RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567771.5

SPNS1-209, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 3

Gene SPNS1, Length 829 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-209ENST00000567771 LOC100996750A0A140TA64 210 aa8.73□□□□□ -1.01
SPNS1-209ENST00000567771 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa8.73□□□□□ -1.01
SPNS1-209ENST00000567771 ANAPC13Q9BS18 74 aa8.7□□□□□ -1.02
SPNS1-209ENST00000567771 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa8.68□□□□□ -1.02
SPNS1-209ENST00000567771 PRR15LQ9BU68 103 aa8.64□□□□□ -1.03
SPNS1-209ENST00000567771 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa8.63□□□□□ -1.03
SPNS1-209ENST00000567771 CCDC179H3BU77 68 aa8.58□□□□□ -1.04
SPNS1-209ENST00000567771 KRTAP12-3P60328 96 aa8.58□□□□□ -1.04
SPNS1-209ENST00000567771 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa8.54□□□□□ -1.04
SPNS1-209ENST00000567771 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa8.52□□□□□ -1.05
SPNS1-209ENST00000567771 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
SPNS1-209ENST00000567771 UQCR11O14957 56 aa8.37□□□□□ -1.07
SPNS1-209ENST00000567771 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
SPNS1-209ENST00000567771 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa8.3□□□□□ -1.08
SPNS1-209ENST00000567771 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa8.29□□□□□ -1.08
SPNS1-209ENST00000567771 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa8.24□□□□□ -1.09
SPNS1-209ENST00000567771 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa8.22□□□□□ -1.09
SPNS1-209ENST00000567771 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa8.22□□□□□ -1.09
SPNS1-209ENST00000567771 TMEM258P61165 79 aa8.19□□□□□ -1.1
SPNS1-209ENST00000567771 MIR22HGQ0VDD5 57 aa8.17□□□□□ -1.1
SPNS1-209ENST00000567771 KRTAP12-4P60329 112 aa8.15□□□□□ -1.1
SPNS1-209ENST00000567771 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
SPNS1-209ENST00000567771 K7ERS5 55 aa8.03□□□□□ -1.12
SPNS1-209ENST00000567771 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa8.03□□□□□ -1.12
SPNS1-209ENST00000567771 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa7.94□□□□□ -1.14
SPNS1-209ENST00000567771 KRTAP23-1A1A580 65 aa7.91□□□□□ -1.14
SPNS1-209ENST00000567771 PSPHP1O15172 72 aa7.88□□□□□ -1.15
SPNS1-209ENST00000567771 LCE3CQ5T5A8 94 aa7.88□□□□□ -1.15
SPNS1-209ENST00000567771 V9GYY9 64 aa7.8□□□□□ -1.16
SPNS1-209ENST00000567771 Q1T7F1 81 aa7.76□□□□□ -1.17
SPNS1-209ENST00000567771 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa7.69□□□□□ -1.18
SPNS1-209ENST00000567771 MT1AP04731 61 aa7.68□□□□□ -1.18
SPNS1-209ENST00000567771 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa7.67□□□□□ -1.18
SPNS1-209ENST00000567771 KRTAP5-2Q701N4 177 aa7.65□□□□□ -1.18
SPNS1-209ENST00000567771 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa7.63□□□□□ -1.19
SPNS1-209ENST00000567771 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa7.59□□□□□ -1.19
SPNS1-209ENST00000567771 A6NED7 52 aa7.57□□□□□ -1.2
SPNS1-209ENST00000567771 PCP4P48539 62 aa7.54□□□□□ -1.2
SPNS1-209ENST00000567771 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa7.5□□□□□ -1.21
SPNS1-209ENST00000567771 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa7.5□□□□□ -1.21
SPNS1-209ENST00000567771 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa7.48□□□□□ -1.21
SPNS1-209ENST00000567771 ROMO1P60602 79 aa7.46□□□□□ -1.22
SPNS1-209ENST00000567771 RPS28P62857 69 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
SPNS1-209ENST00000567771 KRTAP5-8O75690 187 aa7.39□□□□□ -1.23
SPNS1-209ENST00000567771 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa7.37□□□□□ -1.23
SPNS1-209ENST00000567771 OBSCNQ5VST9 7968 aa7.27□□□□□ -1.25
SPNS1-209ENST00000567771 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
SPNS1-209ENST00000567771 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
SPNS1-209ENST00000567771 MUC5ACP98088 5654 aa7.16□□□□□ -1.26
SPNS1-209ENST00000567771 H3BS24 57 aa7.14□□□□□ -1.27
SPNS1-209ENST00000567771 MT3P25713 68 aa7.04□□□□□ -1.28
SPNS1-209ENST00000567771 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa6.91□□□□□ -1.3
SPNS1-209ENST00000567771 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa6.81□□□□□ -1.32
SPNS1-209ENST00000567771 LCE1EQ5T753 118 aa6.5□□□□□ -1.37
SPNS1-209ENST00000567771 BRK1Q8WUW1 75 aa6.25□□□□□ -1.41
SPNS1-209ENST00000567771 LCE1BQ5T7P3 118 aa6.17□□□□□ -1.42
SPNS1-209ENST00000567771 PRO0628Q9UI54 55 aa6.06□□□□□ -1.44
SPNS1-209ENST00000567771 LCE1CQ5T751 118 aa6.04□□□□□ -1.44
SPNS1-209ENST00000567771 PMAIP1Q13794 54 aa5.93□□□□□ -1.46
SPNS1-209ENST00000567771 PRAC1Q96KF2 57 aa5.69□□□□□ -1.5
SPNS1-209ENST00000567771 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa5.63□□□□□ -1.51
SPNS1-209ENST00000567771 LCE3DQ9BYE3 92 aa5.63□□□□□ -1.51
SPNS1-209ENST00000567771 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa5.49□□□□□ -1.53
SPNS1-209ENST00000567771 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP5.46□□□□□ -1.54
SPNS1-209ENST00000567771 LCE1FQ5T754 118 aa5.39□□□□□ -1.55
SPNS1-209ENST00000567771 SVIPQ8NHG7 77 aa5.29□□□□□ -1.56
SPNS1-209ENST00000567771 LCE3EQ5T5B0 92 aa5.25□□□□□ -1.57
SPNS1-209ENST00000567771 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa5.05□□□□□ -1.6
SPNS1-209ENST00000567771 PHGR1C9JFL3 82 aa4.97□□□□□ -1.61
SPNS1-209ENST00000567771 LUZP6Q538Z0 58 aa4.79□□□□□ -1.64
SPNS1-209ENST00000567771 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa4.69□□□□□ -1.66
SPNS1-209ENST00000567771 MUC19Q7Z5P9 8384 aa4.47□□□□□ -1.69
SPNS1-209ENST00000567771 NDUFAF8A1L188 74 aa4.29□□□□□ -1.72
SPNS1-209ENST00000567771 A0A0A0MQY5 61 aa3.97□□□□□ -1.77
SPNS1-209ENST00000567771 PRM1P04553 51 aa3.81□□□□□ -1.8
SPNS1-209ENST00000567771 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa3.76□□□□□ -1.81
SPNS1-209ENST00000567771 INE1O15225 51 aa3.65□□□□□ -1.83
SPNS1-209ENST00000567771 MUC16Q8WXI7 14507 aa3.16□□□□□ -1.9
Retrieved 78 of 20,778 RNA–protein pairs in 80.8 ms