RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602338.1

TTLL3-233, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

Gene TTLL3, Length 693 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-233	ENST00000602338		Q5VV11	94 aa		5.37	□□□□□ -1.55
TTLL3-233	ENST00000602338	KMT2D	O14686	5537 aa		5.37	□□□□□ -1.55
TTLL3-233	ENST00000602338	MDN1	Q9NU22	5596 aa		5.36	□□□□□ -1.55
TTLL3-233	ENST00000602338	KRTAP5-9	P26371	169 aa		5.35	□□□□□ -1.55
TTLL3-233	ENST00000602338	KRTAP10-5	P60370	271 aa		5.35	□□□□□ -1.55
TTLL3-233	ENST00000602338	SPRR2G	Q9BYE4	73 aa		5.35	□□□□□ -1.55
TTLL3-233	ENST00000602338	SERP2	Q8N6R1	65 aa		5.33	□□□□□ -1.56
TTLL3-233	ENST00000602338	SMIM20	Q8N5G0	67 aa		5.32	□□□□□ -1.56
TTLL3-233	ENST00000602338	KRTAP3-1	Q9BYR8	98 aa		5.32	□□□□□ -1.56
TTLL3-233	ENST00000602338	TMEM258	P61165	79 aa		5.3	□□□□□ -1.56
TTLL3-233	ENST00000602338		Q8N9L7	120 aa		5.3	□□□□□ -1.56
TTLL3-233	ENST00000602338	HCG22	E2RYF7	251 aa		5.29	□□□□□ -1.56
TTLL3-233	ENST00000602338		S4R3F8	94 aa		5.28	□□□□□ -1.56
TTLL3-233	ENST00000602338	BPY2	O14599	106 aa		5.27	□□□□□ -1.57
TTLL3-233	ENST00000602338	CASC2	Q6XLA1	102 aa		5.27	□□□□□ -1.57
TTLL3-233	ENST00000602338	LCA10	Q71F78	164 aa		5.27	□□□□□ -1.57
TTLL3-233	ENST00000602338	UBL5	Q9BZL1	73 aa		5.26	□□□□□ -1.57
TTLL3-233	ENST00000602338	CSAG1	Q6PB30	78 aa		5.25	□□□□□ -1.57
TTLL3-233	ENST00000602338	CXCL6	P80162	114 aa		5.23	□□□□□ -1.57
TTLL3-233	ENST00000602338	KLKP1	Q107X0	134 aa		5.23	□□□□□ -1.57
TTLL3-233	ENST00000602338	TRAV7	A0A075B6U4	112 aa		5.21	□□□□□ -1.58
TTLL3-233	ENST00000602338	C1orf64	Q8NEQ6	169 aa		5.21	□□□□□ -1.58
TTLL3-233	ENST00000602338		A0A087WVE0	104 aa		5.19	□□□□□ -1.58
TTLL3-233	ENST00000602338	NDUFC1	O43677	76 aa		5.18	□□□□□ -1.58
TTLL3-233	ENST00000602338	KRTAP3-3	Q9BYR6	98 aa		5.18	□□□□□ -1.58
TTLL3-233	ENST00000602338	KRTAP2-3	P0C7H8	128 aa		5.17	□□□□□ -1.58
TTLL3-233	ENST00000602338	KRTAP2-4	Q9BYR9	128 aa		5.17	□□□□□ -1.58
TTLL3-233	ENST00000602338	ATP5E	P56381	51 aa	Predicted RBP	5.16	□□□□□ -1.58
TTLL3-233	ENST00000602338	CYSTM1	Q9H1C7	97 aa		5.15	□□□□□ -1.59
TTLL3-233	ENST00000602338	SERP1	Q9Y6X1	66 aa		5.14	□□□□□ -1.59
TTLL3-233	ENST00000602338	SPRR2F	Q96RM1	72 aa		5.13	□□□□□ -1.59
TTLL3-233	ENST00000602338		H7BZZ5	65 aa		5.11	□□□□□ -1.59
TTLL3-233	ENST00000602338	SPRR2E	P22531	72 aa		5.11	□□□□□ -1.59
TTLL3-233	ENST00000602338	SPRR2B	P35325	72 aa		5.11	□□□□□ -1.59
TTLL3-233	ENST00000602338	SPRR2A	P35326	72 aa		5.11	□□□□□ -1.59
TTLL3-233	ENST00000602338	C20orf197	Q8N268	126 aa		5.11	□□□□□ -1.59
TTLL3-233	ENST00000602338	CRIPT	Q9P021	101 aa		5.1	□□□□□ -1.59
TTLL3-233	ENST00000602338	SMIM26	A0A096LP01	95 aa		5.06	□□□□□ -1.6
TTLL3-233	ENST00000602338	MT1X	P80297	61 aa		5.04	□□□□□ -1.6
TTLL3-233	ENST00000602338	OCR1	Q9BZK8	76 aa		5.04	□□□□□ -1.6
TTLL3-233	ENST00000602338	LCE1A	Q5T7P2	110 aa		5.03	□□□□□ -1.6
TTLL3-233	ENST00000602338	TP53AIP1	Q9HCN2	124 aa		5.03	□□□□□ -1.6
TTLL3-233	ENST00000602338	CYP4F30P	Q9H0H9	118 aa		5.02	□□□□□ -1.61
TTLL3-233	ENST00000602338	KRTAP8-1	Q8IUC2	63 aa		5	□□□□□ -1.61
TTLL3-233	ENST00000602338	KRTAP2-2	Q9BYT5	123 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TTLL3-233	ENST00000602338	KRTAP2-1	Q9BYU5	128 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TTLL3-233	ENST00000602338		H0YAA0	97 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TTLL3-233	ENST00000602338	PRO2289	Q9P1D8	64 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TTLL3-233	ENST00000602338	PRO0628	Q9UI54	55 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TTLL3-233	ENST00000602338	SNURF	Q9Y675	71 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TTLL3-233	ENST00000602338		A8MUN3	132 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TTLL3-233	ENST00000602338	SPRR2D	P22532	72 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TTLL3-233	ENST00000602338	ADM2	Q7Z4H4	148 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TTLL3-233	ENST00000602338	TRAV22	A0A0B4J277	110 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TTLL3-233	ENST00000602338	KRTAP12-2	P59991	146 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TTLL3-233	