RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568477.5

CMTM3-215, Transcript of CKLF like MARVEL transmembrane domain containing 3, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CMTM3, Length 687 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM3-215ENST00000568477 MT1FP04733 61 aa7.07□□□□□ -1.28
CMTM3-215ENST00000568477 RPS28P62857 69 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
CMTM3-215ENST00000568477 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa7.06□□□□□ -1.28
CMTM3-215ENST00000568477 USH2AO75445 5202 aa7.06□□□□□ -1.28
CMTM3-215ENST00000568477 IGKV2-30P06310 120 aa7.05□□□□□ -1.28
CMTM3-215ENST00000568477 KRTAP10-10P60014 251 aa7.05□□□□□ -1.28
CMTM3-215ENST00000568477 SERP1Q9Y6X1 66 aa7.02□□□□□ -1.29
CMTM3-215ENST00000568477 SSPOA2VEC9 5147 aa7.01□□□□□ -1.29
CMTM3-215ENST00000568477 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa7□□□□□ -1.29
CMTM3-215ENST00000568477 LCE2BO14633 110 aa6.97□□□□□ -1.29
CMTM3-215ENST00000568477 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa6.96□□□□□ -1.3
CMTM3-215ENST00000568477 C7orf65Q6ZTY9 151 aa6.96□□□□□ -1.3
CMTM3-215ENST00000568477 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa6.93□□□□□ -1.3
CMTM3-215ENST00000568477 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
CMTM3-215ENST00000568477 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa6.88□□□□□ -1.31
CMTM3-215ENST00000568477 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
CMTM3-215ENST00000568477 DMAC1Q96GE9 116 aa6.86□□□□□ -1.31
CMTM3-215ENST00000568477 SMIM26A0A096LP01 95 aa6.85□□□□□ -1.31
CMTM3-215ENST00000568477 ACYP2P14621 99 aa6.85□□□□□ -1.31
CMTM3-215ENST00000568477 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa6.82□□□□□ -1.32
CMTM3-215ENST00000568477 COA5Q86WW8 74 aa6.82□□□□□ -1.32
CMTM3-215ENST00000568477 A8MUN3 132 aa6.81□□□□□ -1.32
CMTM3-215ENST00000568477 C4orf26Q17RF5 130 aa6.81□□□□□ -1.32
CMTM3-215ENST00000568477 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa6.74□□□□□ -1.33
CMTM3-215ENST00000568477 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa6.71□□□□□ -1.34
CMTM3-215ENST00000568477 Q1T7F1 81 aa6.7□□□□□ -1.34
CMTM3-215ENST00000568477 V9GYY9 64 aa6.7□□□□□ -1.34
CMTM3-215ENST00000568477 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa6.69□□□□□ -1.34
CMTM3-215ENST00000568477 S4R3F8 94 aa6.68□□□□□ -1.34
CMTM3-215ENST00000568477 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
CMTM3-215ENST00000568477 CSAG1Q6PB30 78 aa6.64□□□□□ -1.35
CMTM3-215ENST00000568477 LCA10Q71F78 164 aa6.62□□□□□ -1.35
CMTM3-215ENST00000568477 SPTSSBQ8NFR3 76 aa6.61□□□□□ -1.35
CMTM3-215ENST00000568477 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa6.61□□□□□ -1.35
CMTM3-215ENST00000568477 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
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CMTM3-215ENST00000568477 PSPHP1O15172 72 aa6.51□□□□□ -1.37
CMTM3-215ENST00000568477 Q5VV11 94 aa6.5□□□□□ -1.37
CMTM3-215ENST00000568477 SPRR2GQ9BYE4 73 aa6.5□□□□□ -1.37
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CMTM3-215ENST00000568477 MT1BP07438 61 aa6.48□□□□□ -1.37
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CMTM3-215ENST00000568477 A0A1B0GU69 56 aa6.46□□□□□ -1.38
CMTM3-215ENST00000568477 A6NN06 94 aa6.44□□□□□ -1.38
CMTM3-215ENST00000568477 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa6.44□□□□□ -1.38
CMTM3-215ENST00000568477 SEC61GP60059 68 aa6.42□□□□□ -1.38
CMTM3-215ENST00000568477 CRIPTQ9P021 101 aa6.41□□□□□ -1.38
CMTM3-215ENST00000568477 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa6.36□□□□□ -1.39
