RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000595194.1

GTPBP3-208, Transcript of GTP binding protein 3, mitochondrial, human

TSL 2

Gene GTPBP3, Length 564 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GTPBP3-208	ENST00000595194	PRR15L	Q9BU68	103 aa		7.11	□□□□□ -1.27
GTPBP3-208	ENST00000595194	KRTAP5-4	Q6L8H1	288 aa		7.09	□□□□□ -1.27
GTPBP3-208	ENST00000595194	CCDC179	H3BU77	68 aa		7.04	□□□□□ -1.28
GTPBP3-208	ENST00000595194	AHNAK2	Q8IVF2	5795 aa		7.03	□□□□□ -1.28
GTPBP3-208	ENST00000595194	ATP5E	P56381	51 aa	Predicted RBP	7.01	□□□□□ -1.29
GTPBP3-208	ENST00000595194	LINC01558	Q9Y6Z2	57 aa		7	□□□□□ -1.29
GTPBP3-208	ENST00000595194	KRTAP12-3	P60328	96 aa		6.99	□□□□□ -1.29
GTPBP3-208	ENST00000595194	KRTAP4-6	Q9BYQ5	205 aa		6.99	□□□□□ -1.29
GTPBP3-208	ENST00000595194	KRTAP4-7	Q9BYR0	210 aa		6.96	□□□□□ -1.3
GTPBP3-208	ENST00000595194	UQCR11	O14957	56 aa		6.87	□□□□□ -1.31
GTPBP3-208	ENST00000595194	KRTAP5-10	Q6L8G5	202 aa		6.87	□□□□□ -1.31
GTPBP3-208	ENST00000595194	TMEM258	P61165	79 aa		6.75	□□□□□ -1.33
GTPBP3-208	ENST00000595194	KRTAP25-1	Q3LHN0	102 aa		6.74	□□□□□ -1.33
GTPBP3-208	ENST00000595194	KRTAP5-5	Q701N2	237 aa	Predicted RBP	6.74	□□□□□ -1.33
GTPBP3-208	ENST00000595194	KRTAP20-2	Q3LI61	65 aa		6.71	□□□□□ -1.34
GTPBP3-208	ENST00000595194	MIR22HG	Q0VDD5	57 aa		6.69	□□□□□ -1.34
GTPBP3-208	ENST00000595194	KRTAP5-3	Q6L8H2	238 aa		6.68	□□□□□ -1.34
GTPBP3-208	ENST00000595194	SPRR5	A0A1B0GTR4	108 aa		6.66	□□□□□ -1.34
GTPBP3-208	ENST00000595194	KRTAP12-4	P60329	112 aa		6.63	□□□□□ -1.35
GTPBP3-208	ENST00000595194	KRTAP5-7	Q6L8G8	165 aa		6.62	□□□□□ -1.35
GTPBP3-208	ENST00000595194	LOC100996750	A0A140TA64	210 aa		6.61	□□□□□ -1.35
GTPBP3-208	ENST00000595194		K7ERS5	55 aa		6.61	□□□□□ -1.35
GTPBP3-208	ENST00000595194	KRTAP19-4	Q3LI73	84 aa		6.58	□□□□□ -1.36
GTPBP3-208	ENST00000595194	SYNE1	Q8NF91	8797 aa	Known RBP	6.57	□□□□□ -1.36
GTPBP3-208	ENST00000595194	KRTAP23-1	A1A580	65 aa		6.48	□□□□□ -1.37
GTPBP3-208	ENST00000595194	KRTAP15-1	Q3LI76	137 aa		6.47	□□□□□ -1.37
GTPBP3-208	ENST00000595194	PSPHP1	O15172	72 aa		6.46	□□□□□ -1.38
GTPBP3-208	ENST00000595194		V9GYY9	64 aa		6.44	□□□□□ -1.38
GTPBP3-208	ENST00000595194	LCE3C	Q5T5A8	94 aa		6.41	□□□□□ -1.38
GTPBP3-208	ENST00000595194		Q1T7F1	81 aa		6.38	□□□□□ -1.39
GTPBP3-208	ENST00000595194		A6NED7	52 aa		6.23	□□□□□ -1.41
GTPBP3-208	ENST00000595194	CDC42SE1	Q9NRR8	79 aa		6.23	□□□□□ -1.41
GTPBP3-208	ENST00000595194	MT1A	P04731	61 aa		6.22	□□□□□ -1.41
GTPBP3-208	ENST00000595194	KRTAP6-1	Q3LI64	71 aa		6.21	□□□□□ -1.42
GTPBP3-208	ENST00000595194	KRTAP5-2	Q701N4	177 aa		6.18	□□□□□ -1.42
GTPBP3-208	ENST00000595194	KRTAP4-11	Q9BYQ6	195 aa		6.17	□□□□□ -1.42
GTPBP3-208	ENST00000595194	ROMO1	P60602	79 aa		6.12	□□□□□ -1.43
GTPBP3-208	ENST00000595194	RPS28	P62857	69 aa	Known RBP	6.11	□□□□□ -1.43
