
ATRX-220ENST00000635865 EP400Q96L91 3159 aa-0.39□□□□□ -2.47
ATRX-220ENST00000635865 LINC01556Q5JQF7 62 aa-0.4□□□□□ -2.47
ATRX-220ENST00000635865 SPEGQ15772 3267 aa-0.4□□□□□ -2.47
ATRX-220ENST00000635865 USP34Q70CQ2 3546 aa-0.41□□□□□ -2.47
ATRX-220ENST00000635865 UNC80Q8N2C7 3258 aa-0.43□□□□□ -2.48
ATRX-220ENST00000635865 MT1BP07438 61 aa-0.43□□□□□ -2.48
ATRX-220ENST00000635865 A0A096LPF7 62 aa-0.44□□□□□ -2.48
ATRX-220ENST00000635865 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa-0.45□□□□□ -2.48
ATRX-220ENST00000635865 BRCA2P51587 3418 aa-0.47□□□□□ -2.48
ATRX-220ENST00000635865 NEBP20929 6669 aa-0.47□□□□□ -2.49
ATRX-220ENST00000635865 ABCA13Q86UQ4 5058 aa-0.48□□□□□ -2.49
ATRX-220ENST00000635865 MT1FP04733 61 aa-0.49□□□□□ -2.49
ATRX-220ENST00000635865 Q9Y3F1 56 aa-0.5□□□□□ -2.49
ATRX-220ENST00000635865 VCANP13611 3396 aa-0.52□□□□□ -2.49
ATRX-220ENST00000635865 CENPFP49454 3210 aa-0.53□□□□□ -2.49
ATRX-220ENST00000635865 UTRNP46939 3433 aa-0.55□□□□□ -2.5
ATRX-220ENST00000635865 DNAH14Q0VDD8 3507 aa-0.58□□□□□ -2.5
ATRX-220ENST00000635865 HTN3P15516 51 aa-0.59□□□□□ -2.5
ATRX-220ENST00000635865 DEFB108BQ8NET1 73 aa-0.61□□□□□ -2.51
ATRX-220ENST00000635865 VPS13AQ96RL7 3174 aa-0.62□□□□□ -2.51
ATRX-220ENST00000635865 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP-0.64□□□□□ -2.51
ATRX-220ENST00000635865 CDH23Q9H251 3354 aa-0.64□□□□□ -2.51
ATRX-220ENST00000635865 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa-0.65□□□□□ -2.51
ATRX-220ENST00000635865 COX14Q96I36 57 aa-0.67□□□□□ -2.52
ATRX-220ENST00000635865 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa-0.71□□□□□ -2.52
ATRX-220ENST00000635865 STATHP02808 62 aa-0.72□□□□□ -2.52
ATRX-220ENST00000635865 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa-0.87□□□□□ -2.55
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