RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529454.5

RPS6KA1-215, Transcript of ribosomal protein S6 kinase A1, human

TSL 5

Gene RPS6KA1, Length 544 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPS6KA1-215	ENST00000529454		A8MU10	97 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RPS6KA1-215	ENST00000529454	COX7C	P15954	63 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPS6KA1-215	ENST00000529454		H7BZZ5	65 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPS6KA1-215	ENST00000529454	KRTAP12-3	P60328	96 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPS6KA1-215	ENST00000529454	PRR15L	Q9BU68	103 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPS6KA1-215	ENST00000529454	KRTAP4-7	Q9BYR0	210 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPS6KA1-215	ENST00000529454	KRTAP5-7	Q6L8G8	165 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPS6KA1-215	ENST00000529454	KRTAP5-3	Q6L8H2	238 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPS6KA1-215	ENST00000529454	KRTAP20-2	Q3LI61	65 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RPS6KA1-215	ENST00000529454	KRTAP12-4	P60329	112 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RPS6KA1-215	ENST00000529454	SPRR5	A0A1B0GTR4	108 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RPS6KA1-215	ENST00000529454	KRTAP5-5	Q701N2	237 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
RPS6KA1-215	ENST00000529454	ANAPC13	Q9BS18	74 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RPS6KA1-215	ENST00000529454	ATP5E	P56381	51 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
RPS6KA1-215	ENST00000529454	UQCR11	O14957	56 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RPS6KA1-215	ENST00000529454	KRTAP25-1	Q3LHN0	102 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RPS6KA1-215	ENST00000529454	LINC01558	Q9Y6Z2	57 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RPS6KA1-215	ENST00000529454	LOC100996750	A0A140TA64	210 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPS6KA1-215	ENST00000529454	KRTAP19-4	Q3LI73	84 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPS6KA1-215	ENST00000529454		K7ERS5	55 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPS6KA1-215	ENST00000529454	CCDC179	H3BU77	68 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPS6KA1-215	ENST00000529454	SYNE1	Q8NF91	8797 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
RPS6KA1-215	ENST00000529454	MIR22HG	Q0VDD5	57 aa		4.51	□□□□□ -1.69
RPS6KA1-215	ENST00000529454	SVIP	Q8NHG7	77 aa		4.49	□□□□□ -1.69
RPS6KA1-215	ENST00000529454	KRTAP15-1	Q3LI76	137 aa		4.47	□□□□□ -1.69
RPS6KA1-215	ENST00000529454	LCE3C	Q5T5A8	94 aa		4.45	□□□□□ -1.7
RPS6KA1-215	ENST00000529454	KRTAP4-11	Q9BYQ6	195 aa		4.45	□□□□□ -1.7
RPS6KA1-215	ENST00000529454	KRTAP23-1	A1A580	65 aa		4.4	□□□□□ -1.71
RPS6KA1-215	ENST00000529454	TMEM258	P61165	79 aa		4.4	□□□□□ -1.71
RPS6KA1-215	ENST00000529454	MT1A	P04731	61 aa		4.38	□□□□□ -1.71
RPS6KA1-215	ENST00000529454	KRTAP5-2	Q701N4	177 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RPS6KA1-215	ENST00000529454	KRTAP6-1	Q3LI64	71 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RPS6KA1-215	ENST00000529454	PSPHP1	O15172	72 aa		4.28	□□□□□ -1.72
RPS6KA1-215	ENST00000529454		V9GYY9	64 aa		4.28	□□□□□ -1.72
RPS6KA1-215	ENST00000529454	KRTAP5-8	O75690	187 aa		4.27	□□□□□ -1.73
