RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583689.5

NAT9-223, Transcript of N-acetyltransferase 9 (putative), human

TSL 2

Gene NAT9, Length 563 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NAT9-223	ENST00000583689	LCE1D	Q5T752	114 aa		6.14	□□□□□ -1.43
NAT9-223	ENST00000583689	LINC01558	Q9Y6Z2	57 aa		6.12	□□□□□ -1.43
NAT9-223	ENST00000583689	LCE4A	Q5TA78	99 aa		6.09	□□□□□ -1.43
NAT9-223	ENST00000583689	HMCN1	Q96RW7	5635 aa		6.09	□□□□□ -1.43
NAT9-223	ENST00000583689	MT4	P47944	62 aa		6.07	□□□□□ -1.44
NAT9-223	ENST00000583689	KRTAP4-3	Q9BYR4	195 aa		6.04	□□□□□ -1.44
NAT9-223	ENST00000583689	RPS28	P62857	69 aa	Known RBP	6.02	□□□□□ -1.45
NAT9-223	ENST00000583689	UQCR11	O14957	56 aa		5.96	□□□□□ -1.46
NAT9-223	ENST00000583689	AHNAK2	Q8IVF2	5795 aa		5.95	□□□□□ -1.46
NAT9-223	ENST00000583689	KRTAP12-3	P60328	96 aa		5.92	□□□□□ -1.46
NAT9-223	ENST00000583689	KRTAP5-4	Q6L8H1	288 aa		5.92	□□□□□ -1.46
NAT9-223	ENST00000583689	KRTAP4-7	Q9BYR0	210 aa		5.89	□□□□□ -1.47
NAT9-223	ENST00000583689	KRTAP4-6	Q9BYQ5	205 aa		5.85	□□□□□ -1.47
NAT9-223	ENST00000583689	MIR22HG	Q0VDD5	57 aa		5.83	□□□□□ -1.48
NAT9-223	ENST00000583689	KRTAP5-10	Q6L8G5	202 aa		5.79	□□□□□ -1.48
NAT9-223	ENST00000583689	KRTAP25-1	Q3LHN0	102 aa		5.77	□□□□□ -1.49
NAT9-223	ENST00000583689		V9GYY9	64 aa		5.76	□□□□□ -1.49
NAT9-223	ENST00000583689		Q1T7F1	81 aa		5.72	□□□□□ -1.49
NAT9-223	ENST00000583689	PSPHP1	O15172	72 aa		5.71	□□□□□ -1.5
NAT9-223	ENST00000583689		K7ERS5	55 aa		5.69	□□□□□ -1.5
NAT9-223	ENST00000583689	KRTAP5-5	Q701N2	237 aa	Predicted RBP	5.66	□□□□□ -1.5
NAT9-223	ENST00000583689	KRTAP5-3	Q6L8H2	238 aa		5.63	□□□□□ -1.51
NAT9-223	ENST00000583689	KRTAP20-2	Q3LI61	65 aa		5.61	□□□□□ -1.51
NAT9-223	ENST00000583689	KRTAP5-7	Q6L8G8	165 aa		5.61	□□□□□ -1.51
NAT9-223	ENST00000583689	LOC100996750	A0A140TA64	210 aa		5.58	□□□□□ -1.52
NAT9-223	ENST00000583689	SPRR5	A0A1B0GTR4	108 aa		5.57	□□□□□ -1.52
NAT9-223	ENST00000583689	KRTAP23-1	A1A580	65 aa		5.55	□□□□□ -1.52
NAT9-223	ENST00000583689	KRTAP12-4	P60329	112 aa		5.54	□□□□□ -1.52
NAT9-223	ENST00000583689	KRTAP19-4	Q3LI73	84 aa		5.53	□□□□□ -1.52
NAT9-223	ENST00000583689	KRTAP15-1	Q3LI76	137 aa		5.51	□□□□□ -1.53
NAT9-223	ENST00000583689		A6NED7	52 aa		5.49	□□□□□ -1.53
NAT9-223	ENST00000583689	SYNE1	Q8NF91	8797 aa	Known RBP	5.45	□□□□□ -1.54
NAT9-223	ENST00000583689	LCE3C	Q5T5A8	94 aa		5.45	□□□□□ -1.54
NAT9-223	ENST00000583689	BRK1	Q8WUW1	75 aa		5.42	□□□□□ -1.54
NAT9-223	ENST00000583689	CDC42SE1	Q9NRR8	79 aa		5.4	□□□□□ -1.54
NAT9-223	ENST00000583689	PRO0628	Q9UI54	55 aa		5.37	□□□□□ -1.55
NAT9-223	ENST00000583689	ROMO1	P60602	79 aa		5.33	□□□□□ -1.56
NAT9-223	ENST00000583689	MT1A	P04731	61 aa		5.23	□□□□□ -1.57
NAT9-223	ENST00000583689	KRTAP6-1	Q3LI64	71 aa		5.22	□□□□□ -1.57
