Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8Z1

Mycb, Protein B-Myc, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MycbQ6P8Z1 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
MycbQ6P8Z1 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MycbQ6P8Z1 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MycbQ6P8Z1 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MycbQ6P8Z1 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MycbQ6P8Z1 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MycbQ6P8Z1 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MycbQ6P8Z1 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
MycbQ6P8Z1 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
MycbQ6P8Z1 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MycbQ6P8Z1 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
MycbQ6P8Z1 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MycbQ6P8Z1 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
MycbQ6P8Z1 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MycbQ6P8Z1 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
MycbQ6P8Z1 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MycbQ6P8Z1 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MycbQ6P8Z1 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MycbQ6P8Z1 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
MycbQ6P8Z1 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MycbQ6P8Z1 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MycbQ6P8Z1 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MycbQ6P8Z1 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MycbQ6P8Z1 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MycbQ6P8Z1 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MycbQ6P8Z1 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MycbQ6P8Z1 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MycbQ6P8Z1 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MycbQ6P8Z1 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MycbQ6P8Z1 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MycbQ6P8Z1 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MycbQ6P8Z1 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MycbQ6P8Z1 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MycbQ6P8Z1 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MycbQ6P8Z1 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
MycbQ6P8Z1 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MycbQ6P8Z1 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MycbQ6P8Z1 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MycbQ6P8Z1 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
MycbQ6P8Z1 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MycbQ6P8Z1 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MycbQ6P8Z1 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
MycbQ6P8Z1 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MycbQ6P8Z1 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MycbQ6P8Z1 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MycbQ6P8Z1 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MycbQ6P8Z1 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MycbQ6P8Z1 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
MycbQ6P8Z1 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MycbQ6P8Z1 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MycbQ6P8Z1 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MycbQ6P8Z1 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MycbQ6P8Z1 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MycbQ6P8Z1 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MycbQ6P8Z1 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MycbQ6P8Z1 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MycbQ6P8Z1 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MycbQ6P8Z1 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MycbQ6P8Z1 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
MycbQ6P8Z1 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MycbQ6P8Z1 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MycbQ6P8Z1 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MycbQ6P8Z1 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MycbQ6P8Z1 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
MycbQ6P8Z1 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MycbQ6P8Z1 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MycbQ6P8Z1 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MycbQ6P8Z1 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MycbQ6P8Z1 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MycbQ6P8Z1 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MycbQ6P8Z1 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MycbQ6P8Z1 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MycbQ6P8Z1 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
MycbQ6P8Z1 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
MycbQ6P8Z1 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MycbQ6P8Z1 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
MycbQ6P8Z1 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
MycbQ6P8Z1 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
MycbQ6P8Z1 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MycbQ6P8Z1 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
MycbQ6P8Z1 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
MycbQ6P8Z1 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
MycbQ6P8Z1 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
MycbQ6P8Z1 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MycbQ6P8Z1 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
MycbQ6P8Z1 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
MycbQ6P8Z1 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
MycbQ6P8Z1 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
MycbQ6P8Z1 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
MycbQ6P8Z1 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
MycbQ6P8Z1 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MycbQ6P8Z1 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MycbQ6P8Z1 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MycbQ6P8Z1 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MycbQ6P8Z1 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MycbQ6P8Z1 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MycbQ6P8Z1 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MycbQ6P8Z1 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MycbQ6P8Z1 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MycbQ6P8Z1 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms