Protein–RNA interactions for Protein: P31532

Saa4, Serum amyloid A-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Saa4P31532 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Saa4P31532 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Saa4P31532 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Saa4P31532 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Saa4P31532 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Saa4P31532 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Saa4P31532 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Saa4P31532 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Saa4P31532 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Saa4P31532 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Saa4P31532 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Saa4P31532 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Saa4P31532 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Saa4P31532 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Saa4P31532 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Saa4P31532 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Saa4P31532 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Saa4P31532 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Saa4P31532 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Saa4P31532 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Saa4P31532 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Saa4P31532 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Saa4P31532 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Saa4P31532 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Saa4P31532 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Saa4P31532 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Saa4P31532 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Saa4P31532 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Saa4P31532 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Saa4P31532 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Saa4P31532 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Saa4P31532 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Saa4P31532 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Saa4P31532 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Saa4P31532 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Saa4P31532 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Saa4P31532 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Saa4P31532 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Saa4P31532 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Saa4P31532 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Saa4P31532 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Saa4P31532 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Saa4P31532 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Saa4P31532 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Saa4P31532 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Saa4P31532 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Saa4P31532 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Saa4P31532 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Saa4P31532 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Saa4P31532 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Saa4P31532 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Saa4P31532 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Saa4P31532 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Saa4P31532 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Saa4P31532 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Saa4P31532 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Saa4P31532 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Saa4P31532 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Saa4P31532 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Saa4P31532 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Saa4P31532 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Saa4P31532 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Saa4P31532 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Saa4P31532 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Saa4P31532 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Saa4P31532 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Saa4P31532 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Saa4P31532 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Saa4P31532 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Saa4P31532 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Saa4P31532 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Saa4P31532 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Saa4P31532 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Saa4P31532 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Saa4P31532 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Saa4P31532 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Saa4P31532 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Saa4P31532 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Saa4P31532 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Saa4P31532 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Saa4P31532 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Saa4P31532 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Saa4P31532 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Saa4P31532 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Saa4P31532 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Saa4P31532 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Saa4P31532 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Saa4P31532 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Saa4P31532 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Saa4P31532 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Saa4P31532 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Saa4P31532 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Saa4P31532 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Saa4P31532 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Saa4P31532 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Saa4P31532 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Saa4P31532 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Saa4P31532 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Saa4P31532 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Saa4P31532 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms