RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000619938.1

DUXAP9-205, Transcript of double homeobox A pseudogene 9, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene DUXAP9, Length 642 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUXAP9-205ENST00000619938 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa3.93□□□□□ -1.78
DUXAP9-205ENST00000619938 HMCN1Q96RW7 5635 aa3.92□□□□□ -1.78
DUXAP9-205ENST00000619938 MT1MQ8N339 61 aa3.92□□□□□ -1.78
DUXAP9-205ENST00000619938 KRTAP12-1P59990 96 aa3.9□□□□□ -1.79
DUXAP9-205ENST00000619938 SMIM26A0A096LP01 95 aa3.88□□□□□ -1.79
DUXAP9-205ENST00000619938 MT1LQ93083 61 aa3.88□□□□□ -1.79
DUXAP9-205ENST00000619938 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa3.87□□□□□ -1.79
DUXAP9-205ENST00000619938 TNP1P09430 55 aa3.84□□□□□ -1.79
DUXAP9-205ENST00000619938 C10orf95Q9H7T3 257 aa3.83□□□□□ -1.8
DUXAP9-205ENST00000619938 A0A1B0GU69 56 aa3.81□□□□□ -1.8
DUXAP9-205ENST00000619938 LCE3AQ5TA76 89 aa3.81□□□□□ -1.8
DUXAP9-205ENST00000619938 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa3.81□□□□□ -1.8
DUXAP9-205ENST00000619938 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa3.79□□□□□ -1.8
DUXAP9-205ENST00000619938 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa3.79□□□□□ -1.8
DUXAP9-205ENST00000619938 COX7CP15954 63 aa3.76□□□□□ -1.81
DUXAP9-205ENST00000619938 A8MU10 97 aa3.75□□□□□ -1.81
DUXAP9-205ENST00000619938 H7BZZ5 65 aa3.71□□□□□ -1.82
DUXAP9-205ENST00000619938 KRTAP12-3P60328 96 aa3.69□□□□□ -1.82
DUXAP9-205ENST00000619938 LCE1EQ5T753 118 aa3.69□□□□□ -1.82
DUXAP9-205ENST00000619938 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa3.69□□□□□ -1.82
DUXAP9-205ENST00000619938 PRR15LQ9BU68 103 aa3.69□□□□□ -1.82
DUXAP9-205ENST00000619938 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa3.64□□□□□ -1.83
DUXAP9-205ENST00000619938 KRTAP12-4P60329 112 aa3.63□□□□□ -1.83
DUXAP9-205ENST00000619938 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa3.62□□□□□ -1.83
DUXAP9-205ENST00000619938 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
DUXAP9-205ENST00000619938 SVIPQ8NHG7 77 aa3.57□□□□□ -1.84
DUXAP9-205ENST00000619938 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
DUXAP9-205ENST00000619938 ANAPC13Q9BS18 74 aa3.55□□□□□ -1.84
DUXAP9-205ENST00000619938 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa3.53□□□□□ -1.84
DUXAP9-205ENST00000619938 UQCR11O14957 56 aa3.52□□□□□ -1.85
DUXAP9-205ENST00000619938 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa3.52□□□□□ -1.85
DUXAP9-205ENST00000619938 CCDC179H3BU77 68 aa3.48□□□□□ -1.85
DUXAP9-205ENST00000619938 K7ERS5 55 aa3.47□□□□□ -1.85
DUXAP9-205ENST00000619938 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa3.44□□□□□ -1.86
DUXAP9-205ENST00000619938 MT3P25713 68 aa3.42□□□□□ -1.86
DUXAP9-205ENST00000619938 PCP4P48539 62 aa3.41□□□□□ -1.86
DUXAP9-205ENST00000619938 MIR22HGQ0VDD5 57 aa3.41□□□□□ -1.86
