RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479480.5

CTPS1-208, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTPS1, Length 777 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-208ENST00000479480 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa3.02□□□□□ -1.93
CTPS1-208ENST00000479480 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa3.01□□□□□ -1.93
CTPS1-208ENST00000479480 A0A0D9SG42 100 aa3□□□□□ -1.93
CTPS1-208ENST00000479480 PP632Q6XCG6 107 aa2.98□□□□□ -1.93
CTPS1-208ENST00000479480 SPTSSBQ8NFR3 76 aa2.98□□□□□ -1.93
CTPS1-208ENST00000479480 MT1LQ93083 61 aa2.98□□□□□ -1.93
CTPS1-208ENST00000479480 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa2.97□□□□□ -1.93
CTPS1-208ENST00000479480 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa2.94□□□□□ -1.94
CTPS1-208ENST00000479480 SCGB1A1P11684 91 aa2.94□□□□□ -1.94
CTPS1-208ENST00000479480 SPATA8Q6RVD6 105 aa2.87□□□□□ -1.95
CTPS1-208ENST00000479480 SPINT4Q6UDR6 99 aa2.87□□□□□ -1.95
CTPS1-208ENST00000479480 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa2.86□□□□□ -1.95
CTPS1-208ENST00000479480 C10orf95Q9H7T3 257 aa2.86□□□□□ -1.95
CTPS1-208ENST00000479480 SMIM26A0A096LP01 95 aa2.85□□□□□ -1.95
CTPS1-208ENST00000479480 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa2.85□□□□□ -1.95
CTPS1-208ENST00000479480 LCE3AQ5TA76 89 aa2.85□□□□□ -1.95
CTPS1-208ENST00000479480 KRTAP12-1P59990 96 aa2.84□□□□□ -1.95
CTPS1-208ENST00000479480 SNURFQ9Y675 71 aa2.83□□□□□ -1.96
CTPS1-208ENST00000479480 PSPHP1O15172 72 aa2.8□□□□□ -1.96
CTPS1-208ENST00000479480 A0A1B0GV90 55 aa2.79□□□□□ -1.96
CTPS1-208ENST00000479480 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP2.79□□□□□ -1.96
CTPS1-208ENST00000479480 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP2.79□□□□□ -1.96
CTPS1-208ENST00000479480 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa2.78□□□□□ -1.96
CTPS1-208ENST00000479480 SMIM20Q8N5G0 67 aa2.77□□□□□ -1.97
CTPS1-208ENST00000479480 A0A1B0GU33 70 aa2.76□□□□□ -1.97
CTPS1-208ENST00000479480 SERP1Q9Y6X1 66 aa2.76□□□□□ -1.97
CTPS1-208ENST00000479480 V9GYY9 64 aa2.76□□□□□ -1.97
CTPS1-208ENST00000479480 J3QR89 54 aa2.75□□□□□ -1.97
CTPS1-208ENST00000479480 KRTAP12-4P60329 112 aa2.74□□□□□ -1.97
CTPS1-208ENST00000479480 COA5Q86WW8 74 aa2.74□□□□□ -1.97
CTPS1-208ENST00000479480 TNP1P09430 55 aa2.73□□□□□ -1.97
CTPS1-208ENST00000479480 KRTAP12-3P60328 96 aa2.71□□□□□ -1.98
CTPS1-208ENST00000479480 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa2.7□□□□□ -1.98
CTPS1-208ENST00000479480 PRO0628Q9UI54 55 aa2.68□□□□□ -1.98
CTPS1-208ENST00000479480 LUZP6Q538Z0 58 aa2.67□□□□□ -1.98
CTPS1-208ENST00000479480 SERP2Q8N6R1 65 aa2.63□□□□□ -1.99
CTPS1-208ENST00000479480 LCE3DQ9BYE3 92 aa2.61□□□□□ -1.99
CTPS1-208ENST00000479480 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP2.61□□□□□ -1.99
