RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471880.5

SSR4-208, Transcript of signal sequence receptor subunit 4, human

TSL 5

Gene SSR4, Length 785 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SSR4-208	ENST00000471880		K7ERS5	55 aa		5.29	□□□□□ -1.56
SSR4-208	ENST00000471880	MT1L	Q93083	61 aa		5.26	□□□□□ -1.57
SSR4-208	ENST00000471880	MT1M	Q8N339	61 aa		5.24	□□□□□ -1.57
SSR4-208	ENST00000471880		Q1T7F1	81 aa		5.21	□□□□□ -1.58
SSR4-208	ENST00000471880	KRTAP4-9	Q9BYQ8	210 aa		5.21	□□□□□ -1.58
SSR4-208	ENST00000471880	KRTAP12-3	P60328	96 aa		5.17	□□□□□ -1.58
SSR4-208	ENST00000471880		A6NED7	52 aa		5.16	□□□□□ -1.58
SSR4-208	ENST00000471880	KRTAP4-3	Q9BYR4	195 aa		5.16	□□□□□ -1.58
SSR4-208	ENST00000471880	KRTAP25-1	Q3LHN0	102 aa		5.15	□□□□□ -1.59
SSR4-208	ENST00000471880	LCE1D	Q5T752	114 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SSR4-208	ENST00000471880	KRTAP4-7	Q9BYR0	210 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SSR4-208	ENST00000471880	GPR98	Q8WXG9	6306 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SSR4-208	ENST00000471880	MT4	P47944	62 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SSR4-208	ENST00000471880	PCP4	P48539	62 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SSR4-208	ENST00000471880	LCE4A	Q5TA78	99 aa		5.02	□□□□□ -1.61
SSR4-208	ENST00000471880	CDC42SE1	Q9NRR8	79 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SSR4-208	ENST00000471880	RPS28	P62857	69 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SSR4-208	ENST00000471880	KRTAP5-4	Q6L8H1	288 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SSR4-208	ENST00000471880	HMCN1	Q96RW7	5635 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SSR4-208	ENST00000471880	KRTAP4-6	Q9BYQ5	205 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SSR4-208	ENST00000471880	ROMO1	P60602	79 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SSR4-208	ENST00000471880	KRTAP23-1	A1A580	65 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SSR4-208	ENST00000471880	KRTAP15-1	Q3LI76	137 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SSR4-208	ENST00000471880	AHNAK2	Q8IVF2	5795 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SSR4-208	ENST00000471880	LOC100996750	A0A140TA64	210 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SSR4-208	ENST00000471880	KRTAP5-5	Q701N2	237 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
SSR4-208	ENST00000471880	KRTAP19-4	Q3LI73	84 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SSR4-208	ENST00000471880	LCE3C	Q5T5A8	94 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SSR4-208	ENST00000471880	KRTAP5-10	Q6L8G5	202 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SSR4-208	ENST00000471880	KRTAP12-4	P60329	112 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SSR4-208	ENST00000471880	KRTAP20-2	Q3LI61	65 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SSR4-208	ENST00000471880	SYNE1	Q8NF91	8797 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SSR4-208	ENST00000471880	SPRR5	A0A1B0GTR4	108 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SSR4-208	ENST00000471880	KRTAP5-3	Q6L8H2	238 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SSR4-208	ENST00000471880	BRK1	Q8WUW1	75 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SSR4-208	ENST00000471880	KRTAP5-7	Q6L8G8	165 aa		4.5	□□□□□ -1.69