GTPBP3-208	ENST00000595194	KRTAP9-6	A8MVA2	160 aa		6.05	□□□□□ -1.44
GTPBP3-208	ENST00000595194	KRTAP9-4	Q9BYQ2	154 aa		6.04	□□□□□ -1.44
GTPBP3-208	ENST00000595194	KRTAP5-8	O75690	187 aa		5.96	□□□□□ -1.46
GTPBP3-208	ENST00000595194	KRTAP6-2	Q3LI66	62 aa		5.96	□□□□□ -1.46
GTPBP3-208	ENST00000595194	OBSCN	Q5VST9	7968 aa		5.89	□□□□□ -1.47
GTPBP3-208	ENST00000595194	MUC5B	Q9HC84	5762 aa	Predicted RBP	5.86	□□□□□ -1.47
GTPBP3-208	ENST00000595194	AHNAK	Q09666	5890 aa	Known RBP	5.83	□□□□□ -1.48
GTPBP3-208	ENST00000595194	MUC5AC	P98088	5654 aa		5.79	□□□□□ -1.48
GTPBP3-208	ENST00000595194	MT3	P25713	68 aa		5.71	□□□□□ -1.5
GTPBP3-208	ENST00000595194	KRTAP9-9	Q9BYP9	154 aa		5.69	□□□□□ -1.5
GTPBP3-208	ENST00000595194	KRTAP5-1	Q6L8H4	278 aa		5.58	□□□□□ -1.52
GTPBP3-208	ENST00000595194	PCP4	P48539	62 aa		5.52	□□□□□ -1.53
GTPBP3-208	ENST00000595194	LCE1E	Q5T753	118 aa		5.28	□□□□□ -1.56
GTPBP3-208	ENST00000595194	BRK1	Q8WUW1	75 aa		5.09	□□□□□ -1.59
GTPBP3-208	ENST00000595194	KRTAP4-2	Q9BYR5	136 aa		5	□□□□□ -1.61
GTPBP3-208	ENST00000595194	LCE1B	Q5T7P3	118 aa		4.99	□□□□□ -1.61
GTPBP3-208	ENST00000595194	LCE1C	Q5T751	118 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GTPBP3-208	ENST00000595194	PMAIP1	Q13794	54 aa		4.78	□□□□□ -1.64
GTPBP3-208	ENST00000595194	PRAC1	Q96KF2	57 aa		4.67	□□□□□ -1.66
GTPBP3-208	ENST00000595194	KRTAP4-12	Q9BQ66	201 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GTPBP3-208	ENST00000595194	LCE3D	Q9BYE3	92 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GTPBP3-208	ENST00000595194	KRTAP5-11	Q6L8G4	156 aa		4.45	□□□□□ -1.7
GTPBP3-208	ENST00000595194	KRTAP5-6	Q6L8G9	129 aa	Predicted RBP	4.44	□□□□□ -1.7
GTPBP3-208	ENST00000595194	LCE1F	Q5T754	118 aa		4.38	□□□□□ -1.71
GTPBP3-208	ENST00000595194	LCE3E	Q5T5B0	92 aa		4.29	□□□□□ -1.72
GTPBP3-208	ENST00000595194	PRO0628	Q9UI54	55 aa		4.19	□□□□□ -1.74
GTPBP3-208	ENST00000595194	KRTAP21-2	Q3LI59	83 aa		4.09	□□□□□ -1.75
GTPBP3-208	ENST00000595194	KTN1-AS1	Q86SY8	53 aa		4.06	□□□□□ -1.76
GTPBP3-208	ENST00000595194	PHGR1	C9JFL3	82 aa		4.01	□□□□□ -1.77
GTPBP3-208	ENST00000595194	LUZP6	Q538Z0	58 aa		3.99	□□□□□ -1.77
GTPBP3-208	ENST00000595194	SVIP	Q8NHG7	77 aa		3.96	□□□□□ -1.78
GTPBP3-208	ENST00000595194	KRTAP4-4	Q9BYR3	166 aa		3.78	□□□□□ -1.8
GTPBP3-208	ENST00000595194	MUC19	Q7Z5P9	8384 aa		3.64	□□□□□ -1.83
GTPBP3-208	ENST00000595194	PRM1	P04553	51 aa		3.12	□□□□□ -1.91
GTPBP3-208	ENST00000595194	KRTAP21-1	Q3LI58	79 aa		3.05	□□□□□ -1.92
GTPBP3-208	ENST00000595194	NDUFAF8	A1L188	74 aa		2.95	□□□□□ -1.94
GTPBP3-208	ENST00000595194	MUC16	Q8WXI7	14507 aa		2.57	□□□□□ -2
GTPBP3-208	ENST00000595194	INE1	O15225	51 aa		2.32	□□□□□ -2.04
GTPBP3-208	ENST00000595194		A0A0A0MQY5	61 aa		2.23	□□□□□ -2.05
GTPBP3-208	ENST00000595194		H3BS24	57 aa		1.81	□□□□□ -2.12

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