DUXAP9-205ENST00000619938 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
DUXAP9-205ENST00000619938 LCE3CQ5T5A8 94 aa3.36□□□□□ -1.87
DUXAP9-205ENST00000619938 TMEM258P61165 79 aa3.34□□□□□ -1.87
DUXAP9-205ENST00000619938 MT1AP04731 61 aa3.32□□□□□ -1.88
DUXAP9-205ENST00000619938 KRTAP5-2Q701N4 177 aa3.31□□□□□ -1.88
DUXAP9-205ENST00000619938 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa3.3□□□□□ -1.88
DUXAP9-205ENST00000619938 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
DUXAP9-205ENST00000619938 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa3.28□□□□□ -1.88
DUXAP9-205ENST00000619938 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa3.27□□□□□ -1.89
DUXAP9-205ENST00000619938 V9GYY9 64 aa3.26□□□□□ -1.89
DUXAP9-205ENST00000619938 MUC5ACP98088 5654 aa3.25□□□□□ -1.89
DUXAP9-205ENST00000619938 KRTAP5-8O75690 187 aa3.23□□□□□ -1.89
DUXAP9-205ENST00000619938 A0A0A0MQY5 61 aa3.22□□□□□ -1.89
DUXAP9-205ENST00000619938 PSPHP1O15172 72 aa3.22□□□□□ -1.89
DUXAP9-205ENST00000619938 RPS28P62857 69 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
DUXAP9-205ENST00000619938 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa3.21□□□□□ -1.9
DUXAP9-205ENST00000619938 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP3.2□□□□□ -1.9
DUXAP9-205ENST00000619938 LCE1FQ5T754 118 aa3.2□□□□□ -1.9
DUXAP9-205ENST00000619938 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa3.19□□□□□ -1.9
DUXAP9-205ENST00000619938 Q1T7F1 81 aa3.15□□□□□ -1.91
DUXAP9-205ENST00000619938 A6NED7 52 aa3.14□□□□□ -1.91
DUXAP9-205ENST00000619938 ROMO1P60602 79 aa3.11□□□□□ -1.91
DUXAP9-205ENST00000619938 OBSCNQ5VST9 7968 aa3.08□□□□□ -1.92
DUXAP9-205ENST00000619938 LCE3EQ5T5B0 92 aa2.78□□□□□ -1.96
DUXAP9-205ENST00000619938 LCE1BQ5T7P3 118 aa2.71□□□□□ -1.98
DUXAP9-205ENST00000619938 NDUFAF8A1L188 74 aa2.67□□□□□ -1.98
DUXAP9-205ENST00000619938 BRK1Q8WUW1 75 aa2.66□□□□□ -1.98
DUXAP9-205ENST00000619938 PRAC1Q96KF2 57 aa2.66□□□□□ -1.98
DUXAP9-205ENST00000619938 LCE1CQ5T751 118 aa2.63□□□□□ -1.99
DUXAP9-205ENST00000619938 PRO0628Q9UI54 55 aa2.63□□□□□ -1.99
DUXAP9-205ENST00000619938 PMAIP1Q13794 54 aa2.51□□□□□ -2.01
DUXAP9-205ENST00000619938 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa2.44□□□□□ -2.02
DUXAP9-205ENST00000619938 LCE3DQ9BYE3 92 aa2.41□□□□□ -2.02
DUXAP9-205ENST00000619938 PHGR1C9JFL3 82 aa2.25□□□□□ -2.05
DUXAP9-205ENST00000619938 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa2.15□□□□□ -2.07
DUXAP9-205ENST00000619938 LUZP6Q538Z0 58 aa2.03□□□□□ -2.08
DUXAP9-205ENST00000619938 MUC19Q7Z5P9 8384 aa2.02□□□□□ -2.09
DUXAP9-205ENST00000619938 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa1.73□□□□□ -2.13
DUXAP9-205ENST00000619938 INE1O15225 51 aa1.64□□□□□ -2.15
DUXAP9-205ENST00000619938 PRM1P04553 51 aa1.56□□□□□ -2.16
DUXAP9-205ENST00000619938 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.36□□□□□ -2.19
Retrieved 78 of 20,778 RNA–protein pairs in 6.4 ms