RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560971.1

GCSHP2-201, Transcript of glycine cleavage system protein H pseudogene 2, humanhuman

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Gene GCSHP2, Length 527 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSHP2-201ENST00000560971 LCE3AQ5TA76 89 aa6.79□□□□□ -1.32
GCSHP2-201ENST00000560971 V9GYY9 64 aa6.78□□□□□ -1.32
GCSHP2-201ENST00000560971 Q1T7F1 81 aa6.77□□□□□ -1.33
GCSHP2-201ENST00000560971 LCE1DQ5T752 114 aa6.74□□□□□ -1.33
GCSHP2-201ENST00000560971 LCE4AQ5TA78 99 aa6.73□□□□□ -1.33
GCSHP2-201ENST00000560971 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
GCSHP2-201ENST00000560971 MT1GP13640 62 aa6.66□□□□□ -1.34
GCSHP2-201ENST00000560971 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa6.66□□□□□ -1.34
GCSHP2-201ENST00000560971 MT1LQ93083 61 aa6.64□□□□□ -1.35
GCSHP2-201ENST00000560971 PCP4P48539 62 aa6.62□□□□□ -1.35
GCSHP2-201ENST00000560971 K7ERS5 55 aa6.6□□□□□ -1.35
GCSHP2-201ENST00000560971 PP632Q6XCG6 107 aa6.58□□□□□ -1.36
GCSHP2-201ENST00000560971 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa6.57□□□□□ -1.36
GCSHP2-201ENST00000560971 MT1MQ8N339 61 aa6.57□□□□□ -1.36
GCSHP2-201ENST00000560971 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa6.55□□□□□ -1.36
GCSHP2-201ENST00000560971 A6NED7 52 aa6.54□□□□□ -1.36
GCSHP2-201ENST00000560971 RPS28P62857 69 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
GCSHP2-201ENST00000560971 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa6.52□□□□□ -1.37
GCSHP2-201ENST00000560971 KRTAP12-3P60328 96 aa6.51□□□□□ -1.37
GCSHP2-201ENST00000560971 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa6.46□□□□□ -1.38
GCSHP2-201ENST00000560971 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa6.39□□□□□ -1.39
GCSHP2-201ENST00000560971 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa6.33□□□□□ -1.4
GCSHP2-201ENST00000560971 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa6.3□□□□□ -1.4
GCSHP2-201ENST00000560971 KRTAP23-1A1A580 65 aa6.27□□□□□ -1.41
GCSHP2-201ENST00000560971 ROMO1P60602 79 aa6.23□□□□□ -1.41
GCSHP2-201ENST00000560971 HMCN1Q96RW7 5635 aa6.19□□□□□ -1.42
GCSHP2-201ENST00000560971 MT4P47944 62 aa6.18□□□□□ -1.42
GCSHP2-201ENST00000560971 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa6.15□□□□□ -1.42
GCSHP2-201ENST00000560971 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa6.13□□□□□ -1.43
GCSHP2-201ENST00000560971 GPR98Q8WXG9 6306 aa6.08□□□□□ -1.44
GCSHP2-201ENST00000560971 LCE3CQ5T5A8 94 aa6.02□□□□□ -1.45
GCSHP2-201ENST00000560971 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP6.01□□□□□ -1.45
GCSHP2-201ENST00000560971 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa5.91□□□□□ -1.46
GCSHP2-201ENST00000560971 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa5.81□□□□□ -1.48
GCSHP2-201ENST00000560971 KRTAP12-4P60329 112 aa5.79□□□□□ -1.48
GCSHP2-201ENST00000560971 BRK1Q8WUW1 75 aa5.79□□□□□ -1.48
GCSHP2-201ENST00000560971 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa5.78□□□□□ -1.48
GCSHP2-201ENST00000560971 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
GCSHP2-201ENST00000560971 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa5.71□□□□□ -1.5
GCSHP2-201ENST00000560971 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa5.67□□□□□ -1.5
GCSHP2-201ENST00000560971 MT1AP04731 61 aa5.63□□□□□ -1.51
GCSHP2-201ENST00000560971 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa5.63□□□□□ -1.51
GCSHP2-201ENST00000560971 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa5.62□□□□□ -1.51
GCSHP2-201ENST00000560971 PMAIP1Q13794 54 aa5.43□□□□□ -1.54
GCSHP2-201ENST00000560971 KRTAP5-2Q701N4 177 aa5.43□□□□□ -1.54
GCSHP2-201ENST00000560971 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa5.41□□□□□ -1.54
GCSHP2-201ENST00000560971 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa5.34□□□□□ -1.55
GCSHP2-201ENST00000560971 PRAC1Q96KF2 57 aa5.25□□□□□ -1.57
GCSHP2-201ENST00000560971 MT3P25713 68 aa5.14□□□□□ -1.59
GCSHP2-201ENST00000560971 PRO0628Q9UI54 55 aa5.12□□□□□ -1.59
GCSHP2-201ENST00000560971 KRTAP5-8O75690 187 aa5.08□□□□□ -1.6
GCSHP2-201ENST00000560971 OBSCNQ5VST9 7968 aa5.06□□□□□ -1.6
GCSHP2-201ENST00000560971 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa4.87□□□□□ -1.63
GCSHP2-201ENST00000560971 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa4.84□□□□□ -1.63
GCSHP2-201ENST00000560971 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.64
GCSHP2-201ENST00000560971 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
GCSHP2-201ENST00000560971 MUC5ACP98088 5654 aa4.81□□□□□ -1.64
GCSHP2-201ENST00000560971 SVIPQ8NHG7 77 aa4.68□□□□□ -1.66
GCSHP2-201ENST00000560971 LCE1EQ5T753 118 aa4.67□□□□□ -1.66
GCSHP2-201ENST00000560971 LCE1BQ5T7P3 118 aa4.43□□□□□ -1.7
GCSHP2-201ENST00000560971 LCE3DQ9BYE3 92 aa4.36□□□□□ -1.71
GCSHP2-201ENST00000560971 LUZP6Q538Z0 58 aa4.34□□□□□ -1.71
GCSHP2-201ENST00000560971 LCE1CQ5T751 118 aa4.34□□□□□ -1.71
GCSHP2-201ENST00000560971 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa4.3□□□□□ -1.72
GCSHP2-201ENST00000560971 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP4.22□□□□□ -1.73
GCSHP2-201ENST00000560971 LCE3EQ5T5B0 92 aa4.12□□□□□ -1.75
GCSHP2-201ENST00000560971 A0A0A0MQY5 61 aa3.92□□□□□ -1.78
GCSHP2-201ENST00000560971 LCE1FQ5T754 118 aa3.8□□□□□ -1.8
GCSHP2-201ENST00000560971 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa3.7□□□□□ -1.82
GCSHP2-201ENST00000560971 NDUFAF8A1L188 74 aa3.63□□□□□ -1.83
GCSHP2-201ENST00000560971 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa3.56□□□□□ -1.84
GCSHP2-201ENST00000560971 PHGR1C9JFL3 82 aa3.39□□□□□ -1.87
GCSHP2-201ENST00000560971 PRM1P04553 51 aa3.21□□□□□ -1.9
GCSHP2-201ENST00000560971 MUC19Q7Z5P9 8384 aa3.09□□□□□ -1.91
GCSHP2-201ENST00000560971 INE1O15225 51 aa2.88□□□□□ -1.95
GCSHP2-201ENST00000560971 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa2.48□□□□□ -2.01
GCSHP2-201ENST00000560971 MUC16Q8WXI7 14507 aa2.22□□□□□ -2.05
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