RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000173141.1

Gm20546-201, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Gm20546, Length 1,889 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20546-201ENSMUST00000173141 Tmem136Q3TYE7 245 aa11.1□□□□□ -0.63
Gm20546-201ENSMUST00000173141 Gng5Q80SZ7 68 aa11.1□□□□□ -0.63
Gm20546-201ENSMUST00000173141 Anapc13Q8R034 74 aa11.1□□□□□ -0.63
Gm20546-201ENSMUST00000173141 Tppp3Q9CRB6 176 aaKnown RBP11.1□□□□□ -0.63
Gm20546-201ENSMUST00000173141 Ccl28Q9JIL2 130 aa11.1□□□□□ -0.63
Gm20546-201ENSMUST00000173141 Gm28778A0A087WSK7 233 aa11.1□□□□□ -0.63
Gm20546-201ENSMUST00000173141 BokO35425 213 aa11.1□□□□□ -0.63
Gm20546-201ENSMUST00000173141 P04942 107 aa11.1□□□□□ -0.63
Gm20546-201ENSMUST00000173141 FshbQ60687 130 aa11.1□□□□□ -0.63
Gm20546-201ENSMUST00000173141 Mex3bQ69Z36 601 aaKnown RBP11.1□□□□□ -0.63
Gm20546-201ENSMUST00000173141 Tctex1d1Q9D5I4 173 aa11.1□□□□□ -0.63
Gm20546-201ENSMUST00000173141 Egr4Q9WUF2 478 aa11.1□□□□□ -0.63
Gm20546-201ENSMUST00000173141 Ighv5-12-4A0A0A6YWG4 117 aa11.09□□□□□ -0.63
Gm20546-201ENSMUST00000173141 Iglv3A0A0B4J1K5 122 aa11.09□□□□□ -0.63
Gm20546-201ENSMUST00000173141 Igkv14-130A0A0G2JF45 117 aa11.09□□□□□ -0.63
Gm20546-201ENSMUST00000173141 Defa34D3Z0J0 93 aa11.09□□□□□ -0.63
Gm20546-201ENSMUST00000173141 MycbQ6P8Z1 170 aa11.09□□□□□ -0.63
Gm20546-201ENSMUST00000173141 Olfr491Q8VG06 310 aa11.09□□□□□ -0.63
Gm20546-201ENSMUST00000173141 Gnb1lQ9EQ15 326 aa11.09□□□□□ -0.63
Gm20546-201ENSMUST00000173141 Nbeal2Q6ZQA0 2742 aa11.09□□□□□ -0.63
Gm20546-201ENSMUST00000173141 PkdrejQ9Z0T6 2126 aa11.09□□□□□ -0.63
Gm20546-201ENSMUST00000173141 Bsph2Q0Q236 131 aa11.08□□□□□ -0.64
Gm20546-201ENSMUST00000173141 Gm4763Q8CFJ5 196 aa11.08□□□□□ -0.64
Gm20546-201ENSMUST00000173141 Ly96Q9JHF9 160 aa11.08□□□□□ -0.64
Gm20546-201ENSMUST00000173141 Dctn5Q9QZB9 182 aa11.08□□□□□ -0.64
Gm20546-201ENSMUST00000173141 Ighv8-12A0A0G2JDE1 119 aa11.08□□□□□ -0.64
Gm20546-201ENSMUST00000173141 Gm45717A0A1B0GT68 152 aa11.08□□□□□ -0.64
Gm20546-201ENSMUST00000173141 Omt2bD3YX29 119 aa11.08□□□□□ -0.64
Gm20546-201ENSMUST00000173141 Ccl25O35903 144 aa11.08□□□□□ -0.64
Gm20546-201ENSMUST00000173141 Sh2d6Q9D413 297 aa11.08□□□□□ -0.64
Gm20546-201ENSMUST00000173141 Trbv19A0A0B4J1H4 117 aa11.07□□□□□ -0.64
Gm20546-201ENSMUST00000173141 Hint1P70349 126 aaKnown RBP11.07□□□□□ -0.64