ENST00000602338	KRTAP4-8	A0A0G2JLE6	195 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TTLL3-233	ENST00000602338	LOC101927531	A0A1B0GV80	90 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TTLL3-233	ENST00000602338		H3BPC8	53 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TTLL3-233	ENST00000602338	KRTAP4-8	Q9BYQ9	185 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TTLL3-233	ENST00000602338		Q1T7F1	81 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TTLL3-233	ENST00000602338	PLAC4	Q8WY50	150 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TTLL3-233	ENST00000602338	SPANXA2-OT1	Q8N9U9	137 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TTLL3-233	ENST00000602338		V9GYY9	64 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TTLL3-233	ENST00000602338	MP68	P56378	58 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TTLL3-233	ENST00000602338	LCE3B	Q5TA77	95 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TTLL3-233	ENST00000602338		H0Y9P7	68 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TTLL3-233	ENST00000602338		P0C880	135 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TTLL3-233	ENST00000602338	KRTAP10-7	P60409	375 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
TTLL3-233	ENST00000602338		R4GN34	69 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TTLL3-233	ENST00000602338		M0QZ58	72 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TTLL3-233	ENST00000602338	BRK1	Q8WUW1	75 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TTLL3-233	ENST00000602338	KRTAP10-12	P60413	245 aa		4.77	□□□□□ -1.65
TTLL3-233	ENST00000602338	GPR98	Q8WXG9	6306 aa		4.76	□□□□□ -1.65
TTLL3-233	ENST00000602338	LINC00208	Q96KT6	92 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TTLL3-233	ENST00000602338	LINC01554	Q52M75	96 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TTLL3-233	ENST00000602338	KRTAP3-2	Q9BYR7	98 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TTLL3-233	ENST00000602338	DST	Q03001	7570 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.66
TTLL3-233	ENST00000602338	PSPHP1	O15172	72 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TTLL3-233	ENST00000602338	PMAIP1	Q13794	54 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TTLL3-233	ENST00000602338	COA5	Q86WW8	74 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TTLL3-233	ENST00000602338	LINC01558	Q9Y6Z2	57 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TTLL3-233	ENST00000602338	DMAC1	Q96GE9	116 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TTLL3-233	ENST00000602338	CHKB-CPT1B	H3BT56	60 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TTLL3-233	ENST00000602338	PRR15L	Q9BU68	103 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TTLL3-233	ENST00000602338	KRTAP4-9	Q9BYQ8	210 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TTLL3-233	ENST00000602338	CDC42SE1	Q9NRR8	79 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TTLL3-233	ENST00000602338	SEC61G	P60059	68 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TTLL3-233	ENST00000602338		A6NED7	52 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TTLL3-233	ENST00000602338	LCE5A	Q5TCM9	118 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TTLL3-233	ENST00000602338	KTN1-AS1	Q86SY8	53 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TTLL3-233	ENST00000602338	ACYP2	P14621	99 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TTLL3-233	ENST00000602338	KRTAP19-7	Q3SYF9	63 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TTLL3-233	ENST00000602338	MT1E	P04732	61 aa		4.48	□□□□□ -1.69
TTLL3-233	ENST00000602338	KRTAP19-3	Q7Z4W3	81 aa		4.48	□□□□□ -1.69
TTLL3-233	ENST00000602338		A8MU10	97 aa		4.46	□□□□□ -1.7
TTLL3-233	ENST00000602338	LCE1D	Q5T752	114 aa		4.45	□□□□□ -1.7
TTLL3-233	ENST00000602338	SPTSSB	Q8NFR3	76 aa		4.45	□□□□□ -1.7
TTLL3-233	ENST00000602338	KRTAP13-4	Q3LI77	160 aa		4.42	□□□□□ -1.7
TTLL3-233	ENST00000602338	SPATA8	Q6RVD6	105 aa		4.42	□□□□□ -1.7
TTLL3-233	ENST00000602338	HMCN1	Q96RW7	5635 aa		4.41	□□□□□ -1.7

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 163.5 ms