RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498804.1

TRBVA-201, Transcript of T cell receptor beta variable A (pseudogene), humanhuman

BASIC

Gene TRBVA, Length 316 nt, Biotype TR V pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBVA-201ENST00000498804 M0QZ58 72 aa-0.09□□□□□ -2.42
TRBVA-201ENST00000498804 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa-0.09□□□□□ -2.42
TRBVA-201ENST00000498804 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa-0.09□□□□□ -2.42
TRBVA-201ENST00000498804 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa-0.09□□□□□ -2.42
TRBVA-201ENST00000498804 TOMM7Q9P0U1 55 aa-0.09□□□□□ -2.42
TRBVA-201ENST00000498804 RYR2Q92736 4967 aa-0.09□□□□□ -2.42
TRBVA-201ENST00000498804 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa-0.1□□□□□ -2.43
TRBVA-201ENST00000498804 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa-0.1□□□□□ -2.43
TRBVA-201ENST00000498804 PCNTO95613 3336 aa-0.1□□□□□ -2.43
TRBVA-201ENST00000498804 CEP250Q9BV73 2442 aa-0.1□□□□□ -2.43
TRBVA-201ENST00000498804 MT1GP13640 62 aa-0.1□□□□□ -2.43
TRBVA-201ENST00000498804 CFAP46Q8IYW2 2715 aa-0.1□□□□□ -2.43
TRBVA-201ENST00000498804 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP-0.1□□□□□ -2.43
TRBVA-201ENST00000498804 LRBAP50851 2863 aa-0.11□□□□□ -2.43
TRBVA-201ENST00000498804 DEFB1P60022 68 aa-0.11□□□□□ -2.43
TRBVA-201ENST00000498804 ABCA13Q86UQ4 5058 aa-0.11□□□□□ -2.43
TRBVA-201ENST00000498804 SPART-AS1P0CW21 52 aa-0.12□□□□□ -2.43
TRBVA-201ENST00000498804 FREM2Q5SZK8 3169 aa-0.12□□□□□ -2.43
TRBVA-201ENST00000498804 A0A096LNI7 61 aa-0.13□□□□□ -2.43
TRBVA-201ENST00000498804 MT1HP80294 61 aa-0.13□□□□□ -2.43
TRBVA-201ENST00000498804 LINC01590Q5TEZ4 76 aa-0.13□□□□□ -2.43
TRBVA-201ENST00000498804 MT1LQ93083 61 aa-0.13□□□□□ -2.43
TRBVA-201ENST00000498804 ITPR2Q14571 2701 aa-0.13□□□□□ -2.43
TRBVA-201ENST00000498804 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP-0.13□□□□□ -2.43
TRBVA-201ENST00000498804 VCANP13611 3396 aa-0.13□□□□□ -2.43
TRBVA-201ENST00000498804 DNAH12Q6ZR08 3092 aa-0.13□□□□□ -2.43
TRBVA-201ENST00000498804 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa-0.13□□□□□ -2.43
TRBVA-201ENST00000498804 BRCA2P51587 3418 aa-0.13□□□□□ -2.43
TRBVA-201ENST00000498804 FRYLO94915 3013 aa-0.14□□□□□ -2.43
TRBVA-201ENST00000498804 MT1EP04732 61 aa-0.14□□□□□ -2.43
TRBVA-201ENST00000498804 MT1XP80297 61 aa-0.14□□□□□ -2.43
TRBVA-201ENST00000498804 DEFB136Q30KP8 78 aa-0.14□□□□□ -2.43
TRBVA-201ENST00000498804 SPEGQ15772 3267 aa-0.14□□□□□ -2.43
TRBVA-201ENST00000498804 MYO9AB2RTY4 2548 aa-0.15□□□□□ -2.43
TRBVA-201ENST00000498804 CEP350Q5VT06 3117 aa-0.15□□□□□ -2.43
TRBVA-201ENST00000498804 DNAH14Q0VDD8 3507 aa-0.15□□□□□ -2.43
TRBVA-201ENST00000498804 DEFB4AO15263 64 aa-0.15□□□□□ -2.43
