RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597198.5

IRF3-217, Transcript of interferon regulatory factor 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene IRF3, Length 1,741 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF3-217ENST00000597198 CRCT1Q9UGL9 99 aa8.06□□□□□ -1.12
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IRF3-217ENST00000597198 LORP23490 312 aaPredicted RBP7.98□□□□□ -1.13
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IRF3-217ENST00000597198 PRO0628Q9UI54 55 aa7.97□□□□□ -1.13
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IRF3-217ENST00000597198 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa7.95□□□□□ -1.14
IRF3-217ENST00000597198 Q1T7F1 81 aa7.9□□□□□ -1.14
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IRF3-217ENST00000597198 A8MUN3 132 aa7.74□□□□□ -1.17
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IRF3-217ENST00000597198 Q5VV11 94 aa7.64□□□□□ -1.19
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IRF3-217ENST00000597198 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
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IRF3-217ENST00000597198 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa7.47□□□□□ -1.21
IRF3-217ENST00000597198 A6NED7 52 aa7.47□□□□□ -1.21
IRF3-217ENST00000597198 H0YAA0 97 aa7.47□□□□□ -1.21
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IRF3-217ENST00000597198 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa7.41□□□□□ -1.22
IRF3-217ENST00000597198 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa7.38□□□□□ -1.23
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IRF3-217ENST00000597198 A8MU10 97 aa7.36□□□□□ -1.23
IRF3-217ENST00000597198 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
IRF3-217ENST00000597198 ADM2Q7Z4H4 148 aa7.35□□□□□ -1.23
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IRF3-217ENST00000597198 SPTSSBQ8NFR3 76 aa7.32□□□□□ -1.24
IRF3-217ENST00000597198 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa7.32□□□□□ -1.24
IRF3-217ENST00000597198 P0C880 135 aa7.29□□□□□ -1.24
IRF3-217ENST00000597198 CRIPTQ9P021 101 aa7.28□□□□□ -1.24
IRF3-217ENST00000597198 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa7.25□□□□□ -1.25
IRF3-217ENST00000597198 UQCR11O14957 56 aa7.24□□□□□ -1.25
IRF3-217ENST00000597198 SPATA8Q6RVD6 105 aa7.24□□□□□ -1.25
IRF3-217ENST00000597198 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa7.23□□□□□ -1.25
IRF3-217ENST00000597198 A6NN06 94 aa7.19□□□□□ -1.26
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IRF3-217ENST00000597198 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
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IRF3-217ENST00000597198 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa6.98□□□□□ -1.29
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IRF3-217ENST00000597198 KRTAP10-5P60370 271 aa6.91□□□□□ -1.3
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IRF3-217ENST00000597198 MT1XP80297 61 aa6.84□□□□□ -1.31
IRF3-217ENST00000597198 K7ERS5 55 aa6.79□□□□□ -1.32
IRF3-217ENST00000597198 PRAC1Q96KF2 57 aa6.75□□□□□ -1.33
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IRF3-217ENST00000597198 PRO2289Q9P1D8 64 aa6.72□□□□□ -1.33
IRF3-217ENST00000597198 A0A0D9SG42 100 aa6.71□□□□□ -1.34
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IRF3-217ENST00000597198 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa6.56□□□□□ -1.36
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IRF3-217ENST00000597198 H3BS24 57 aa6.41□□□□□ -1.38
IRF3-217ENST00000597198 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa6.4□□□□□ -1.38
IRF3-217ENST00000597198 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa6.4□□□□□ -1.38
IRF3-217ENST00000597198 C10orf95Q9H7T3 257 aa6.35□□□□□ -1.39
IRF3-217ENST00000597198 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa6.33□□□□□ -1.4
IRF3-217ENST00000597198 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa6.33□□□□□ -1.4
IRF3-217ENST00000597198 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa6.31□□□□□ -1.4
IRF3-217ENST00000597198 SPRR2FQ96RM1 72 aa6.28□□□□□ -1.4
IRF3-217ENST00000597198 SPRR2EP22531 72 aa6.25□□□□□ -1.41
IRF3-217ENST00000597198 SPRR2BP35325 72 aa6.25□□□□□ -1.41
IRF3-217ENST00000597198 SPRR2AP35326 72 aa6.25□□□□□ -1.41
IRF3-217ENST00000597198 TNP1P09430 55 aa6.17□□□□□ -1.42
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