Protein–RNA interactions for Protein: P04942

Ig kappa chain V-VI region NQ5-61.1.2, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04942 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
P04942 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
P04942 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
P04942 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
P04942 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
P04942 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
P04942 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
P04942 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
P04942 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
P04942 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
P04942 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
P04942 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
P04942 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
P04942 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
P04942 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
P04942 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
P04942 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
P04942 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
P04942 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
P04942 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
P04942 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
P04942 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
P04942 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
P04942 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
P04942 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
P04942 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
P04942 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
P04942 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
P04942 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
P04942 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
P04942 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
P04942 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
P04942 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
P04942 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
P04942 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
P04942 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
P04942 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
P04942 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
P04942 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
P04942 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
P04942 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
P04942 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
P04942 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
P04942 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
P04942 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
P04942 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
P04942 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
P04942 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
P04942 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
P04942 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
P04942 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
P04942 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
P04942 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
P04942 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
P04942 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
P04942 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
P04942 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
P04942 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
P04942 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
P04942 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
P04942 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
P04942 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
P04942 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
P04942 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
P04942 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
P04942 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
P04942 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
P04942 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
P04942 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
P04942 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
P04942 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
P04942 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
P04942 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
P04942 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
P04942 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
P04942 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
P04942 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
P04942 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
P04942 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
P04942 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
P04942 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
P04942 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
P04942 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
P04942 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
P04942 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
P04942 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
P04942 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
P04942 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
P04942 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
P04942 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
P04942 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
P04942 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
P04942 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
P04942 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
P04942 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
P04942 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
P04942 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
P04942 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
P04942 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
P04942 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms