RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000505700.1

HOXC-AS1-201, HOXC cluster antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXC-AS1, Length 548 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS1-201ENST00000505700 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa8.11□□□□□ -1.11
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MT4P47944 62 aa8.09□□□□□ -1.11
HOXC-AS1-201ENST00000505700 UQCR11O14957 56 aa8.01□□□□□ -1.13
HOXC-AS1-201ENST00000505700 KRTAP12-3P60328 96 aa7.98□□□□□ -1.13
HOXC-AS1-201ENST00000505700 HMCN1Q96RW7 5635 aa7.97□□□□□ -1.13
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TMEM258P61165 79 aa7.96□□□□□ -1.14
HOXC-AS1-201ENST00000505700 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa7.93□□□□□ -1.14
HOXC-AS1-201ENST00000505700 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa7.9□□□□□ -1.14
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MIR22HGQ0VDD5 57 aa7.83□□□□□ -1.16
HOXC-AS1-201ENST00000505700 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa7.82□□□□□ -1.16
HOXC-AS1-201ENST00000505700 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa7.78□□□□□ -1.16
HOXC-AS1-201ENST00000505700 K7ERS5 55 aa7.73□□□□□ -1.17
HOXC-AS1-201ENST00000505700 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa7.71□□□□□ -1.17
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PSPHP1O15172 72 aa7.62□□□□□ -1.19
HOXC-AS1-201ENST00000505700 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa7.6□□□□□ -1.19
HOXC-AS1-201ENST00000505700 V9GYY9 64 aa7.6□□□□□ -1.19
HOXC-AS1-201ENST00000505700 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
HOXC-AS1-201ENST00000505700 Q1T7F1 81 aa7.51□□□□□ -1.21
HOXC-AS1-201ENST00000505700 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa7.51□□□□□ -1.21
HOXC-AS1-201ENST00000505700 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa7.49□□□□□ -1.21
HOXC-AS1-201ENST00000505700 LOC100996750A0A140TA64 210 aa7.48□□□□□ -1.21
HOXC-AS1-201ENST00000505700 KRTAP12-4P60329 112 aa7.47□□□□□ -1.21
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa7.46□□□□□ -1.22
HOXC-AS1-201ENST00000505700 KRTAP23-1A1A580 65 aa7.45□□□□□ -1.22
HOXC-AS1-201ENST00000505700 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa7.43□□□□□ -1.22
HOXC-AS1-201ENST00000505700 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa7.42□□□□□ -1.22
HOXC-AS1-201ENST00000505700 A6NED7 52 aa7.35□□□□□ -1.23
HOXC-AS1-201ENST00000505700 LCE3CQ5T5A8 94 aa7.33□□□□□ -1.24
HOXC-AS1-201ENST00000505700 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa7.33□□□□□ -1.24
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa7.28□□□□□ -1.24
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ROMO1P60602 79 aa7.15□□□□□ -1.26
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RPS28P62857 69 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MT1AP04731 61 aa7.05□□□□□ -1.28
HOXC-AS1-201ENST00000505700 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa7.02□□□□□ -1.29
HOXC-AS1-201ENST00000505700 KRTAP5-2Q701N4 177 aa6.92□□□□□ -1.3
HOXC-AS1-201ENST00000505700 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa6.89□□□□□ -1.31
HOXC-AS1-201ENST00000505700 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa6.89□□□□□ -1.31
HOXC-AS1-201ENST00000505700 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa6.84□□□□□ -1.31
HOXC-AS1-201ENST00000505700 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa6.74□□□□□ -1.33
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PCP4P48539 62 aa6.73□□□□□ -1.33
HOXC-AS1-201ENST00000505700 KRTAP5-8O75690 187 aa6.64□□□□□ -1.35
HOXC-AS1-201ENST00000505700 OBSCNQ5VST9 7968 aa6.53□□□□□ -1.36
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MT3P25713 68 aa6.47□□□□□ -1.37
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MUC5ACP98088 5654 aa6.36□□□□□ -1.39
HOXC-AS1-201ENST00000505700 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa6.36□□□□□ -1.39
HOXC-AS1-201ENST00000505700 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.4
HOXC-AS1-201ENST00000505700 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa6.23□□□□□ -1.41
HOXC-AS1-201ENST00000505700 BRK1Q8WUW1 75 aa6.14□□□□□ -1.43
HOXC-AS1-201ENST00000505700 LCE1EQ5T753 118 aa5.94□□□□□ -1.46
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PMAIP1Q13794 54 aa5.76□□□□□ -1.49
HOXC-AS1-201ENST00000505700 LCE1BQ5T7P3 118 aa5.66□□□□□ -1.5
HOXC-AS1-201ENST00000505700 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa5.61□□□□□ -1.51
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PRAC1Q96KF2 57 aa5.59□□□□□ -1.51
HOXC-AS1-201ENST00000505700 LCE1CQ5T751 118 aa5.51□□□□□ -1.53
HOXC-AS1-201ENST00000505700 LCE3DQ9BYE3 92 aa5.28□□□□□ -1.56
HOXC-AS1-201ENST00000505700 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa5.18□□□□□ -1.58
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PRO0628Q9UI54 55 aa5.11□□□□□ -1.59
HOXC-AS1-201ENST00000505700 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa4.99□□□□□ -1.61
HOXC-AS1-201ENST00000505700 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP4.98□□□□□ -1.61
HOXC-AS1-201ENST00000505700 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa4.95□□□□□ -1.62
HOXC-AS1-201ENST00000505700 LCE3EQ5T5B0 92 aa4.94□□□□□ -1.62
HOXC-AS1-201ENST00000505700 LCE1FQ5T754 118 aa4.89□□□□□ -1.63
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SVIPQ8NHG7 77 aa4.86□□□□□ -1.63
HOXC-AS1-201ENST00000505700 LUZP6Q538Z0 58 aa4.79□□□□□ -1.64
HOXC-AS1-201ENST00000505700 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa4.61□□□□□ -1.67
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PHGR1C9JFL3 82 aa4.47□□□□□ -1.69
HOXC-AS1-201ENST00000505700 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa4.29□□□□□ -1.72
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MUC19Q7Z5P9 8384 aa4.02□□□□□ -1.77
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PRM1P04553 51 aa3.65□□□□□ -1.83
HOXC-AS1-201ENST00000505700 NDUFAF8A1L188 74 aa3.6□□□□□ -1.83
HOXC-AS1-201ENST00000505700 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa3.39□□□□□ -1.87
HOXC-AS1-201ENST00000505700 H3BS24 57 aa3.3□□□□□ -1.88
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MUC16Q8WXI7 14507 aa2.87□□□□□ -1.95
HOXC-AS1-201ENST00000505700 INE1O15225 51 aa2.82□□□□□ -1.96
HOXC-AS1-201ENST00000505700 A0A0A0MQY5 61 aa2.69□□□□□ -1.98
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