Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1K5

Iglv3, Immunoglobulin lambda variable 3 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Iglv3A0A0B4J1K5 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
Iglv3A0A0B4J1K5 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Iglv3A0A0B4J1K5 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Iglv3A0A0B4J1K5 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Iglv3A0A0B4J1K5 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Iglv3A0A0B4J1K5 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Iglv3A0A0B4J1K5 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Iglv3A0A0B4J1K5 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Iglv3A0A0B4J1K5 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Iglv3A0A0B4J1K5 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Iglv3A0A0B4J1K5 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Iglv3A0A0B4J1K5 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Iglv3A0A0B4J1K5 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Iglv3A0A0B4J1K5 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Iglv3A0A0B4J1K5 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Iglv3A0A0B4J1K5 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Iglv3A0A0B4J1K5 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Iglv3A0A0B4J1K5 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Iglv3A0A0B4J1K5 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Iglv3A0A0B4J1K5 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Iglv3A0A0B4J1K5 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Iglv3A0A0B4J1K5 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Iglv3A0A0B4J1K5 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Iglv3A0A0B4J1K5 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Iglv3A0A0B4J1K5 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Iglv3A0A0B4J1K5 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Iglv3A0A0B4J1K5 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Iglv3A0A0B4J1K5 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Iglv3A0A0B4J1K5 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Iglv3A0A0B4J1K5 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Iglv3A0A0B4J1K5 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Iglv3A0A0B4J1K5 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Iglv3A0A0B4J1K5 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Iglv3A0A0B4J1K5 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Iglv3A0A0B4J1K5 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Iglv3A0A0B4J1K5 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Iglv3A0A0B4J1K5 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Iglv3A0A0B4J1K5 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Iglv3A0A0B4J1K5 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Iglv3A0A0B4J1K5 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Iglv3A0A0B4J1K5 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Iglv3A0A0B4J1K5 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Iglv3A0A0B4J1K5 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Iglv3A0A0B4J1K5 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Iglv3A0A0B4J1K5 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Iglv3A0A0B4J1K5 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Iglv3A0A0B4J1K5 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Iglv3A0A0B4J1K5 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Iglv3A0A0B4J1K5 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Iglv3A0A0B4J1K5 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Iglv3A0A0B4J1K5 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Iglv3A0A0B4J1K5 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Iglv3A0A0B4J1K5 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Iglv3A0A0B4J1K5 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Iglv3A0A0B4J1K5 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Iglv3A0A0B4J1K5 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Iglv3A0A0B4J1K5 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Iglv3A0A0B4J1K5 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Iglv3A0A0B4J1K5 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Iglv3A0A0B4J1K5 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Iglv3A0A0B4J1K5 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Iglv3A0A0B4J1K5 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Iglv3A0A0B4J1K5 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Iglv3A0A0B4J1K5 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Iglv3A0A0B4J1K5 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Iglv3A0A0B4J1K5 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Iglv3A0A0B4J1K5 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Iglv3A0A0B4J1K5 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Iglv3A0A0B4J1K5 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Iglv3A0A0B4J1K5 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Iglv3A0A0B4J1K5 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Iglv3A0A0B4J1K5 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Iglv3A0A0B4J1K5 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Iglv3A0A0B4J1K5 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Iglv3A0A0B4J1K5 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Iglv3A0A0B4J1K5 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Iglv3A0A0B4J1K5 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Iglv3A0A0B4J1K5 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Iglv3A0A0B4J1K5 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Iglv3A0A0B4J1K5 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Iglv3A0A0B4J1K5 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Iglv3A0A0B4J1K5 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Iglv3A0A0B4J1K5 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Iglv3A0A0B4J1K5 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Iglv3A0A0B4J1K5 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Iglv3A0A0B4J1K5 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Iglv3A0A0B4J1K5 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Iglv3A0A0B4J1K5 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Iglv3A0A0B4J1K5 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Iglv3A0A0B4J1K5 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Iglv3A0A0B4J1K5 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Iglv3A0A0B4J1K5 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Iglv3A0A0B4J1K5 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Iglv3A0A0B4J1K5 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Iglv3A0A0B4J1K5 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Iglv3A0A0B4J1K5 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Iglv3A0A0B4J1K5 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Iglv3A0A0B4J1K5 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Iglv3A0A0B4J1K5 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Iglv3A0A0B4J1K5 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms