RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551253.5

CS-225, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 676 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-225ENST00000551253 PLAC4Q8WY50 150 aa2.92□□□□□ -1.94
CS-225ENST00000551253 PRO2289Q9P1D8 64 aa2.92□□□□□ -1.94
CS-225ENST00000551253 A8MU10 97 aa2.9□□□□□ -1.95
CS-225ENST00000551253 MT1XP80297 61 aa2.89□□□□□ -1.95
CS-225ENST00000551253 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa2.88□□□□□ -1.95
CS-225ENST00000551253 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa2.88□□□□□ -1.95
CS-225ENST00000551253 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa2.85□□□□□ -1.95
CS-225ENST00000551253 A0A0A0MQY5 61 aa2.84□□□□□ -1.95
CS-225ENST00000551253 LCE5AQ5TCM9 118 aa2.84□□□□□ -1.95
CS-225ENST00000551253 PRAC1Q96KF2 57 aa2.83□□□□□ -1.96
CS-225ENST00000551253 SPATA8Q6RVD6 105 aa2.82□□□□□ -1.96
CS-225ENST00000551253 A0A1B0GU33 70 aa2.81□□□□□ -1.96
CS-225ENST00000551253 A0A1B0GU69 56 aa2.8□□□□□ -1.96
CS-225ENST00000551253 ROMO1P60602 79 aa2.8□□□□□ -1.96
CS-225ENST00000551253 UQCR11O14957 56 aa2.77□□□□□ -1.97
CS-225ENST00000551253 A0A0D9SG42 100 aa2.76□□□□□ -1.97
CS-225ENST00000551253 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa2.76□□□□□ -1.97
CS-225ENST00000551253 KRTAP5-8O75690 187 aa2.75□□□□□ -1.97
CS-225ENST00000551253 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
CS-225ENST00000551253 KRTAP10-12P60413 245 aa2.75□□□□□ -1.97
CS-225ENST00000551253 MIR22HGQ0VDD5 57 aa2.75□□□□□ -1.97
CS-225ENST00000551253 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa2.74□□□□□ -1.97
CS-225ENST00000551253 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa2.74□□□□□ -1.97
CS-225ENST00000551253 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa2.74□□□□□ -1.97
CS-225ENST00000551253 KRTAP12-1P59990 96 aa2.72□□□□□ -1.97
CS-225ENST00000551253 SPINT4Q6UDR6 99 aa2.72□□□□□ -1.97
CS-225ENST00000551253 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa2.7□□□□□ -1.98
CS-225ENST00000551253 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa2.69□□□□□ -1.98
CS-225ENST00000551253 K7ERS5 55 aa2.68□□□□□ -1.98
CS-225ENST00000551253 LOC100996750A0A140TA64 210 aa2.62□□□□□ -1.99
CS-225ENST00000551253 LUZP6Q538Z0 58 aa2.6□□□□□ -1.99
CS-225ENST00000551253 C10orf95Q9H7T3 257 aa2.59□□□□□ -1.99
CS-225ENST00000551253 TNP1P09430 55 aa2.58□□□□□ -2
CS-225ENST00000551253 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa2.58□□□□□ -2
CS-225ENST00000551253 MT1EP04732 61 aa2.57□□□□□ -2
CS-225ENST00000551253 KRTAP5-2Q701N4 177 aa2.57□□□□□ -2
CS-225ENST00000551253 NDUFAF8A1L188 74 aa2.56□□□□□ -2
CS-225ENST00000551253 MT1GP13640 62 aa2.56□□□□□ -2
CS-225ENST00000551253 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa2.55□□□□□ -2
CS-225ENST00000551253 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
CS-225ENST00000551253 PP632Q6XCG6 107 aa2.54□□□□□ -2
CS-225ENST00000551253 KRTAP12-4P60329 112 aa2.53□□□□□ -2
CS-225ENST00000551253 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa2.52□□□□□ -2.01
CS-225ENST00000551253 LCE3AQ5TA76 89 aa2.52□□□□□ -2.01
CS-225ENST00000551253 MT1MQ8N339 61 aa2.48□□□□□ -2.01
CS-225ENST00000551253 MT1LQ93083 61 aa2.45□□□□□ -2.02
CS-225ENST00000551253 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa2.45□□□□□ -2.02
CS-225ENST00000551253 OBSCNQ5VST9 7968 aa2.45□□□□□ -2.02
CS-225ENST00000551253 KRTAP12-3P60328 96 aa2.43□□□□□ -2.02
CS-225ENST00000551253 KRTAP23-1A1A580 65 aa2.42□□□□□ -2.02
CS-225ENST00000551253 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP2.36□□□□□ -2.03
CS-225ENST00000551253 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa2.34□□□□□ -2.03
CS-225ENST00000551253 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa2.33□□□□□ -2.04
CS-225ENST00000551253 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa2.28□□□□□ -2.04
CS-225ENST00000551253 INE1O15225 51 aa2.25□□□□□ -2.05
CS-225ENST00000551253 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa2.25□□□□□ -2.05
CS-225ENST00000551253 LCE3CQ5T5A8 94 aa2.24□□□□□ -2.05
CS-225ENST00000551253 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa2.11□□□□□ -2.07
CS-225ENST00000551253 MT1AP04731 61 aa2.1□□□□□ -2.07
CS-225ENST00000551253 PHGR1C9JFL3 82 aa2.09□□□□□ -2.07
CS-225ENST00000551253 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa2.06□□□□□ -2.08
CS-225ENST00000551253 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa2.05□□□□□ -2.08
CS-225ENST00000551253 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa1.97□□□□□ -2.09
CS-225ENST00000551253 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa1.92□□□□□ -2.1
CS-225ENST00000551253 MT3P25713 68 aa1.91□□□□□ -2.1
CS-225ENST00000551253 LCE1EQ5T753 118 aa1.89□□□□□ -2.11
CS-225ENST00000551253 LCE1FQ5T754 118 aa1.83□□□□□ -2.12
CS-225ENST00000551253 LCE1BQ5T7P3 118 aa1.82□□□□□ -2.12
CS-225ENST00000551253 LCE1CQ5T751 118 aa1.75□□□□□ -2.13
CS-225ENST00000551253 LCE3DQ9BYE3 92 aa1.64□□□□□ -2.15
CS-225ENST00000551253 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa1.6□□□□□ -2.15
CS-225ENST00000551253 MUC19Q7Z5P9 8384 aa1.57□□□□□ -2.16
CS-225ENST00000551253 LCE3EQ5T5B0 92 aa1.56□□□□□ -2.16
CS-225ENST00000551253 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP1.5□□□□□ -2.17
CS-225ENST00000551253 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa1.36□□□□□ -2.19
CS-225ENST00000551253 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa1.32□□□□□ -2.2
CS-225ENST00000551253 PRM1P04553 51 aa1.31□□□□□ -2.2
CS-225ENST00000551253 MUC16Q8WXI7 14507 aa0.99□□□□□ -2.25
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