RPS6KA1-215	ENST00000529454	KRTAP9-4	Q9BYQ2	154 aa		4.26	□□□□□ -1.73
RPS6KA1-215	ENST00000529454	RPS28	P62857	69 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
RPS6KA1-215	ENST00000529454	CDC42SE1	Q9NRR8	79 aa		4.24	□□□□□ -1.73
RPS6KA1-215	ENST00000529454	KRTAP6-2	Q3LI66	62 aa		4.23	□□□□□ -1.73
RPS6KA1-215	ENST00000529454	AHNAK	Q09666	5890 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.73
RPS6KA1-215	ENST00000529454	KRTAP9-9	Q9BYP9	154 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RPS6KA1-215	ENST00000529454	MUC5AC	P98088	5654 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RPS6KA1-215	ENST00000529454		Q1T7F1	81 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RPS6KA1-215	ENST00000529454		A6NED7	52 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RPS6KA1-215	ENST00000529454	MUC5B	Q9HC84	5762 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
RPS6KA1-215	ENST00000529454	KRTAP9-6	A8MVA2	160 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RPS6KA1-215	ENST00000529454	ROMO1	P60602	79 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RPS6KA1-215	ENST00000529454	OBSCN	Q5VST9	7968 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RPS6KA1-215	ENST00000529454	MT3	P25713	68 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RPS6KA1-215	ENST00000529454		H3BS24	57 aa		4.01	□□□□□ -1.77
RPS6KA1-215	ENST00000529454	KRTAP5-1	Q6L8H4	278 aa		3.95	□□□□□ -1.78
RPS6KA1-215	ENST00000529454	PCP4	P48539	62 aa		3.9	□□□□□ -1.79
RPS6KA1-215	ENST00000529454	LCE1E	Q5T753	118 aa		3.73	□□□□□ -1.81
RPS6KA1-215	ENST00000529454	LCE1B	Q5T7P3	118 aa		3.6	□□□□□ -1.83
RPS6KA1-215	ENST00000529454	KRTAP4-2	Q9BYR5	136 aa		3.52	□□□□□ -1.85
RPS6KA1-215	ENST00000529454		A0A0A0MQY5	61 aa		3.5	□□□□□ -1.85
RPS6KA1-215	ENST00000529454	LCE1C	Q5T751	118 aa		3.46	□□□□□ -1.86
RPS6KA1-215	ENST00000529454	KRTAP4-12	Q9BQ66	201 aa		3.33	□□□□□ -1.88
RPS6KA1-215	ENST00000529454	BRK1	Q8WUW1	75 aa		3.26	□□□□□ -1.89
RPS6KA1-215	ENST00000529454	LCE3D	Q9BYE3	92 aa		3.18	□□□□□ -1.9
RPS6KA1-215	ENST00000529454	KRTAP5-11	Q6L8G4	156 aa		3.16	□□□□□ -1.9
RPS6KA1-215	ENST00000529454	PRO0628	Q9UI54	55 aa		3.15	□□□□□ -1.91
RPS6KA1-215	ENST00000529454	LCE1F	Q5T754	118 aa		3.14	□□□□□ -1.91
RPS6KA1-215	ENST00000529454	KRTAP5-6	Q6L8G9	129 aa	Predicted RBP	3.09	□□□□□ -1.91
RPS6KA1-215	ENST00000529454	PMAIP1	Q13794	54 aa		3.04	□□□□□ -1.92
RPS6KA1-215	ENST00000529454	PHGR1	C9JFL3	82 aa		2.98	□□□□□ -1.93
RPS6KA1-215	ENST00000529454	PRAC1	Q96KF2	57 aa		2.96	□□□□□ -1.94
RPS6KA1-215	ENST00000529454	LCE3E	Q5T5B0	92 aa		2.95	□□□□□ -1.94
RPS6KA1-215	ENST00000529454	KTN1-AS1	Q86SY8	53 aa		2.92	□□□□□ -1.94
RPS6KA1-215	ENST00000529454	KRTAP21-2	Q3LI59	83 aa		2.84	□□□□□ -1.95
RPS6KA1-215	ENST00000529454	KRTAP4-4	Q9BYR3	166 aa		2.69	□□□□□ -1.98
RPS6KA1-215	ENST00000529454	LUZP6	Q538Z0	58 aa		2.67	□□□□□ -1.98
RPS6KA1-215	ENST00000529454	NDUFAF8	A1L188	74 aa		2.62	□□□□□ -1.99
RPS6KA1-215	ENST00000529454	MUC19	Q7Z5P9	8384 aa		2.55	□□□□□ -2
RPS6KA1-215	ENST00000529454	KRTAP21-1	Q3LI58	79 aa		2.27	□□□□□ -2.05
RPS6KA1-215	ENST00000529454	PRM1	P04553	51 aa		2.08	□□□□□ -2.08
RPS6KA1-215	ENST00000529454	INE1	O15225	51 aa		1.9	□□□□□ -2.11
RPS6KA1-215	ENST00000529454	MUC16	Q8WXI7	14507 aa		1.78	□□□□□ -2.12

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