RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495022.5

TRDMT1-211, Transcript of tRNA aspartic acid methyltransferase 1, humanhuman

TSL 2

Gene TRDMT1, Length 1,374 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDMT1-211ENST00000495022 A0A1B0GU69 56 aa7.71□□□□□ -1.17
TRDMT1-211ENST00000495022 COX7CP15954 63 aa7.71□□□□□ -1.17
TRDMT1-211ENST00000495022 A8MU10 97 aa7.71□□□□□ -1.18
TRDMT1-211ENST00000495022 H7BZZ5 65 aa7.71□□□□□ -1.18
TRDMT1-211ENST00000495022 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa7.55□□□□□ -1.2
TRDMT1-211ENST00000495022 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa7.54□□□□□ -1.2
TRDMT1-211ENST00000495022 KRTAP12-3P60328 96 aa7.53□□□□□ -1.2
TRDMT1-211ENST00000495022 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa7.52□□□□□ -1.21
TRDMT1-211ENST00000495022 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa7.46□□□□□ -1.21
TRDMT1-211ENST00000495022 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
TRDMT1-211ENST00000495022 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa7.41□□□□□ -1.22
TRDMT1-211ENST00000495022 PRR15LQ9BU68 103 aa7.4□□□□□ -1.22
TRDMT1-211ENST00000495022 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa7.35□□□□□ -1.23
TRDMT1-211ENST00000495022 KRTAP12-4P60329 112 aa7.33□□□□□ -1.24
TRDMT1-211ENST00000495022 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
TRDMT1-211ENST00000495022 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa7.23□□□□□ -1.25
TRDMT1-211ENST00000495022 ANAPC13Q9BS18 74 aa7.22□□□□□ -1.25
TRDMT1-211ENST00000495022 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
TRDMT1-211ENST00000495022 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa7.18□□□□□ -1.26
TRDMT1-211ENST00000495022 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa7.18□□□□□ -1.26
TRDMT1-211ENST00000495022 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa7.16□□□□□ -1.26
TRDMT1-211ENST00000495022 UQCR11O14957 56 aa7.14□□□□□ -1.27
TRDMT1-211ENST00000495022 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa7.14□□□□□ -1.27
TRDMT1-211ENST00000495022 CCDC179H3BU77 68 aa7.09□□□□□ -1.27
TRDMT1-211ENST00000495022 MIR22HGQ0VDD5 57 aa6.93□□□□□ -1.3
TRDMT1-211ENST00000495022 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa6.92□□□□□ -1.3
TRDMT1-211ENST00000495022 KRTAP23-1A1A580 65 aa6.9□□□□□ -1.31
TRDMT1-211ENST00000495022 LCE3CQ5T5A8 94 aa6.9□□□□□ -1.31
TRDMT1-211ENST00000495022 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa6.9□□□□□ -1.31
TRDMT1-211ENST00000495022 K7ERS5 55 aa6.89□□□□□ -1.31
TRDMT1-211ENST00000495022 KRTAP5-2Q701N4 177 aa6.86□□□□□ -1.31
TRDMT1-211ENST00000495022 TMEM258P61165 79 aa6.83□□□□□ -1.32
TRDMT1-211ENST00000495022 MT1AP04731 61 aa6.81□□□□□ -1.32
TRDMT1-211ENST00000495022 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa6.78□□□□□ -1.32
TRDMT1-211ENST00000495022 KRTAP5-8O75690 187 aa6.67□□□□□ -1.34
TRDMT1-211ENST00000495022 SVIPQ8NHG7 77 aa6.64□□□□□ -1.35
TRDMT1-211ENST00000495022 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa6.63□□□□□ -1.35
TRDMT1-211ENST00000495022 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
TRDMT1-211ENST00000495022 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
TRDMT1-211ENST00000495022 PSPHP1O15172 72 aa6.57□□□□□ -1.36
TRDMT1-211ENST00000495022 MUC5ACP98088 5654 aa6.57□□□□□ -1.36
TRDMT1-211ENST00000495022 V9GYY9 64 aa6.57□□□□□ -1.36
TRDMT1-211ENST00000495022 OBSCNQ5VST9 7968 aa6.55□□□□□ -1.36
TRDMT1-211ENST00000495022 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa6.54□□□□□ -1.36
TRDMT1-211ENST00000495022 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa6.51□□□□□ -1.37
TRDMT1-211ENST00000495022 H3BS24 57 aa6.48□□□□□ -1.37
TRDMT1-211ENST00000495022 Q1T7F1 81 aa6.48□□□□□ -1.37
TRDMT1-211ENST00000495022 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa6.46□□□□□ -1.37
TRDMT1-211ENST00000495022 RPS28P62857 69 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
TRDMT1-211ENST00000495022 A6NED7 52 aa6.34□□□□□ -1.39
TRDMT1-211ENST00000495022 ROMO1P60602 79 aa6.33□□□□□ -1.4
TRDMT1-211ENST00000495022 MT3P25713 68 aa6.24□□□□□ -1.41
TRDMT1-211ENST00000495022 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa6.2□□□□□ -1.42
TRDMT1-211ENST00000495022 PCP4P48539 62 aa5.93□□□□□ -1.46
TRDMT1-211ENST00000495022 LCE1EQ5T753 118 aa5.83□□□□□ -1.48
TRDMT1-211ENST00000495022 LCE1BQ5T7P3 118 aa5.47□□□□□ -1.53
TRDMT1-211ENST00000495022 LCE1CQ5T751 118 aa5.42□□□□□ -1.54
TRDMT1-211ENST00000495022 A0A0A0MQY5 61 aa5.3□□□□□ -1.56
TRDMT1-211ENST00000495022 BRK1Q8WUW1 75 aa5.29□□□□□ -1.56
TRDMT1-211ENST00000495022 PMAIP1Q13794 54 aa4.97□□□□□ -1.61
TRDMT1-211ENST00000495022 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa4.94□□□□□ -1.62
TRDMT1-211ENST00000495022 LCE3DQ9BYE3 92 aa4.91□□□□□ -1.62
TRDMT1-211ENST00000495022 LCE1FQ5T754 118 aa4.9□□□□□ -1.63
TRDMT1-211ENST00000495022 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
TRDMT1-211ENST00000495022 PRAC1Q96KF2 57 aa4.78□□□□□ -1.64
TRDMT1-211ENST00000495022 PRO0628Q9UI54 55 aa4.57□□□□□ -1.68
TRDMT1-211ENST00000495022 LCE3EQ5T5B0 92 aa4.55□□□□□ -1.68
TRDMT1-211ENST00000495022 PHGR1C9JFL3 82 aa4.53□□□□□ -1.68
TRDMT1-211ENST00000495022 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa4.48□□□□□ -1.69
TRDMT1-211ENST00000495022 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa4.39□□□□□ -1.71
TRDMT1-211ENST00000495022 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa4.12□□□□□ -1.75
TRDMT1-211ENST00000495022 MUC19Q7Z5P9 8384 aa4.09□□□□□ -1.75
TRDMT1-211ENST00000495022 LUZP6Q538Z0 58 aa4.08□□□□□ -1.76
TRDMT1-211ENST00000495022 NDUFAF8A1L188 74 aa3.98□□□□□ -1.77
TRDMT1-211ENST00000495022 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa3.47□□□□□ -1.85
TRDMT1-211ENST00000495022 PRM1P04553 51 aa3.21□□□□□ -1.9
TRDMT1-211ENST00000495022 MUC16Q8WXI7 14507 aa2.9□□□□□ -1.95
TRDMT1-211ENST00000495022 INE1O15225 51 aa2.58□□□□□ -2
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