Gm20546-201ENSMUST00000173141 Ang6Q5GAN0 147 aa11.07□□□□□ -0.64
Gm20546-201ENSMUST00000173141 Ube2d2bQ6ZWY6 147 aa11.07□□□□□ -0.64
Gm20546-201ENSMUST00000173141 Immp1lQ9CQU8 166 aa11.07□□□□□ -0.64
Gm20546-201ENSMUST00000173141 Rchy1Q9CR50 261 aa11.07□□□□□ -0.64
Gm20546-201ENSMUST00000173141 Zfp950A0A0U1RQ46 609 aa11.06□□□□□ -0.64
Gm20546-201ENSMUST00000173141 Gm5426J3QNM7 103 aa11.06□□□□□ -0.64
Gm20546-201ENSMUST00000173141 Srp14P16254 110 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
Gm20546-201ENSMUST00000173141 Svs5P30933 122 aa11.06□□□□□ -0.64
Gm20546-201ENSMUST00000173141 Fam222aQ6PGH4 453 aa11.06□□□□□ -0.64
Gm20546-201ENSMUST00000173141 Slamf7Q8BHK6 333 aa11.06□□□□□ -0.64
Gm20546-201ENSMUST00000173141 Rasl10aQ8K5A4 203 aa11.06□□□□□ -0.64
Gm20546-201ENSMUST00000173141 Chchd5Q9CQP3 110 aa11.06□□□□□ -0.64
Gm20546-201ENSMUST00000173141 Ssbp2Q9CYZ8 361 aa11.06□□□□□ -0.64
Gm20546-201ENSMUST00000173141 Pgpep1Q9ESW8 209 aa11.06□□□□□ -0.64
Gm20546-201ENSMUST00000173141 Ccl8Q9Z121 97 aa11.06□□□□□ -0.64
Gm20546-201ENSMUST00000173141 Cd27P41272 250 aa11.06□□□□□ -0.64
Gm20546-201ENSMUST00000173141 CampP51437 172 aa11.06□□□□□ -0.64
Gm20546-201ENSMUST00000173141 AmelxP63277 210 aa11.06□□□□□ -0.64
Gm20546-201ENSMUST00000173141 Defa24Q5G865 93 aa11.06□□□□□ -0.64
Gm20546-201ENSMUST00000173141 Olfr981Q8VEU2 310 aa11.06□□□□□ -0.64
Gm20546-201ENSMUST00000173141 Tmem189Q99LQ7 271 aa11.06□□□□□ -0.64
Gm20546-201ENSMUST00000173141 Slc25a39Q9D8K8 359 aa11.06□□□□□ -0.64
Gm20546-201ENSMUST00000173141 Ighv6-7A0A0A6YWU3 119 aa11.05□□□□□ -0.64
Gm20546-201ENSMUST00000173141 Gm21974F6W3F3 119 aa11.05□□□□□ -0.64
Gm20546-201ENSMUST00000173141 Insl3O09107 122 aa11.05□□□□□ -0.64
Gm20546-201ENSMUST00000173141 AamdcQ8R0P4 122 aa11.05□□□□□ -0.64
Gm20546-201ENSMUST00000173141 Rnf114Q9ET26 229 aa11.05□□□□□ -0.64
Gm20546-201ENSMUST00000173141 Xirp2Q4U4S6 3784 aa11.04□□□□□ -0.64
Gm20546-201ENSMUST00000173141 Tnfsf12O54907 249 aa11.04□□□□□ -0.64
Gm20546-201ENSMUST00000173141 P01802 115 aa11.04□□□□□ -0.64
Gm20546-201ENSMUST00000173141 Fgf6P21658 208 aa11.04□□□□□ -0.64
Gm20546-201ENSMUST00000173141 Saa4P31532 130 aa11.04□□□□□ -0.64
Gm20546-201ENSMUST00000173141 Tdgf1P51865 171 aa11.04□□□□□ -0.64
Gm20546-201ENSMUST00000173141 Olfr904Q7TRC9 310 aa11.04□□□□□ -0.64
Gm20546-201ENSMUST00000173141 Tcrg-C3L7N479 172 aa11.04□□□□□ -0.64
Gm20546-201ENSMUST00000173141 Vamp8O70404 101 aa11.04□□□□□ -0.64
Gm20546-201ENSMUST00000173141 P03985 172 aa11.04□□□□□ -0.64
Gm20546-201ENSMUST00000173141 Gm1968Q3T9I3 115 aa11.04□□□□□ -0.64
Gm20546-201ENSMUST00000173141 Olfr311Q5NC59 308 aa11.04□□□□□ -0.64
Gm20546-201ENSMUST00000173141 BB014433Q8C5R5 389 aa11.04□□□□□ -0.64
Gm20546-201ENSMUST00000173141 Ighv1-81A0A075B5Y4 117 aa11.03□□□□□ -0.64
Gm20546-201ENSMUST00000173141 P01792 123 aa11.03□□□□□ -0.64
Gm20546-201ENSMUST00000173141 P0C1Z5 52 aa11.03□□□□□ -0.64
Gm20546-201ENSMUST00000173141 P18530 117 aa11.03□□□□□ -0.64
Gm20546-201ENSMUST00000173141 Timm8bP62077 83 aaKnown RBP11.03□□□□□ -0.64
Gm20546-201ENSMUST00000173141 CnfnQ6PCW6 111 aa11.03□□□□□ -0.64
Gm20546-201ENSMUST00000173141 Chac1Q8R3J5 223 aa11.03□□□□□ -0.64
Gm20546-201ENSMUST00000173141 Cdip1Q9DB75 208 aa11.03□□□□□ -0.64
Gm20546-201ENSMUST00000173141 Gm29644A0A087WPG2 191 aa11.02□□□□□ -0.64
Gm20546-201ENSMUST00000173141 Gm29289A0A087WPY7 166 aa11.02□□□□□ -0.64
Gm20546-201ENSMUST00000173141 Ighv1-31A0A0A6YWK5 117 aa11.02□□□□□ -0.64
Gm20546-201ENSMUST00000173141 Gm867A0A1W2P7T4 151 aa11.02□□□□□ -0.64
Gm20546-201ENSMUST00000173141 Gm36176A0A1W2P8D5 158 aa11.02□□□□□ -0.64
Gm20546-201ENSMUST00000173141 KprpB2RUR4 657 aa11.02□□□□□ -0.64
Gm20546-201ENSMUST00000173141 Olfr1185-ps1F6XP16 303 aa11.02□□□□□ -0.64
Gm20546-201ENSMUST00000173141 MgpP19788 104 aa11.02□□□□□ -0.64
Gm20546-201ENSMUST00000173141 Olfr317Q5NCD6 327 aa11.02□□□□□ -0.64
Gm20546-201ENSMUST00000173141 Q9CX63 252 aa11.02□□□□□ -0.64
Gm20546-201ENSMUST00000173141 Mrpl53Q9D1H8 118 aaKnown RBP11.02□□□□□ -0.64
Gm20546-201ENSMUST00000173141 Gm28539A0A087WSL9 92 aa11.02□□□□□ -0.65
Gm20546-201ENSMUST00000173141 Ighv9-1A0A0B4J1P3 117 aa11.02□□□□□ -0.65
Gm20546-201ENSMUST00000173141 D930048N14RikA2AA67 225 aa11.02□□□□□ -0.65
Gm20546-201ENSMUST00000173141 Wfdc21Q8BTE6 63 aa11.02□□□□□ -0.65
Gm20546-201ENSMUST00000173141 Olfr127Q8VF25 323 aa11.02□□□□□ -0.65
Gm20546-201ENSMUST00000173141 Fbxl15Q91W61 300 aa11.02□□□□□ -0.65
Gm20546-201ENSMUST00000173141 Prss29Q99MS4 279 aa11.02□□□□□ -0.65
Gm20546-201ENSMUST00000173141 Tmem89Q9DA04 169 aa11.02□□□□□ -0.65
Gm20546-201ENSMUST00000173141 Xlr5cQ9JJR2 179 aa11.02□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 96.9 ms