RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602319.1

HCG18-242, Transcript of HLA complex group 18, humanhuman

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Gene HCG18, Length 3,342 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCG18-242ENST00000602319 TPRXLQ17RH7 258 aa5.13□□□□□ -1.59
HCG18-242ENST00000602319 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa5.13□□□□□ -1.59
HCG18-242ENST00000602319 C9orf92A6NGG3 77 aa5.13□□□□□ -1.59
HCG18-242ENST00000602319 CRIPTQ9P021 101 aa5.12□□□□□ -1.59
HCG18-242ENST00000602319 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP5.1□□□□□ -1.59
HCG18-242ENST00000602319 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa5.1□□□□□ -1.59
HCG18-242ENST00000602319 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.6
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HCG18-242ENST00000602319 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
HCG18-242ENST00000602319 FAT1Q14517 4588 aa5.06□□□□□ -1.6
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HCG18-242ENST00000602319 C10orf95Q9H7T3 257 aa4.97□□□□□ -1.61
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HCG18-242ENST00000602319 KRTAP10-8P60410 259 aa4.95□□□□□ -1.62
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HCG18-242ENST00000602319 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa3.6□□□□□ -1.83
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HCG18-242ENST00000602319 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa3.56□□□□□ -1.84
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HCG18-242ENST00000602319 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa3.49□□□□□ -1.85
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