RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550078.2

ZBED6-202, Transcript of zinc finger BED-type containing 6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ZBED6, Length 12,481 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED6-202ENST00000550078 LPAP08519 4548 aa1.59□□□□□ -2.15
ZBED6-202ENST00000550078 MT1XP80297 61 aa1.58□□□□□ -2.16
ZBED6-202ENST00000550078 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP1.58□□□□□ -2.16
ZBED6-202ENST00000550078 PCLOQ9Y6V0 5065 aa1.57□□□□□ -2.16
ZBED6-202ENST00000550078 RYR2Q92736 4967 aa1.57□□□□□ -2.16
ZBED6-202ENST00000550078 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP1.57□□□□□ -2.16
ZBED6-202ENST00000550078 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP1.56□□□□□ -2.16
ZBED6-202ENST00000550078 HSPG2P98160 4391 aa1.56□□□□□ -2.16
ZBED6-202ENST00000550078 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP1.56□□□□□ -2.16
ZBED6-202ENST00000550078 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP1.55□□□□□ -2.16
ZBED6-202ENST00000550078 TNXBP22105 4242 aa1.55□□□□□ -2.16
ZBED6-202ENST00000550078 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa1.54□□□□□ -2.16
ZBED6-202ENST00000550078 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa1.53□□□□□ -2.16
ZBED6-202ENST00000550078 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa1.53□□□□□ -2.16
ZBED6-202ENST00000550078 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa1.53□□□□□ -2.16
ZBED6-202ENST00000550078 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa1.53□□□□□ -2.16
ZBED6-202ENST00000550078 HYDINQ4G0P3 5121 aa1.53□□□□□ -2.16
ZBED6-202ENST00000550078 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa1.52□□□□□ -2.17
ZBED6-202ENST00000550078 HERC2O95714 4834 aa1.52□□□□□ -2.17
ZBED6-202ENST00000550078 MUC17Q685J3 4493 aa1.52□□□□□ -2.17
ZBED6-202ENST00000550078 RYR3Q15413 4870 aa1.51□□□□□ -2.17
ZBED6-202ENST00000550078 HERC1Q15751 4861 aa1.51□□□□□ -2.17
ZBED6-202ENST00000550078 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa1.5□□□□□ -2.17
ZBED6-202ENST00000550078 MT1BP07438 61 aa1.5□□□□□ -2.17
ZBED6-202ENST00000550078 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa1.5□□□□□ -2.17
ZBED6-202ENST00000550078 MT1MQ8N339 61 aa1.5□□□□□ -2.17
ZBED6-202ENST00000550078 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa1.49□□□□□ -2.17
ZBED6-202ENST00000550078 GPR98Q8WXG9 6306 aa1.49□□□□□ -2.17
ZBED6-202ENST00000550078 OBSCNQ5VST9 7968 aa1.48□□□□□ -2.17
ZBED6-202ENST00000550078 KIAA1109Q2LD37 5005 aa1.48□□□□□ -2.17
ZBED6-202ENST00000550078 MT1LQ93083 61 aa1.48□□□□□ -2.17
ZBED6-202ENST00000550078 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa1.48□□□□□ -2.17
ZBED6-202ENST00000550078 NEBP20929 6669 aa1.47□□□□□ -2.17
ZBED6-202ENST00000550078 MT1EP04732 61 aa1.46□□□□□ -2.18
ZBED6-202ENST00000550078 LRP2P98164 4655 aa1.46□□□□□ -2.18
ZBED6-202ENST00000550078 ABCA13Q86UQ4 5058 aa1.44□□□□□ -2.18
ZBED6-202ENST00000550078 STARD9Q9P2P6 4700 aa1.44□□□□□ -2.18
ZBED6-202ENST00000550078 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP1.4□□□□□ -2.19
ZBED6-202ENST00000550078 UBR4Q5T4S7 5183 aa1.39□□□□□ -2.19
ZBED6-202ENST00000550078 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa1.38□□□□□ -2.19
ZBED6-202ENST00000550078 MUC2Q02817 5179 aa1.37□□□□□ -2.19
ZBED6-202ENST00000550078 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP1.37□□□□□ -2.19
ZBED6-202ENST00000550078 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa1.34□□□□□ -2.19
ZBED6-202ENST00000550078 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa1.34□□□□□ -2.2
ZBED6-202ENST00000550078 MUC19Q7Z5P9 8384 aa1.33□□□□□ -2.2
ZBED6-202ENST00000550078 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa1.33□□□□□ -2.2
ZBED6-202ENST00000550078 MDN1Q9NU22 5596 aa1.33□□□□□ -2.2
ZBED6-202ENST00000550078 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa1.32□□□□□ -2.2
ZBED6-202ENST00000550078 MT1AP04731 61 aa1.31□□□□□ -2.2
ZBED6-202ENST00000550078 HMCN2Q8NDA2 5059 aa1.3□□□□□ -2.2
ZBED6-202ENST00000550078 RNF213Q63HN8 5207 aa1.27□□□□□ -2.21
ZBED6-202ENST00000550078 KMT2DO14686 5537 aa1.26□□□□□ -2.21
ZBED6-202ENST00000550078 USH2AO75445 5202 aa1.24□□□□□ -2.21
ZBED6-202ENST00000550078 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP1.22□□□□□ -2.21
ZBED6-202ENST00000550078 PHGR1C9JFL3 82 aa1.21□□□□□ -2.22
ZBED6-202ENST00000550078 FAT4Q6V0I7 4981 aa1.18□□□□□ -2.22
ZBED6-202ENST00000550078 SSPOA2VEC9 5147 aa1.16□□□□□ -2.22
ZBED6-202ENST00000550078 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP1.16□□□□□ -2.22
ZBED6-202ENST00000550078 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP1.14□□□□□ -2.23
ZBED6-202ENST00000550078 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa1.07□□□□□ -2.24
ZBED6-202ENST00000550078 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa1.04□□□□□ -2.24
ZBED6-202ENST00000550078 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa1.04□□□□□ -2.24
ZBED6-202ENST00000550078 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP1.04□□□□□ -2.24
ZBED6-202ENST00000550078 HMCN1Q96RW7 5635 aa1.02□□□□□ -2.25
ZBED6-202ENST00000550078 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa0.97□□□□□ -2.25
ZBED6-202ENST00000550078 MUC5ACP98088 5654 aa0.95□□□□□ -2.26
ZBED6-202ENST00000550078 KRTAP5-9P26371 169 aa0.91□□□□□ -2.26
ZBED6-202ENST00000550078 KRTAP5-8O75690 187 aa0.9□□□□□ -2.27
ZBED6-202ENST00000550078 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa0.82□□□□□ -2.28
ZBED6-202ENST00000550078 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa0.77□□□□□ -2.29
ZBED6-202ENST00000550078 KRTAP5-2Q701N4 177 aa0.76□□□□□ -2.29
ZBED6-202ENST00000550078 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa0.69□□□□□ -2.3
ZBED6-202ENST00000550078 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP0.68□□□□□ -2.3
ZBED6-202ENST00000550078 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa0.67□□□□□ -2.3
ZBED6-202ENST00000550078 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa0.58□□□□□ -2.32
ZBED6-202ENST00000550078 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa0.58□□□□□ -2.32
ZBED6-202ENST00000550078 MUC16Q8WXI7 14507 aa0.55□□□□□ -2.32
Retrieved 77 of 20,778 RNA–protein pairs in 129.1 ms