RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511276.1

FAM53C-208, Transcript of family with sequence similarity 53 member C, human

TSL 4

Gene FAM53C, Length 571 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM53C-208	ENST00000511276	KRTAP19-7	Q3SYF9	63 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FAM53C-208	ENST00000511276	KRTAP4-6	Q9BYQ5	205 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FAM53C-208	ENST00000511276		A6NED7	52 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FAM53C-208	ENST00000511276	MT1E	P04732	61 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FAM53C-208	ENST00000511276	MIR22HG	Q0VDD5	57 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FAM53C-208	ENST00000511276	KRTAP5-4	Q6L8H1	288 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FAM53C-208	ENST00000511276		A0A0D9SG42	100 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FAM53C-208	ENST00000511276		A8MU10	97 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FAM53C-208	ENST00000511276	CDC42SE1	Q9NRR8	79 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FAM53C-208	ENST00000511276	MT1G	P13640	62 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FAM53C-208	ENST00000511276	KRTAP12-1	P59990	96 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FAM53C-208	ENST00000511276	SPINT4	Q6UDR6	99 aa		4.79	□□□□□ -1.64
FAM53C-208	ENST00000511276	PP632	Q6XCG6	107 aa		4.79	□□□□□ -1.64
FAM53C-208	ENST00000511276		K7ERS5	55 aa		4.76	□□□□□ -1.65
FAM53C-208	ENST00000511276	MT1M	Q8N339	61 aa		4.76	□□□□□ -1.65
FAM53C-208	ENST00000511276	BRK1	Q8WUW1	75 aa		4.75	□□□□□ -1.65
FAM53C-208	ENST00000511276	CAMK2N1	Q7Z7J9	78 aa		4.74	□□□□□ -1.65
FAM53C-208	ENST00000511276	KRTAP4-3	Q9BYR4	195 aa		4.69	□□□□□ -1.66
FAM53C-208	ENST00000511276	KRTAP20-2	Q3LI61	65 aa		4.68	□□□□□ -1.66
FAM53C-208	ENST00000511276	KRTAP19-5	Q3LI72	72 aa		4.67	□□□□□ -1.66
FAM53C-208	ENST00000511276	MT1L	Q93083	61 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FAM53C-208	ENST00000511276	PRO0628	Q9UI54	55 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FAM53C-208	ENST00000511276	C10orf95	Q9H7T3	257 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FAM53C-208	ENST00000511276	ROMO1	P60602	79 aa		4.52	□□□□□ -1.69
FAM53C-208	ENST00000511276	TNP1	P09430	55 aa		4.5	□□□□□ -1.69
FAM53C-208	ENST00000511276	PMAIP1	Q13794	54 aa		4.49	□□□□□ -1.69
FAM53C-208	ENST00000511276	KRTAP25-1	Q3LHN0	102 aa		4.48	□□□□□ -1.69
FAM53C-208	ENST00000511276	AHNAK	Q09666	5890 aa	Known RBP	4.45	□□□□□ -1.7
FAM53C-208	ENST00000511276	KRTAP12-4	P60329	112 aa		4.45	□□□□□ -1.7
FAM53C-208	ENST00000511276	MUC5AC	P98088	5654 aa		4.43	□□□□□ -1.7
FAM53C-208	ENST00000511276	KRTAP5-5	Q701N2	237 aa	Predicted RBP	4.42	□□□□□ -1.7
FAM53C-208	ENST00000511276	KRTAP4-11	Q9BYQ6	195 aa		4.42	□□□□□ -1.7
FAM53C-208	ENST00000511276	KRTAP4-7	Q9BYR0	210 aa		4.4	□□□□□ -1.71
FAM53C-208	ENST00000511276	SYNE1	Q8NF91	8797 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
