RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000404162.2

HOXD12-201, Transcript of homeobox D12, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD12, Length 841 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12-201ENST00000404162 LOC100996750A0A140TA64 210 aa6.16□□□□□ -1.42
HOXD12-201ENST00000404162 KRTAP5-8O75690 187 aa6.11□□□□□ -1.43
HOXD12-201ENST00000404162 TNP1P09430 55 aa6.11□□□□□ -1.43
HOXD12-201ENST00000404162 KRTAP12-3P60328 96 aa6.09□□□□□ -1.43
HOXD12-201ENST00000404162 SERP1Q9Y6X1 66 aa6.04□□□□□ -1.44
HOXD12-201ENST00000404162 A0A1B0GU33 70 aa6.02□□□□□ -1.45
HOXD12-201ENST00000404162 SEC61GP60059 68 aa6.01□□□□□ -1.45
HOXD12-201ENST00000404162 KRTAP5-2Q701N4 177 aa6.01□□□□□ -1.45
HOXD12-201ENST00000404162 SNURFQ9Y675 71 aa5.99□□□□□ -1.45
HOXD12-201ENST00000404162 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa5.96□□□□□ -1.46
HOXD12-201ENST00000404162 SMIM20Q8N5G0 67 aa5.95□□□□□ -1.46
HOXD12-201ENST00000404162 OBSCNQ5VST9 7968 aa5.92□□□□□ -1.46
HOXD12-201ENST00000404162 COA5Q86WW8 74 aa5.88□□□□□ -1.47
HOXD12-201ENST00000404162 A8MU10 97 aa5.87□□□□□ -1.47
HOXD12-201ENST00000404162 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa5.86□□□□□ -1.47
HOXD12-201ENST00000404162 SMIM26A0A096LP01 95 aa5.83□□□□□ -1.48
HOXD12-201ENST00000404162 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa5.79□□□□□ -1.48
HOXD12-201ENST00000404162 ANAPC13Q9BS18 74 aa5.75□□□□□ -1.49
HOXD12-201ENST00000404162 MT1AP04731 61 aa5.74□□□□□ -1.49
HOXD12-201ENST00000404162 SERP2Q8N6R1 65 aa5.72□□□□□ -1.49
HOXD12-201ENST00000404162 COX7CP15954 63 aa5.67□□□□□ -1.5
HOXD12-201ENST00000404162 CCDC179H3BU77 68 aa5.65□□□□□ -1.5
HOXD12-201ENST00000404162 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa5.65□□□□□ -1.5
HOXD12-201ENST00000404162 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa5.64□□□□□ -1.51
HOXD12-201ENST00000404162 PCP4P48539 62 aa5.62□□□□□ -1.51
HOXD12-201ENST00000404162 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa5.62□□□□□ -1.51
HOXD12-201ENST00000404162 A0A1B0GU69 56 aa5.58□□□□□ -1.52
HOXD12-201ENST00000404162 LCE3CQ5T5A8 94 aa5.54□□□□□ -1.52
HOXD12-201ENST00000404162 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa5.54□□□□□ -1.52
HOXD12-201ENST00000404162 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa5.51□□□□□ -1.53
HOXD12-201ENST00000404162 H7BZZ5 65 aa5.48□□□□□ -1.53
HOXD12-201ENST00000404162 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa5.45□□□□□ -1.54
HOXD12-201ENST00000404162 TMEM258P61165 79 aa5.37□□□□□ -1.55
HOXD12-201ENST00000404162 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP5.31□□□□□ -1.56
HOXD12-201ENST00000404162 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa5.3□□□□□ -1.56
HOXD12-201ENST00000404162 MT3P25713 68 aa5.27□□□□□ -1.57
HOXD12-201ENST00000404162 PRR15LQ9BU68 103 aa5.19□□□□□ -1.58
HOXD12-201ENST00000404162 KRTAP23-1A1A580 65 aa5.13□□□□□ -1.59
HOXD12-201ENST00000404162 RPS28P62857 69 aaKnown RBP5.11□□□□□ -1.59
HOXD12-201ENST00000404162 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa5.06□□□□□ -1.6
HOXD12-201ENST00000404162 UQCR11O14957 56 aa4.99□□□□□ -1.61
HOXD12-201ENST00000404162 PSPHP1O15172 72 aa4.99□□□□□ -1.61
HOXD12-201ENST00000404162 LCE1EQ5T753 118 aa4.99□□□□□ -1.61
HOXD12-201ENST00000404162 Q1T7F1 81 aa4.98□□□□□ -1.61
HOXD12-201ENST00000404162 V9GYY9 64 aa4.96□□□□□ -1.62
HOXD12-201ENST00000404162 K7ERS5 55 aa4.85□□□□□ -1.63
HOXD12-201ENST00000404162 MIR22HGQ0VDD5 57 aa4.85□□□□□ -1.63
HOXD12-201ENST00000404162 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa4.84□□□□□ -1.63
HOXD12-201ENST00000404162 LCE1BQ5T7P3 118 aa4.82□□□□□ -1.64
HOXD12-201ENST00000404162 A6NED7 52 aa4.81□□□□□ -1.64
HOXD12-201ENST00000404162 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa4.68□□□□□ -1.66
HOXD12-201ENST00000404162 BRK1Q8WUW1 75 aa4.67□□□□□ -1.66
HOXD12-201ENST00000404162 LCE1CQ5T751 118 aa4.65□□□□□ -1.67
HOXD12-201ENST00000404162 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa4.65□□□□□ -1.67
HOXD12-201ENST00000404162 PRO0628Q9UI54 55 aa4.44□□□□□ -1.7
HOXD12-201ENST00000404162 ROMO1P60602 79 aa4.43□□□□□ -1.7
HOXD12-201ENST00000404162 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa4.4□□□□□ -1.71
HOXD12-201ENST00000404162 PMAIP1Q13794 54 aa4.39□□□□□ -1.71
HOXD12-201ENST00000404162 LCE1FQ5T754 118 aa4.31□□□□□ -1.72
HOXD12-201ENST00000404162 PHGR1C9JFL3 82 aa4.29□□□□□ -1.72
HOXD12-201ENST00000404162 PRAC1Q96KF2 57 aa4.19□□□□□ -1.74
HOXD12-201ENST00000404162 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa4.14□□□□□ -1.75
HOXD12-201ENST00000404162 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP4.13□□□□□ -1.75
HOXD12-201ENST00000404162 SVIPQ8NHG7 77 aa3.99□□□□□ -1.77
HOXD12-201ENST00000404162 LCE3DQ9BYE3 92 aa3.84□□□□□ -1.79
HOXD12-201ENST00000404162 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa3.82□□□□□ -1.8
HOXD12-201ENST00000404162 MUC19Q7Z5P9 8384 aa3.69□□□□□ -1.82
HOXD12-201ENST00000404162 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa3.64□□□□□ -1.83
HOXD12-201ENST00000404162 LCE3EQ5T5B0 92 aa3.49□□□□□ -1.85
HOXD12-201ENST00000404162 LUZP6Q538Z0 58 aa3.37□□□□□ -1.87
HOXD12-201ENST00000404162 NDUFAF8A1L188 74 aa3.24□□□□□ -1.89
HOXD12-201ENST00000404162 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa3.24□□□□□ -1.89
HOXD12-201ENST00000404162 A0A0A0MQY5 61 aa2.77□□□□□ -1.97
HOXD12-201ENST00000404162 H3BS24 57 aa2.61□□□□□ -1.99
HOXD12-201ENST00000404162 INE1O15225 51 aa2.59□□□□□ -1.99
HOXD12-201ENST00000404162 MUC16Q8WXI7 14507 aa2.58□□□□□ -2
HOXD12-201ENST00000404162 PRM1P04553 51 aa2.29□□□□□ -2.04
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