RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466638.5

PNCK-222, Transcript of pregnancy up-regulated nonubiquitous CaM kinase, human

TSL 2

Gene PNCK, Length 1,204 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PNCK-222	ENST00000466638	LCE5A	Q5TCM9	118 aa		6.03	□□□□□ -1.44
PNCK-222	ENST00000466638		K7ERS5	55 aa		6.01	□□□□□ -1.45
PNCK-222	ENST00000466638		A6NED7	52 aa		5.95	□□□□□ -1.46
PNCK-222	ENST00000466638	MT1G	P13640	62 aa		5.92	□□□□□ -1.46
PNCK-222	ENST00000466638	MT1L	Q93083	61 aa		5.89	□□□□□ -1.47
PNCK-222	ENST00000466638	KRTAP25-1	Q3LHN0	102 aa		5.88	□□□□□ -1.47
PNCK-222	ENST00000466638	PP632	Q6XCG6	107 aa		5.88	□□□□□ -1.47
PNCK-222	ENST00000466638	KRTAP12-3	P60328	96 aa		5.82	□□□□□ -1.48
PNCK-222	ENST00000466638	MT1M	Q8N339	61 aa		5.82	□□□□□ -1.48
PNCK-222	ENST00000466638	BRK1	Q8WUW1	75 aa		5.78	□□□□□ -1.48
PNCK-222	ENST00000466638	KRTAP4-9	Q9BYQ8	210 aa		5.77	□□□□□ -1.49
PNCK-222	ENST00000466638	CDC42SE1	Q9NRR8	79 aa		5.77	□□□□□ -1.49
PNCK-222	ENST00000466638	DST	Q03001	7570 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
PNCK-222	ENST00000466638	KRTAP4-3	Q9BYR4	195 aa		5.69	□□□□□ -1.5
PNCK-222	ENST00000466638	PRO0628	Q9UI54	55 aa		5.69	□□□□□ -1.5
PNCK-222	ENST00000466638	KRTAP23-1	A1A580	65 aa		5.65	□□□□□ -1.5
PNCK-222	ENST00000466638	ROMO1	P60602	79 aa		5.63	□□□□□ -1.51
PNCK-222	ENST00000466638	KRTAP4-7	Q9BYR0	210 aa		5.62	□□□□□ -1.51
PNCK-222	ENST00000466638	LCE1D	Q5T752	114 aa		5.56	□□□□□ -1.52
PNCK-222	ENST00000466638	HMCN1	Q96RW7	5635 aa		5.54	□□□□□ -1.52
PNCK-222	ENST00000466638	LCE4A	Q5TA78	99 aa		5.51	□□□□□ -1.53
PNCK-222	ENST00000466638	KRTAP15-1	Q3LI76	137 aa		5.5	□□□□□ -1.53
PNCK-222	ENST00000466638	PMAIP1	Q13794	54 aa		5.49	□□□□□ -1.53
PNCK-222	ENST00000466638	AHNAK2	Q8IVF2	5795 aa		5.47	□□□□□ -1.53
PNCK-222	ENST00000466638	KRTAP19-4	Q3LI73	84 aa		5.47	□□□□□ -1.53
PNCK-222	ENST00000466638	MT4	P47944	62 aa		5.46	□□□□□ -1.54
PNCK-222	ENST00000466638	KRTAP5-4	Q6L8H1	288 aa		5.43	□□□□□ -1.54
PNCK-222	ENST00000466638	KRTAP5-10	Q6L8G5	202 aa		5.39	□□□□□ -1.55
PNCK-222	ENST00000466638	LCE3C	Q5T5A8	94 aa		5.37	□□□□□ -1.55
PNCK-222	ENST00000466638	LOC100996750	A0A140TA64	210 aa		5.32	□□□□□ -1.56
PNCK-222	ENST00000466638	KRTAP5-5	Q701N2	237 aa	Predicted RBP	5.31	□□□□□ -1.56
PNCK-222	ENST00000466638	KRTAP4-6	Q9BYQ5	205 aa		5.29	□□□□□ -1.56
PNCK-222	ENST00000466638	KTN1-AS1	Q86SY8	53 aa		5.26	□□□□□ -1.57
PNCK-222	ENST00000466638	KRTAP5-7	Q6L8G8	165 aa		5.23	□□□□□ -1.57
PNCK-222	ENST00000466638	SVIP	Q8NHG7	77 aa		5.23	□□□□□ -1.57
PNCK-222	ENST00000466638	KRTAP5-3	Q6L8H2	238 aa		5.16	□□□□□ -1.58
PNCK-222	ENST00000466638	KRTAP12-4	P60329	112 aa		5.14	□□□□□ -1.59
PNCK-222	ENST00000466638	KRTAP20-2	Q3LI61	65 aa		5.13	□□□□□ -1.59
PNCK-222	ENST00000466638	SPRR5	A0A1B0GTR4	108 aa		5.11	□□□□□ -1.59
PNCK-222	ENST00000466638	PRAC1	Q96KF2	57 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PNCK-222	ENST00000466638	KRTAP9-6	A8MVA2	160 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PNCK-222	ENST00000466638	MT1A	P04731	61 aa		5.01	□□□□□ -1.61