CMTM3-215ENST00000568477 KRTAP10-5P60370 271 aa6.35□□□□□ -1.39
CMTM3-215ENST00000568477 A6NED7 52 aa6.34□□□□□ -1.39
CMTM3-215ENST00000568477 H0YAA0 97 aa6.34□□□□□ -1.39
CMTM3-215ENST00000568477 BRK1Q8WUW1 75 aa6.3□□□□□ -1.4
CMTM3-215ENST00000568477 UQCR11O14957 56 aa6.29□□□□□ -1.4
CMTM3-215ENST00000568477 ADM2Q7Z4H4 148 aa6.27□□□□□ -1.41
CMTM3-215ENST00000568477 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa6.26□□□□□ -1.41
CMTM3-215ENST00000568477 A0A1B0GU33 70 aa6.25□□□□□ -1.41
CMTM3-215ENST00000568477 NEBP20929 6669 aa6.25□□□□□ -1.41
CMTM3-215ENST00000568477 SPATA8Q6RVD6 105 aa6.24□□□□□ -1.41
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CMTM3-215ENST00000568477 MIR22HGQ0VDD5 57 aa6.21□□□□□ -1.42
CMTM3-215ENST00000568477 P0C880 135 aa6.16□□□□□ -1.42
CMTM3-215ENST00000568477 A8MU10 97 aa6.15□□□□□ -1.42
CMTM3-215ENST00000568477 MUC12Q9UKN1 5478 aa6.15□□□□□ -1.43
CMTM3-215ENST00000568477 R4GN34 69 aa6.13□□□□□ -1.43
CMTM3-215ENST00000568477 KRTAP5-9P26371 169 aa6.12□□□□□ -1.43
CMTM3-215ENST00000568477 PRO2289Q9P1D8 64 aa6.12□□□□□ -1.43
CMTM3-215ENST00000568477 PLAC4Q8WY50 150 aa6.11□□□□□ -1.43
CMTM3-215ENST00000568477 M0QZ58 72 aa6.09□□□□□ -1.43
CMTM3-215ENST00000568477 MT1XP80297 61 aa6.07□□□□□ -1.44
CMTM3-215ENST00000568477 KMT2DO14686 5537 aa6.06□□□□□ -1.44
CMTM3-215ENST00000568477 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa6.05□□□□□ -1.44
CMTM3-215ENST00000568477 MDN1Q9NU22 5596 aa6□□□□□ -1.45
CMTM3-215ENST00000568477 LINC01554Q52M75 96 aa6□□□□□ -1.45
CMTM3-215ENST00000568477 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa5.99□□□□□ -1.45
CMTM3-215ENST00000568477 PMAIP1Q13794 54 aa5.98□□□□□ -1.45
CMTM3-215ENST00000568477 K7ERS5 55 aa5.95□□□□□ -1.46
CMTM3-215ENST00000568477 A0A0D9SG42 100 aa5.94□□□□□ -1.46
CMTM3-215ENST00000568477 KRTAP12-2P59991 146 aa5.94□□□□□ -1.46
CMTM3-215ENST00000568477 SPRR2FQ96RM1 72 aa5.94□□□□□ -1.46
CMTM3-215ENST00000568477 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa5.92□□□□□ -1.46
CMTM3-215ENST00000568477 SPRR2EP22531 72 aa5.87□□□□□ -1.47
CMTM3-215ENST00000568477 SPRR2BP35325 72 aa5.87□□□□□ -1.47
CMTM3-215ENST00000568477 SPRR2AP35326 72 aa5.87□□□□□ -1.47
CMTM3-215ENST00000568477 SVIPQ8NHG7 77 aa5.87□□□□□ -1.47
CMTM3-215ENST00000568477 KRTAP12-1P59990 96 aa5.86□□□□□ -1.47
CMTM3-215ENST00000568477 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa5.82□□□□□ -1.48
CMTM3-215ENST00000568477 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa5.82□□□□□ -1.48
CMTM3-215ENST00000568477 SPINT4Q6UDR6 99 aa5.81□□□□□ -1.48
CMTM3-215ENST00000568477 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa5.8□□□□□ -1.48
CMTM3-215ENST00000568477 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa5.8□□□□□ -1.48
CMTM3-215ENST00000568477 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP5.78□□□□□ -1.48
CMTM3-215ENST00000568477 LCE1AQ5T7P2 110 aa5.78□□□□□ -1.48
CMTM3-215ENST00000568477 KRTAP10-12P60413 245 aa5.76□□□□□ -1.49
CMTM3-215ENST00000568477 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa5.76□□□□□ -1.49
CMTM3-215ENST00000568477 ROMO1P60602 79 aa5.7□□□□□ -1.5
CMTM3-215ENST00000568477 SPRR2DP22532 72 aa5.68□□□□□ -1.5
CMTM3-215ENST00000568477 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa5.64□□□□□ -1.51
CMTM3-215ENST00000568477 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa5.63□□□□□ -1.51
CMTM3-215ENST00000568477 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa5.63□□□□□ -1.51
CMTM3-215ENST00000568477 PRAC1Q96KF2 57 aa5.55□□□□□ -1.52
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