FAM53C-208	ENST00000511276	KRTAP23-1	A1A580	65 aa		4.35	□□□□□ -1.71
FAM53C-208	ENST00000511276	KRTAP5-8	O75690	187 aa		4.33	□□□□□ -1.72
FAM53C-208	ENST00000511276	MUC5B	Q9HC84	5762 aa	Predicted RBP	4.33	□□□□□ -1.72
FAM53C-208	ENST00000511276	LCE3A	Q5TA76	89 aa		4.32	□□□□□ -1.72
FAM53C-208	ENST00000511276	KTN1-AS1	Q86SY8	53 aa		4.27	□□□□□ -1.73
FAM53C-208	ENST00000511276	LOC100996750	A0A140TA64	210 aa		4.2	□□□□□ -1.74
FAM53C-208	ENST00000511276	PRAC1	Q96KF2	57 aa		4.19	□□□□□ -1.74
FAM53C-208	ENST00000511276	KRTAP5-2	Q701N4	177 aa		4.18	□□□□□ -1.74
FAM53C-208	ENST00000511276	KRTAP9-9	Q9BYP9	154 aa		4.18	□□□□□ -1.74
FAM53C-208	ENST00000511276	KRTAP12-3	P60328	96 aa		4.17	□□□□□ -1.74
FAM53C-208	ENST00000511276	OBSCN	Q5VST9	7968 aa		4.1	□□□□□ -1.75
FAM53C-208	ENST00000511276	KRTAP15-1	Q3LI76	137 aa		4.04	□□□□□ -1.76
FAM53C-208	ENST00000511276	KRTAP19-4	Q3LI73	84 aa		4.01	□□□□□ -1.77
FAM53C-208	ENST00000511276	SVIP	Q8NHG7	77 aa		3.99	□□□□□ -1.77
FAM53C-208	ENST00000511276	KRTAP6-1	Q3LI64	71 aa		3.95	□□□□□ -1.78
FAM53C-208	ENST00000511276	MT1A	P04731	61 aa		3.92	□□□□□ -1.78
FAM53C-208	ENST00000511276	KRTAP6-2	Q3LI66	62 aa		3.89	□□□□□ -1.79
FAM53C-208	ENST00000511276	KRTAP5-1	Q6L8H4	278 aa		3.88	□□□□□ -1.79
FAM53C-208	ENST00000511276	KRTAP9-4	Q9BYQ2	154 aa		3.88	□□□□□ -1.79
FAM53C-208	ENST00000511276	LCE3C	Q5T5A8	94 aa		3.87	□□□□□ -1.79
FAM53C-208	ENST00000511276	KRTAP9-6	A8MVA2	160 aa		3.64	□□□□□ -1.83
FAM53C-208	ENST00000511276	MT3	P25713	68 aa		3.61	□□□□□ -1.83
FAM53C-208	ENST00000511276	LUZP6	Q538Z0	58 aa		3.49	□□□□□ -1.85
FAM53C-208	ENST00000511276	LCE1E	Q5T753	118 aa		3.46	□□□□□ -1.86
FAM53C-208	ENST00000511276	KRTAP4-2	Q9BYR5	136 aa		3.35	□□□□□ -1.87
FAM53C-208	ENST00000511276	LCE1B	Q5T7P3	118 aa		3.34	□□□□□ -1.87
FAM53C-208	ENST00000511276	KRTAP4-12	Q9BQ66	201 aa		3.29	□□□□□ -1.88
FAM53C-208	ENST00000511276	NDUFAF8	A1L188	74 aa		3.24	□□□□□ -1.89
FAM53C-208	ENST00000511276	LCE1C	Q5T751	118 aa		3.22	□□□□□ -1.89
FAM53C-208	ENST00000511276	KRTAP5-11	Q6L8G4	156 aa		3.11	□□□□□ -1.91
FAM53C-208	ENST00000511276	PHGR1	C9JFL3	82 aa		3.08	□□□□□ -1.92
FAM53C-208	ENST00000511276	LCE1F	Q5T754	118 aa		3.03	□□□□□ -1.92
FAM53C-208	ENST00000511276	LCE3D	Q9BYE3	92 aa		2.88	□□□□□ -1.95
FAM53C-208	ENST00000511276	KRTAP5-6	Q6L8G9	129 aa	Predicted RBP	2.84	□□□□□ -1.95
FAM53C-208	ENST00000511276		A0A0A0MQY5	61 aa		2.83	□□□□□ -1.96
FAM53C-208	ENST00000511276	LCE3E	Q5T5B0	92 aa		2.78	□□□□□ -1.96
FAM53C-208	ENST00000511276	INE1	O15225	51 aa		2.72	□□□□□ -1.97
FAM53C-208	ENST00000511276	KRTAP21-2	Q3LI59	83 aa		2.6	□□□□□ -1.99
FAM53C-208	ENST00000511276	MUC19	Q7Z5P9	8384 aa		2.55	□□□□□ -2
FAM53C-208	ENST00000511276	KRTAP4-4	Q9BYR3	166 aa		2.51	□□□□□ -2.01
FAM53C-208	ENST00000511276		H3BS24	57 aa		2.5	□□□□□ -2.01
FAM53C-208	ENST00000511276	KRTAP21-1	Q3LI58	79 aa		2.34	□□□□□ -2.03
FAM53C-208	ENST00000511276	PRM1	P04553	51 aa		2.33	□□□□□ -2.04
FAM53C-208	ENST00000511276	MUC16	Q8WXI7	14507 aa		1.79	□□□□□ -2.12

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