SSR4-208	ENST00000471880	MT1A	P04731	61 aa		4.48	□□□□□ -1.69
SSR4-208	ENST00000471880	KRTAP6-1	Q3LI64	71 aa		4.47	□□□□□ -1.69
SSR4-208	ENST00000471880	KRTAP9-6	A8MVA2	160 aa		4.45	□□□□□ -1.7
SSR4-208	ENST00000471880	KRTAP5-2	Q701N4	177 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SSR4-208	ENST00000471880	KRTAP9-4	Q9BYQ2	154 aa		4.32	□□□□□ -1.72
SSR4-208	ENST00000471880	KRTAP6-2	Q3LI66	62 aa		4.27	□□□□□ -1.73
SSR4-208	ENST00000471880	KRTAP4-11	Q9BYQ6	195 aa		4.26	□□□□□ -1.73
SSR4-208	ENST00000471880	PMAIP1	Q13794	54 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SSR4-208	ENST00000471880	SVIP	Q8NHG7	77 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SSR4-208	ENST00000471880	KRTAP5-8	O75690	187 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SSR4-208	ENST00000471880	MT3	P25713	68 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SSR4-208	ENST00000471880	OBSCN	Q5VST9	7968 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SSR4-208	ENST00000471880	PRAC1	Q96KF2	57 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SSR4-208	ENST00000471880	MUC5AC	P98088	5654 aa		3.94	□□□□□ -1.78
SSR4-208	ENST00000471880	KRTAP5-1	Q6L8H4	278 aa		3.92	□□□□□ -1.78
SSR4-208	ENST00000471880	AHNAK	Q09666	5890 aa	Known RBP	3.92	□□□□□ -1.78
SSR4-208	ENST00000471880	KRTAP9-9	Q9BYP9	154 aa		3.91	□□□□□ -1.78
SSR4-208	ENST00000471880	MUC5B	Q9HC84	5762 aa	Predicted RBP	3.9	□□□□□ -1.78
SSR4-208	ENST00000471880	PRO0628	Q9UI54	55 aa		3.87	□□□□□ -1.79
SSR4-208	ENST00000471880	KTN1-AS1	Q86SY8	53 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SSR4-208	ENST00000471880	LCE1E	Q5T753	118 aa		3.69	□□□□□ -1.82
SSR4-208	ENST00000471880	LCE1B	Q5T7P3	118 aa		3.61	□□□□□ -1.83
SSR4-208	ENST00000471880	KRTAP4-2	Q9BYR5	136 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SSR4-208	ENST00000471880	LUZP6	Q538Z0	58 aa		3.46	□□□□□ -1.86
SSR4-208	ENST00000471880	LCE3D	Q9BYE3	92 aa		3.46	□□□□□ -1.86
SSR4-208	ENST00000471880	LCE1C	Q5T751	118 aa		3.43	□□□□□ -1.86
SSR4-208	ENST00000471880	LCE3E	Q5T5B0	92 aa		3.27	□□□□□ -1.89
SSR4-208	ENST00000471880	KRTAP4-12	Q9BQ66	201 aa		3.24	□□□□□ -1.89
SSR4-208	ENST00000471880	KRTAP5-6	Q6L8G9	129 aa	Predicted RBP	3.13	□□□□□ -1.91
SSR4-208	ENST00000471880	KRTAP5-11	Q6L8G4	156 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SSR4-208	ENST00000471880	LCE1F	Q5T754	118 aa		2.99	□□□□□ -1.93
SSR4-208	ENST00000471880	KRTAP21-2	Q3LI59	83 aa		2.93	□□□□□ -1.94
SSR4-208	ENST00000471880		H3BS24	57 aa		2.89	□□□□□ -1.95
SSR4-208	ENST00000471880		A0A0A0MQY5	61 aa		2.87	□□□□□ -1.95
SSR4-208	ENST00000471880	NDUFAF8	A1L188	74 aa		2.8	□□□□□ -1.96
SSR4-208	ENST00000471880	KRTAP4-4	Q9BYR3	166 aa		2.75	□□□□□ -1.97
SSR4-208	ENST00000471880	PHGR1	C9JFL3	82 aa		2.73	□□□□□ -1.97
SSR4-208	ENST00000471880	MUC19	Q7Z5P9	8384 aa		2.53	□□□□□ -2
SSR4-208	ENST00000471880	PRM1	P04553	51 aa		2.53	□□□□□ -2
SSR4-208	ENST00000471880	INE1	O15225	51 aa		2.18	□□□□□ -2.06
SSR4-208	ENST00000471880	KRTAP21-1	Q3LI58	79 aa		2.04	□□□□□ -2.08
SSR4-208	ENST00000471880	MUC16	Q8WXI7	14507 aa		1.79	□□□□□ -2.12

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