RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567642.1

PPP4C-211, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, humanhuman

TSL 2

Gene PPP4C, Length 658 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4C-211ENST00000567642 CCDC179H3BU77 68 aa7.26□□□□□ -1.25
PPP4C-211ENST00000567642 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
PPP4C-211ENST00000567642 HMCN1Q96RW7 5635 aa7.19□□□□□ -1.26
PPP4C-211ENST00000567642 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa7.18□□□□□ -1.26
PPP4C-211ENST00000567642 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa7.15□□□□□ -1.26
PPP4C-211ENST00000567642 KRTAP12-3P60328 96 aa7.12□□□□□ -1.27
PPP4C-211ENST00000567642 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa7.09□□□□□ -1.27
PPP4C-211ENST00000567642 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa7.08□□□□□ -1.28
PPP4C-211ENST00000567642 UQCR11O14957 56 aa7.06□□□□□ -1.28
PPP4C-211ENST00000567642 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa7.01□□□□□ -1.29
PPP4C-211ENST00000567642 TMEM258P61165 79 aa6.95□□□□□ -1.3
PPP4C-211ENST00000567642 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa6.92□□□□□ -1.3
PPP4C-211ENST00000567642 MIR22HGQ0VDD5 57 aa6.89□□□□□ -1.31
PPP4C-211ENST00000567642 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa6.89□□□□□ -1.31
PPP4C-211ENST00000567642 K7ERS5 55 aa6.82□□□□□ -1.32
PPP4C-211ENST00000567642 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
PPP4C-211ENST00000567642 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa6.79□□□□□ -1.32
PPP4C-211ENST00000567642 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa6.76□□□□□ -1.33
PPP4C-211ENST00000567642 LOC100996750A0A140TA64 210 aa6.73□□□□□ -1.33
PPP4C-211ENST00000567642 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa6.72□□□□□ -1.33
PPP4C-211ENST00000567642 KRTAP12-4P60329 112 aa6.72□□□□□ -1.33
PPP4C-211ENST00000567642 PSPHP1O15172 72 aa6.68□□□□□ -1.34
PPP4C-211ENST00000567642 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa6.68□□□□□ -1.34
PPP4C-211ENST00000567642 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa6.65□□□□□ -1.34
PPP4C-211ENST00000567642 V9GYY9 64 aa6.64□□□□□ -1.35
PPP4C-211ENST00000567642 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa6.6□□□□□ -1.35
PPP4C-211ENST00000567642 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
PPP4C-211ENST00000567642 KRTAP23-1A1A580 65 aa6.58□□□□□ -1.36
PPP4C-211ENST00000567642 Q1T7F1 81 aa6.56□□□□□ -1.36
PPP4C-211ENST00000567642 LCE3CQ5T5A8 94 aa6.53□□□□□ -1.36
PPP4C-211ENST00000567642 A6NED7 52 aa6.44□□□□□ -1.38
PPP4C-211ENST00000567642 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa6.41□□□□□ -1.38
PPP4C-211ENST00000567642 MT1AP04731 61 aa6.33□□□□□ -1.4
PPP4C-211ENST00000567642 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa6.31□□□□□ -1.4
PPP4C-211ENST00000567642 ROMO1P60602 79 aa6.29□□□□□ -1.4
PPP4C-211ENST00000567642 RPS28P62857 69 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
PPP4C-211ENST00000567642 KRTAP5-2Q701N4 177 aa6.24□□□□□ -1.41
PPP4C-211ENST00000567642 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa6.24□□□□□ -1.41
PPP4C-211ENST00000567642 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa6.15□□□□□ -1.42
PPP4C-211ENST00000567642 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa6.14□□□□□ -1.43
PPP4C-211ENST00000567642 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa6.07□□□□□ -1.44
PPP4C-211ENST00000567642 KRTAP5-8O75690 187 aa6.02□□□□□ -1.45
PPP4C-211ENST00000567642 OBSCNQ5VST9 7968 aa5.89□□□□□ -1.47
PPP4C-211ENST00000567642 MT3P25713 68 aa5.81□□□□□ -1.48
PPP4C-211ENST00000567642 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa5.77□□□□□ -1.49
PPP4C-211ENST00000567642 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP5.76□□□□□ -1.49
PPP4C-211ENST00000567642 PCP4P48539 62 aa5.75□□□□□ -1.49
PPP4C-211ENST00000567642 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
PPP4C-211ENST00000567642 MUC5ACP98088 5654 aa5.74□□□□□ -1.49
PPP4C-211ENST00000567642 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa5.63□□□□□ -1.51
PPP4C-211ENST00000567642 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa5.55□□□□□ -1.52
PPP4C-211ENST00000567642 LCE1EQ5T753 118 aa5.32□□□□□ -1.56
PPP4C-211ENST00000567642 BRK1Q8WUW1 75 aa5.31□□□□□ -1.56
PPP4C-211ENST00000567642 LCE1BQ5T7P3 118 aa5.11□□□□□ -1.59
PPP4C-211ENST00000567642 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa5.06□□□□□ -1.6
PPP4C-211ENST00000567642 PMAIP1Q13794 54 aa4.97□□□□□ -1.61
PPP4C-211ENST00000567642 LCE1CQ5T751 118 aa4.95□□□□□ -1.62
PPP4C-211ENST00000567642 PRAC1Q96KF2 57 aa4.86□□□□□ -1.63
PPP4C-211ENST00000567642 LCE3DQ9BYE3 92 aa4.69□□□□□ -1.66
PPP4C-211ENST00000567642 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa4.5□□□□□ -1.69
PPP4C-211ENST00000567642 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP4.46□□□□□ -1.7
PPP4C-211ENST00000567642 LCE1FQ5T754 118 aa4.41□□□□□ -1.7
PPP4C-211ENST00000567642 H3BS24 57 aa4.39□□□□□ -1.71
PPP4C-211ENST00000567642 LCE3EQ5T5B0 92 aa4.39□□□□□ -1.71
PPP4C-211ENST00000567642 PRO0628Q9UI54 55 aa4.34□□□□□ -1.71
PPP4C-211ENST00000567642 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa4.24□□□□□ -1.73
PPP4C-211ENST00000567642 SVIPQ8NHG7 77 aa4.18□□□□□ -1.74
PPP4C-211ENST00000567642 LUZP6Q538Z0 58 aa4.16□□□□□ -1.74
PPP4C-211ENST00000567642 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa4.13□□□□□ -1.75
PPP4C-211ENST00000567642 PHGR1C9JFL3 82 aa4.07□□□□□ -1.76
PPP4C-211ENST00000567642 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa3.87□□□□□ -1.79
PPP4C-211ENST00000567642 MUC19Q7Z5P9 8384 aa3.63□□□□□ -1.83
PPP4C-211ENST00000567642 PRM1P04553 51 aa3.22□□□□□ -1.89
PPP4C-211ENST00000567642 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa3.08□□□□□ -1.92
PPP4C-211ENST00000567642 NDUFAF8A1L188 74 aa3.06□□□□□ -1.92
PPP4C-211ENST00000567642 MUC16Q8WXI7 14507 aa2.58□□□□□ -2
PPP4C-211ENST00000567642 INE1O15225 51 aa2.37□□□□□ -2.03
PPP4C-211ENST00000567642 A0A0A0MQY5 61 aa2.26□□□□□ -2.05
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