RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478473.1

C9orf3-215, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 3

Gene C9orf3, Length 895 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-215ENST00000478473 LCE4AQ5TA78 99 aa8.12□□□□□ -1.11
C9orf3-215ENST00000478473 LCE1DQ5T752 114 aa8.07□□□□□ -1.12
C9orf3-215ENST00000478473 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa8.05□□□□□ -1.12
C9orf3-215ENST00000478473 KRTAP12-3P60328 96 aa8.04□□□□□ -1.12
C9orf3-215ENST00000478473 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa8.01□□□□□ -1.13
C9orf3-215ENST00000478473 MIR22HGQ0VDD5 57 aa7.99□□□□□ -1.13
C9orf3-215ENST00000478473 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa7.94□□□□□ -1.14
C9orf3-215ENST00000478473 GPR98Q8WXG9 6306 aa7.93□□□□□ -1.14
C9orf3-215ENST00000478473 MT4P47944 62 aa7.91□□□□□ -1.14
C9orf3-215ENST00000478473 HMCN1Q96RW7 5635 aa7.91□□□□□ -1.14
C9orf3-215ENST00000478473 V9GYY9 64 aa7.89□□□□□ -1.15
C9orf3-215ENST00000478473 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa7.88□□□□□ -1.15
C9orf3-215ENST00000478473 Q1T7F1 81 aa7.85□□□□□ -1.15
C9orf3-215ENST00000478473 K7ERS5 55 aa7.82□□□□□ -1.16
C9orf3-215ENST00000478473 PSPHP1O15172 72 aa7.77□□□□□ -1.17
C9orf3-215ENST00000478473 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa7.75□□□□□ -1.17
C9orf3-215ENST00000478473 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa7.75□□□□□ -1.17
C9orf3-215ENST00000478473 KRTAP23-1A1A580 65 aa7.73□□□□□ -1.17
C9orf3-215ENST00000478473 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP7.69□□□□□ -1.18
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C9orf3-215ENST00000478473 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa7.55□□□□□ -1.2
C9orf3-215ENST00000478473 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa7.52□□□□□ -1.21
C9orf3-215ENST00000478473 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa7.52□□□□□ -1.21
C9orf3-215ENST00000478473 A6NED7 52 aa7.51□□□□□ -1.21
C9orf3-215ENST00000478473 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa7.5□□□□□ -1.21
C9orf3-215ENST00000478473 LOC100996750A0A140TA64 210 aa7.46□□□□□ -1.22
C9orf3-215ENST00000478473 KRTAP12-4P60329 112 aa7.42□□□□□ -1.22
C9orf3-215ENST00000478473 RPS28P62857 69 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
C9orf3-215ENST00000478473 LCE3CQ5T5A8 94 aa7.42□□□□□ -1.22
C9orf3-215ENST00000478473 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa7.42□□□□□ -1.22
C9orf3-215ENST00000478473 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa7.36□□□□□ -1.23
C9orf3-215ENST00000478473 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
C9orf3-215ENST00000478473 ROMO1P60602 79 aa7.32□□□□□ -1.24
C9orf3-215ENST00000478473 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa7.28□□□□□ -1.24
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C9orf3-215ENST00000478473 MT1AP04731 61 aa7.12□□□□□ -1.27
C9orf3-215ENST00000478473 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa7.04□□□□□ -1.28
C9orf3-215ENST00000478473 KRTAP5-2Q701N4 177 aa7.03□□□□□ -1.28
C9orf3-215ENST00000478473 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa7.02□□□□□ -1.29
C9orf3-215ENST00000478473 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa6.88□□□□□ -1.31
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C9orf3-215ENST00000478473 KRTAP5-8O75690 187 aa6.65□□□□□ -1.34
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C9orf3-215ENST00000478473 OBSCNQ5VST9 7968 aa6.46□□□□□ -1.38
C9orf3-215ENST00000478473 BRK1Q8WUW1 75 aa6.35□□□□□ -1.39
C9orf3-215ENST00000478473 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa6.28□□□□□ -1.4
C9orf3-215ENST00000478473 MUC5ACP98088 5654 aa6.25□□□□□ -1.41
C9orf3-215ENST00000478473 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa6.25□□□□□ -1.41
C9orf3-215ENST00000478473 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
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C9orf3-215ENST00000478473 PRAC1Q96KF2 57 aa5.77□□□□□ -1.49
C9orf3-215ENST00000478473 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa5.68□□□□□ -1.5
C9orf3-215ENST00000478473 LCE1CQ5T751 118 aa5.6□□□□□ -1.51
C9orf3-215ENST00000478473 LCE1BQ5T7P3 118 aa5.6□□□□□ -1.51
C9orf3-215ENST00000478473 PRO0628Q9UI54 55 aa5.49□□□□□ -1.53
C9orf3-215ENST00000478473 H3BS24 57 aa5.41□□□□□ -1.54
C9orf3-215ENST00000478473 LCE3DQ9BYE3 92 aa5.33□□□□□ -1.56
C9orf3-215ENST00000478473 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa5.28□□□□□ -1.56
C9orf3-215ENST00000478473 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP5.14□□□□□ -1.59
C9orf3-215ENST00000478473 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa5.08□□□□□ -1.6
C9orf3-215ENST00000478473 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa5.03□□□□□ -1.6
C9orf3-215ENST00000478473 LCE3EQ5T5B0 92 aa5.01□□□□□ -1.61
C9orf3-215ENST00000478473 LCE1FQ5T754 118 aa4.96□□□□□ -1.62
C9orf3-215ENST00000478473 LUZP6Q538Z0 58 aa4.9□□□□□ -1.63
C9orf3-215ENST00000478473 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa4.69□□□□□ -1.66
C9orf3-215ENST00000478473 A0A0A0MQY5 61 aa4.59□□□□□ -1.67
C9orf3-215ENST00000478473 PHGR1C9JFL3 82 aa4.37□□□□□ -1.71
C9orf3-215ENST00000478473 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa4.17□□□□□ -1.74
C9orf3-215ENST00000478473 MUC19Q7Z5P9 8384 aa3.99□□□□□ -1.77
C9orf3-215ENST00000478473 NDUFAF8A1L188 74 aa3.77□□□□□ -1.81
C9orf3-215ENST00000478473 PRM1P04553 51 aa3.71□□□□□ -1.82
C9orf3-215ENST00000478473 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa3.33□□□□□ -1.88
C9orf3-215ENST00000478473 INE1O15225 51 aa3.07□□□□□ -1.92
C9orf3-215ENST00000478473 MUC16Q8WXI7 14507 aa2.85□□□□□ -1.95
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