RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496887.6

KCNQ1-205, Transcript of potassium voltage-gated channel subfamily Q member 1, humanhuman

TSL 5

Gene KCNQ1, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ1-205ENST00000496887 MT1GP13640 62 aa6.06□□□□□ -1.44
KCNQ1-205ENST00000496887 PSPHP1O15172 72 aa6.05□□□□□ -1.44
KCNQ1-205ENST00000496887 MT1LQ93083 61 aa6.02□□□□□ -1.45
KCNQ1-205ENST00000496887 PP632Q6XCG6 107 aa6□□□□□ -1.45
KCNQ1-205ENST00000496887 K7ERS5 55 aa5.98□□□□□ -1.45
KCNQ1-205ENST00000496887 MT1MQ8N339 61 aa5.97□□□□□ -1.45
KCNQ1-205ENST00000496887 A6NED7 52 aa5.9□□□□□ -1.46
KCNQ1-205ENST00000496887 KRTAP12-3P60328 96 aa5.89□□□□□ -1.47
KCNQ1-205ENST00000496887 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa5.89□□□□□ -1.47
KCNQ1-205ENST00000496887 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa5.85□□□□□ -1.47
KCNQ1-205ENST00000496887 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa5.82□□□□□ -1.48
KCNQ1-205ENST00000496887 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa5.75□□□□□ -1.49
KCNQ1-205ENST00000496887 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa5.73□□□□□ -1.49
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KCNQ1-205ENST00000496887 LCE1DQ5T752 114 aa5.68□□□□□ -1.5
KCNQ1-205ENST00000496887 KRTAP23-1A1A580 65 aa5.66□□□□□ -1.5
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KCNQ1-205ENST00000496887 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa5.62□□□□□ -1.51
KCNQ1-205ENST00000496887 HMCN1Q96RW7 5635 aa5.62□□□□□ -1.51
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KCNQ1-205ENST00000496887 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
KCNQ1-205ENST00000496887 LOC100996750A0A140TA64 210 aa5.44□□□□□ -1.54
KCNQ1-205ENST00000496887 LCE3CQ5T5A8 94 aa5.44□□□□□ -1.54
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KCNQ1-205ENST00000496887 KRTAP12-4P60329 112 aa5.29□□□□□ -1.56
KCNQ1-205ENST00000496887 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa5.27□□□□□ -1.57
KCNQ1-205ENST00000496887 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP5.21□□□□□ -1.57
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KCNQ1-205ENST00000496887 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa4.98□□□□□ -1.61
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KCNQ1-205ENST00000496887 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa4.94□□□□□ -1.62
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KCNQ1-205ENST00000496887 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa4.81□□□□□ -1.64
KCNQ1-205ENST00000496887 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa4.72□□□□□ -1.65
KCNQ1-205ENST00000496887 PRAC1Q96KF2 57 aa4.72□□□□□ -1.65
KCNQ1-205ENST00000496887 MT3P25713 68 aa4.67□□□□□ -1.66
KCNQ1-205ENST00000496887 KRTAP5-8O75690 187 aa4.65□□□□□ -1.67
KCNQ1-205ENST00000496887 OBSCNQ5VST9 7968 aa4.62□□□□□ -1.67
KCNQ1-205ENST00000496887 SVIPQ8NHG7 77 aa4.46□□□□□ -1.7
KCNQ1-205ENST00000496887 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa4.41□□□□□ -1.7
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KCNQ1-205ENST00000496887 H3BS24 57 aa3.96□□□□□ -1.78
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KCNQ1-205ENST00000496887 LCE3EQ5T5B0 92 aa3.72□□□□□ -1.81
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KCNQ1-205ENST00000496887 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa3.07□□□□□ -1.92
KCNQ1-205ENST00000496887 A0A0A0MQY5 61 aa3.04□□□□□ -1.92
KCNQ1-205ENST00000496887 INE1O15225 51 aa2.99□□□□□ -1.93
KCNQ1-205ENST00000496887 PRM1P04553 51 aa2.87□□□□□ -1.95
KCNQ1-205ENST00000496887 MUC19Q7Z5P9 8384 aa2.83□□□□□ -1.96
KCNQ1-205ENST00000496887 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa2.28□□□□□ -2.04
KCNQ1-205ENST00000496887 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.99□□□□□ -2.09
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