PNCK-222	ENST00000466638	KRTAP6-1	Q3LI64	71 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PNCK-222	ENST00000466638	SYNE1	Q8NF91	8797 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PNCK-222	ENST00000466638	KRTAP9-4	Q9BYQ2	154 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PNCK-222	ENST00000466638	KRTAP5-2	Q701N4	177 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PNCK-222	ENST00000466638	KRTAP6-2	Q3LI66	62 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PNCK-222	ENST00000466638	AHNAK	Q09666	5890 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
PNCK-222	ENST00000466638	KRTAP4-11	Q9BYQ6	195 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PNCK-222	ENST00000466638	MUC5AC	P98088	5654 aa		4.59	□□□□□ -1.68
PNCK-222	ENST00000466638	MT3	P25713	68 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PNCK-222	ENST00000466638	MUC5B	Q9HC84	5762 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PNCK-222	ENST00000466638	KRTAP5-8	O75690	187 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PNCK-222	ENST00000466638	KRTAP9-9	Q9BYP9	154 aa		4.38	□□□□□ -1.71
PNCK-222	ENST00000466638	OBSCN	Q5VST9	7968 aa		4.28	□□□□□ -1.72
PNCK-222	ENST00000466638	KRTAP5-1	Q6L8H4	278 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PNCK-222	ENST00000466638	LUZP6	Q538Z0	58 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PNCK-222	ENST00000466638	LCE1E	Q5T753	118 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PNCK-222	ENST00000466638	NDUFAF8	A1L188	74 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PNCK-222	ENST00000466638	LCE1B	Q5T7P3	118 aa		3.92	□□□□□ -1.78
PNCK-222	ENST00000466638	LCE3D	Q9BYE3	92 aa		3.91	□□□□□ -1.78
PNCK-222	ENST00000466638	KRTAP4-2	Q9BYR5	136 aa		3.91	□□□□□ -1.78
PNCK-222	ENST00000466638	LCE1C	Q5T751	118 aa		3.85	□□□□□ -1.79
PNCK-222	ENST00000466638	LCE3E	Q5T5B0	92 aa		3.71	□□□□□ -1.82
PNCK-222	ENST00000466638		A0A0A0MQY5	61 aa		3.62	□□□□□ -1.83
PNCK-222	ENST00000466638		H3BS24	57 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PNCK-222	ENST00000466638	KRTAP5-6	Q6L8G9	129 aa	Predicted RBP	3.52	□□□□□ -1.85
PNCK-222	ENST00000466638	KRTAP4-12	Q9BQ66	201 aa		3.49	□□□□□ -1.85
PNCK-222	ENST00000466638	KRTAP5-11	Q6L8G4	156 aa		3.47	□□□□□ -1.85
PNCK-222	ENST00000466638	INE1	O15225	51 aa		3.42	□□□□□ -1.86
PNCK-222	ENST00000466638	LCE1F	Q5T754	118 aa		3.33	□□□□□ -1.88
PNCK-222	ENST00000466638	KRTAP21-2	Q3LI59	83 aa		3.27	□□□□□ -1.89
PNCK-222	ENST00000466638	PHGR1	C9JFL3	82 aa		3.18	□□□□□ -1.9
PNCK-222	ENST00000466638	KRTAP4-4	Q9BYR3	166 aa		2.98	□□□□□ -1.93
PNCK-222	ENST00000466638	PRM1	P04553	51 aa		2.9	□□□□□ -1.95
PNCK-222	ENST00000466638	MUC19	Q7Z5P9	8384 aa		2.68	□□□□□ -1.98
PNCK-222	ENST00000466638	KRTAP21-1	Q3LI58	79 aa		2.41	□□□□□ -2.02
PNCK-222	ENST00000466638	MUC16	Q8WXI7	14507 aa		1.98	□□□□□ -2.09

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