TRBVA-201ENST00000498804 MT4P47944 62 aa-0.15□□□□□ -2.43
TRBVA-201ENST00000498804 LOC400499M0QZD8 3231 aa-0.15□□□□□ -2.43
TRBVA-201ENST00000498804 UTRNP46939 3433 aa-0.16□□□□□ -2.44
TRBVA-201ENST00000498804 CEP295Q9C0D2 2601 aa-0.17□□□□□ -2.44
TRBVA-201ENST00000498804 PRCDQ00LT1 54 aa-0.17□□□□□ -2.44
TRBVA-201ENST00000498804 MT1MQ8N339 61 aa-0.17□□□□□ -2.44
TRBVA-201ENST00000498804 RPL39P5Q59GN2 51 aa-0.18□□□□□ -2.44
TRBVA-201ENST00000498804 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa-0.18□□□□□ -2.44
TRBVA-201ENST00000498804 EP400Q96L91 3159 aa-0.19□□□□□ -2.44
TRBVA-201ENST00000498804 K7EIM0 57 aa-0.19□□□□□ -2.44
TRBVA-201ENST00000498804 APELAP0DMC3 54 aa-0.19□□□□□ -2.44
TRBVA-201ENST00000498804 CENPEQ02224 2701 aa-0.19□□□□□ -2.44
TRBVA-201ENST00000498804 CENPFP49454 3210 aa-0.21□□□□□ -2.44
TRBVA-201ENST00000498804 NEBP20929 6669 aa-0.21□□□□□ -2.44
TRBVA-201ENST00000498804 DEFB108AA8MXU0 73 aa-0.21□□□□□ -2.44
TRBVA-201ENST00000498804 MT1BP07438 61 aa-0.21□□□□□ -2.44
TRBVA-201ENST00000498804 VPS13AQ96RL7 3174 aa-0.21□□□□□ -2.44
TRBVA-201ENST00000498804 MT2AP02795 61 aa-0.22□□□□□ -2.44
TRBVA-201ENST00000498804 HTN1P15515 57 aa-0.22□□□□□ -2.44
TRBVA-201ENST00000498804 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa-0.22□□□□□ -2.44
TRBVA-201ENST00000498804 CDH23Q9H251 3354 aa-0.22□□□□□ -2.45
TRBVA-201ENST00000498804 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa-0.23□□□□□ -2.45
TRBVA-201ENST00000498804 DEFB124Q8NES8 71 aa-0.23□□□□□ -2.45
TRBVA-201ENST00000498804 A0A096LPF7 62 aa-0.24□□□□□ -2.45
TRBVA-201ENST00000498804 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa-0.25□□□□□ -2.45
TRBVA-201ENST00000498804 DEFB133Q30KQ1 61 aa-0.26□□□□□ -2.45
TRBVA-201ENST00000498804 MT1FP04733 61 aa-0.28□□□□□ -2.45
TRBVA-201ENST00000498804 MT1HL1P0DM35 61 aa-0.28□□□□□ -2.45
TRBVA-201ENST00000498804 LINC01556Q5JQF7 62 aa-0.28□□□□□ -2.45
TRBVA-201ENST00000498804 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP-0.28□□□□□ -2.45
TRBVA-201ENST00000498804 STATHP02808 62 aa-0.29□□□□□ -2.46
TRBVA-201ENST00000498804 RPS29P62273 56 aaKnown RBP-0.3□□□□□ -2.46
TRBVA-201ENST00000498804 H3BUX3 64 aa-0.31□□□□□ -2.46
TRBVA-201ENST00000498804 HTN3P15516 51 aa-0.35□□□□□ -2.47
TRBVA-201ENST00000498804 DEFB108BQ8NET1 73 aa-0.35□□□□□ -2.47
TRBVA-201ENST00000498804 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa-0.37□□□□□ -2.47
TRBVA-201ENST00000498804 CD52P31358 61 aa-0.39□□□□□ -2.47
TRBVA-201ENST00000498804 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa-0.4□□□□□ -2.47
TRBVA-201ENST00000498804 COX14Q96I36 57 aa-0.45□□□□□ -2.48
TRBVA-201ENST00000498804 Q9Y3F1 56 aa-0.54□□□□□ -2.5
Retrieved 77 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.3 ms