CTPS1-208ENST00000479480 KRTAP5-8O75690 187 aa2.6□□□□□ -1.99
CTPS1-208ENST00000479480 KRTAP5-2Q701N4 177 aa2.6□□□□□ -1.99
CTPS1-208ENST00000479480 A0A1B0GU69 56 aa2.58□□□□□ -2
CTPS1-208ENST00000479480 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP2.58□□□□□ -2
CTPS1-208ENST00000479480 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa2.56□□□□□ -2
CTPS1-208ENST00000479480 MUC5ACP98088 5654 aa2.55□□□□□ -2
CTPS1-208ENST00000479480 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa2.55□□□□□ -2
CTPS1-208ENST00000479480 K7ERU9 68 aa2.54□□□□□ -2
CTPS1-208ENST00000479480 H7BZZ5 65 aa2.52□□□□□ -2.01
CTPS1-208ENST00000479480 MT1AP04731 61 aa2.52□□□□□ -2.01
CTPS1-208ENST00000479480 ANAPC13Q9BS18 74 aa2.52□□□□□ -2.01
CTPS1-208ENST00000479480 K7ERS5 55 aa2.5□□□□□ -2.01
CTPS1-208ENST00000479480 COX7CP15954 63 aa2.49□□□□□ -2.01
CTPS1-208ENST00000479480 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa2.47□□□□□ -2.01
CTPS1-208ENST00000479480 OBSCNQ5VST9 7968 aa2.47□□□□□ -2.01
CTPS1-208ENST00000479480 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa2.44□□□□□ -2.02
CTPS1-208ENST00000479480 PRR15LQ9BU68 103 aa2.39□□□□□ -2.03
CTPS1-208ENST00000479480 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa2.38□□□□□ -2.03
CTPS1-208ENST00000479480 A6NED7 52 aa2.34□□□□□ -2.03
CTPS1-208ENST00000479480 UQCR11O14957 56 aa2.34□□□□□ -2.03
CTPS1-208ENST00000479480 MIR22HGQ0VDD5 57 aa2.28□□□□□ -2.04
CTPS1-208ENST00000479480 CCDC179H3BU77 68 aa2.27□□□□□ -2.05
CTPS1-208ENST00000479480 LCE1CQ5T751 118 aa2.25□□□□□ -2.05
CTPS1-208ENST00000479480 LCE1BQ5T7P3 118 aa2.25□□□□□ -2.05
CTPS1-208ENST00000479480 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP2.21□□□□□ -2.06
CTPS1-208ENST00000479480 RPS28P62857 69 aaKnown RBP2.15□□□□□ -2.07
CTPS1-208ENST00000479480 Q1T7F1 81 aa2.14□□□□□ -2.07
CTPS1-208ENST00000479480 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa2.1□□□□□ -2.07
CTPS1-208ENST00000479480 ROMO1P60602 79 aa2.09□□□□□ -2.07
CTPS1-208ENST00000479480 TMEM258P61165 79 aa2.08□□□□□ -2.08
CTPS1-208ENST00000479480 PMAIP1Q13794 54 aa1.93□□□□□ -2.1
CTPS1-208ENST00000479480 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa1.9□□□□□ -2.11
CTPS1-208ENST00000479480 PHGR1C9JFL3 82 aa1.79□□□□□ -2.12
CTPS1-208ENST00000479480 MUC19Q7Z5P9 8384 aa1.72□□□□□ -2.13
CTPS1-208ENST00000479480 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa1.68□□□□□ -2.14
CTPS1-208ENST00000479480 INE1O15225 51 aa1.42□□□□□ -2.18
CTPS1-208ENST00000479480 BRK1Q8WUW1 75 aa1.41□□□□□ -2.18
CTPS1-208ENST00000479480 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa1.34□□□□□ -2.19
CTPS1-208ENST00000479480 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.09□□□□□ -2.24
CTPS1-208ENST00000479480 PRM1P04553 51 aa1.07□□□□□ -2.24
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