RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000596522.1

FCHO1-215, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

TSL 4

Gene FCHO1, Length 533 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-215ENST00000596522 KLKP1Q107X0 134 aa6.75□□□□□ -1.33
FCHO1-215ENST00000596522 MT1FP04733 61 aa6.74□□□□□ -1.33
FCHO1-215ENST00000596522 LCA10Q71F78 164 aa6.74□□□□□ -1.33
FCHO1-215ENST00000596522 FSIP2Q5CZC0 6907 aa6.68□□□□□ -1.34
FCHO1-215ENST00000596522 NDUFC1O43677 76 aa6.68□□□□□ -1.34
FCHO1-215ENST00000596522 SERP2Q8N6R1 65 aa6.68□□□□□ -1.34
FCHO1-215ENST00000596522 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa6.66□□□□□ -1.34
FCHO1-215ENST00000596522 DMAC1Q96GE9 116 aa6.65□□□□□ -1.34
FCHO1-215ENST00000596522 USH2AO75445 5202 aa6.58□□□□□ -1.36
FCHO1-215ENST00000596522 C20orf197Q8N268 126 aa6.58□□□□□ -1.36
FCHO1-215ENST00000596522 H0YAA0 97 aa6.57□□□□□ -1.36
FCHO1-215ENST00000596522 ACYP2P14621 99 aa6.57□□□□□ -1.36
FCHO1-215ENST00000596522 SNURFQ9Y675 71 aa6.57□□□□□ -1.36
FCHO1-215ENST00000596522 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa6.55□□□□□ -1.36
FCHO1-215ENST00000596522 COX7CP15954 63 aa6.53□□□□□ -1.36
FCHO1-215ENST00000596522 CRIPTQ9P021 101 aa6.52□□□□□ -1.37
FCHO1-215ENST00000596522 SPTSSBQ8NFR3 76 aa6.51□□□□□ -1.37
FCHO1-215ENST00000596522 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa6.46□□□□□ -1.38
FCHO1-215ENST00000596522 SSPOA2VEC9 5147 aa6.45□□□□□ -1.38
FCHO1-215ENST00000596522 ANAPC13Q9BS18 74 aa6.45□□□□□ -1.38
FCHO1-215ENST00000596522 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa6.44□□□□□ -1.38
FCHO1-215ENST00000596522 ADM2Q7Z4H4 148 aa6.42□□□□□ -1.38
FCHO1-215ENST00000596522 SPRR2GQ9BYE4 73 aa6.42□□□□□ -1.38
FCHO1-215ENST00000596522 H7BZZ5 65 aa6.35□□□□□ -1.39
FCHO1-215ENST00000596522 Q5VV11 94 aa6.35□□□□□ -1.39
FCHO1-215ENST00000596522 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa6.34□□□□□ -1.39
FCHO1-215ENST00000596522 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa6.33□□□□□ -1.4
FCHO1-215ENST00000596522 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
FCHO1-215ENST00000596522 COA5Q86WW8 74 aa6.3□□□□□ -1.4
FCHO1-215ENST00000596522 R4GN34 69 aa6.3□□□□□ -1.4
FCHO1-215ENST00000596522 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
FCHO1-215ENST00000596522 P0C880 135 aa6.26□□□□□ -1.41
FCHO1-215ENST00000596522 CYSTM1Q9H1C7 97 aa6.26□□□□□ -1.41
FCHO1-215ENST00000596522 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
FCHO1-215ENST00000596522 MT1BP07438 61 aa6.24□□□□□ -1.41
FCHO1-215ENST00000596522 CCDC179H3BU77 68 aa6.23□□□□□ -1.41
FCHO1-215ENST00000596522 M0QZ58 72 aa6.23□□□□□ -1.41
FCHO1-215ENST00000596522 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa6.22□□□□□ -1.41
FCHO1-215ENST00000596522 SEC61GP60059 68 aa6.19□□□□□ -1.42
FCHO1-215ENST00000596522 A6NN06 94 aa6.15□□□□□ -1.42
FCHO1-215ENST00000596522 SERP1Q9Y6X1 66 aa6.15□□□□□ -1.42
FCHO1-215ENST00000596522 TMEM258P61165 79 aa6.14□□□□□ -1.43
FCHO1-215ENST00000596522 PLAC4Q8WY50 150 aa6.14□□□□□ -1.43
FCHO1-215ENST00000596522 KRTAP10-5P60370 271 aa6.09□□□□□ -1.43
FCHO1-215ENST00000596522 LINC01554Q52M75 96 aa6.09□□□□□ -1.43
FCHO1-215ENST00000596522 PRO2289Q9P1D8 64 aa6.08□□□□□ -1.44
FCHO1-215ENST00000596522 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
FCHO1-215ENST00000596522 A0A1B0GU69 56 aa6.01□□□□□ -1.45
FCHO1-215ENST00000596522 A0A1B0GU33 70 aa5.98□□□□□ -1.45
FCHO1-215ENST00000596522 PRR15LQ9BU68 103 aa5.98□□□□□ -1.45
FCHO1-215ENST00000596522 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa5.95□□□□□ -1.46
FCHO1-215ENST00000596522 MT1XP80297 61 aa5.93□□□□□ -1.46
FCHO1-215ENST00000596522 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa5.93□□□□□ -1.46
FCHO1-215ENST00000596522 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
FCHO1-215ENST00000596522 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa5.89□□□□□ -1.47
FCHO1-215ENST00000596522 SMIM26A0A096LP01 95 aa5.86□□□□□ -1.47
FCHO1-215ENST00000596522 SPATA8Q6RVD6 105 aa5.85□□□□□ -1.47
FCHO1-215ENST00000596522 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa5.84□□□□□ -1.47
FCHO1-215ENST00000596522 A0A0D9SG42 100 aa5.82□□□□□ -1.48
FCHO1-215ENST00000596522 KRTAP12-2P59991 146 aa5.81□□□□□ -1.48
FCHO1-215ENST00000596522 V9GYY9 64 aa5.81□□□□□ -1.48
FCHO1-215ENST00000596522 PCP4P48539 62 aa5.79□□□□□ -1.48
FCHO1-215ENST00000596522 SPINT4Q6UDR6 99 aa5.76□□□□□ -1.49
FCHO1-215ENST00000596522 UQCR11O14957 56 aa5.75□□□□□ -1.49
FCHO1-215ENST00000596522 KRTAP5-9P26371 169 aa5.72□□□□□ -1.49
FCHO1-215ENST00000596522 KRTAP12-1P59990 96 aa5.72□□□□□ -1.49
FCHO1-215ENST00000596522 Q1T7F1 81 aa5.7□□□□□ -1.5
FCHO1-215ENST00000596522 A8MU10 97 aa5.67□□□□□ -1.5
FCHO1-215ENST00000596522 KRTAP10-12P60413 245 aa5.66□□□□□ -1.5
FCHO1-215ENST00000596522 RPS28P62857 69 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
FCHO1-215ENST00000596522 KMT2DO14686 5537 aa5.65□□□□□ -1.51
FCHO1-215ENST00000596522 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa5.64□□□□□ -1.51
FCHO1-215ENST00000596522 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
FCHO1-215ENST00000596522 MUC12Q9UKN1 5478 aa5.63□□□□□ -1.51
FCHO1-215ENST00000596522 NEBP20929 6669 aa5.6□□□□□ -1.51
FCHO1-215ENST00000596522 MIR22HGQ0VDD5 57 aa5.6□□□□□ -1.51
FCHO1-215ENST00000596522 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa5.59□□□□□ -1.51
FCHO1-215ENST00000596522 PSPHP1O15172 72 aa5.59□□□□□ -1.51
FCHO1-215ENST00000596522 SPRR2FQ96RM1 72 aa5.59□□□□□ -1.51
FCHO1-215ENST00000596522 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa5.59□□□□□ -1.51
FCHO1-215ENST00000596522 MDN1Q9NU22 5596 aa5.56□□□□□ -1.52
FCHO1-215ENST00000596522 K7ERS5 55 aa5.55□□□□□ -1.52
FCHO1-215ENST00000596522 LOC100996750A0A140TA64 210 aa5.51□□□□□ -1.53
FCHO1-215ENST00000596522 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa5.51□□□□□ -1.53
FCHO1-215ENST00000596522 A6NED7 52 aa5.48□□□□□ -1.53
FCHO1-215ENST00000596522 SPRR2EP22531 72 aa5.48□□□□□ -1.53
FCHO1-215ENST00000596522 SPRR2BP35325 72 aa5.48□□□□□ -1.53
FCHO1-215ENST00000596522 SPRR2AP35326 72 aa5.48□□□□□ -1.53
FCHO1-215ENST00000596522 TNP1P09430 55 aa5.46□□□□□ -1.54
FCHO1-215ENST00000596522 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa5.46□□□□□ -1.54
FCHO1-215ENST00000596522 LCE1AQ5T7P2 110 aa5.43□□□□□ -1.54
FCHO1-215ENST00000596522 C10orf95Q9H7T3 257 aa5.42□□□□□ -1.54
FCHO1-215ENST00000596522 H3BS24 57 aa5.4□□□□□ -1.54
FCHO1-215ENST00000596522 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa5.35□□□□□ -1.55
FCHO1-215ENST00000596522 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa5.35□□□□□ -1.55
FCHO1-215ENST00000596522 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa5.31□□□□□ -1.56
FCHO1-215ENST00000596522 SPRR2DP22532 72 aa5.3□□□□□ -1.56
FCHO1-215ENST00000596522 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa5.3□□□□□ -1.56
FCHO1-215ENST00000596522 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa5.28□□□□□ -1.56
FCHO1-215ENST00000596522 MT1EP04732 61 aa5.25□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.7 ms