NAT9-223	ENST00000583689	KRTAP9-6	A8MVA2	160 aa		5.19	□□□□□ -1.58
NAT9-223	ENST00000583689	KRTAP4-11	Q9BYQ6	195 aa		5.18	□□□□□ -1.58
NAT9-223	ENST00000583689	KRTAP5-2	Q701N4	177 aa		5.16	□□□□□ -1.58
NAT9-223	ENST00000583689	PMAIP1	Q13794	54 aa		5.12	□□□□□ -1.59
NAT9-223	ENST00000583689	SVIP	Q8NHG7	77 aa		5.1	□□□□□ -1.59
NAT9-223	ENST00000583689	KRTAP9-4	Q9BYQ2	154 aa		5.07	□□□□□ -1.6
NAT9-223	ENST00000583689	AHNAK	Q09666	5890 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
NAT9-223	ENST00000583689	KRTAP5-8	O75690	187 aa		5	□□□□□ -1.61
NAT9-223	ENST00000583689	KRTAP6-2	Q3LI66	62 aa		4.99	□□□□□ -1.61
NAT9-223	ENST00000583689	KTN1-AS1	Q86SY8	53 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NAT9-223	ENST00000583689	OBSCN	Q5VST9	7968 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NAT9-223	ENST00000583689	MUC5AC	P98088	5654 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NAT9-223	ENST00000583689	MUC5B	Q9HC84	5762 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
NAT9-223	ENST00000583689	KRTAP9-9	Q9BYP9	154 aa		4.81	□□□□□ -1.64
NAT9-223	ENST00000583689	MT3	P25713	68 aa		4.77	□□□□□ -1.65
NAT9-223	ENST00000583689	PRAC1	Q96KF2	57 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NAT9-223	ENST00000583689	KRTAP5-1	Q6L8H4	278 aa		4.65	□□□□□ -1.67
NAT9-223	ENST00000583689	LCE1E	Q5T753	118 aa		4.4	□□□□□ -1.71
NAT9-223	ENST00000583689	KRTAP4-2	Q9BYR5	136 aa		4.19	□□□□□ -1.74
NAT9-223	ENST00000583689	LCE1B	Q5T7P3	118 aa		4.18	□□□□□ -1.74
NAT9-223	ENST00000583689	LCE1C	Q5T751	118 aa		4.09	□□□□□ -1.75
NAT9-223	ENST00000583689	LUZP6	Q538Z0	58 aa		3.95	□□□□□ -1.78
NAT9-223	ENST00000583689	LCE3D	Q9BYE3	92 aa		3.9	□□□□□ -1.79
NAT9-223	ENST00000583689	KRTAP4-12	Q9BQ66	201 aa		3.87	□□□□□ -1.79
NAT9-223	ENST00000583689	NDUFAF8	A1L188	74 aa		3.84	□□□□□ -1.79
NAT9-223	ENST00000583689	KRTAP5-6	Q6L8G9	129 aa	Predicted RBP	3.72	□□□□□ -1.81
NAT9-223	ENST00000583689	KRTAP5-11	Q6L8G4	156 aa		3.71	□□□□□ -1.82
NAT9-223	ENST00000583689	LCE3E	Q5T5B0	92 aa		3.66	□□□□□ -1.82
NAT9-223	ENST00000583689	LCE1F	Q5T754	118 aa		3.66	□□□□□ -1.82
NAT9-223	ENST00000583689		H3BS24	57 aa		3.49	□□□□□ -1.85
NAT9-223	ENST00000583689		A0A0A0MQY5	61 aa		3.47	□□□□□ -1.85
NAT9-223	ENST00000583689	KRTAP21-2	Q3LI59	83 aa		3.45	□□□□□ -1.86
NAT9-223	ENST00000583689	PHGR1	C9JFL3	82 aa		3.41	□□□□□ -1.86
NAT9-223	ENST00000583689	INE1	O15225	51 aa		3.25	□□□□□ -1.89
NAT9-223	ENST00000583689	KRTAP4-4	Q9BYR3	166 aa		3.16	□□□□□ -1.9
NAT9-223	ENST00000583689	MUC19	Q7Z5P9	8384 aa		3.07	□□□□□ -1.92
NAT9-223	ENST00000583689	PRM1	P04553	51 aa		2.74	□□□□□ -1.97
NAT9-223	ENST00000583689	KRTAP21-1	Q3LI58	79 aa		2.59	□□□□□ -1.99
NAT9-223	ENST00000583689	MUC16	Q8WXI7	14507 aa		2.13	□□□□□ -2.07

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