RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567620.1

CHTF18-217, Transcript of chromosome transmission fidelity factor 18, humanhuman

TSL 5

Gene CHTF18, Length 701 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTF18-217ENST00000567620 C4orf26Q17RF5 130 aa7.24□□□□□ -1.25
CHTF18-217ENST00000567620 NDUFC1O43677 76 aa7.21□□□□□ -1.26
CHTF18-217ENST00000567620 CCDC179H3BU77 68 aa7.19□□□□□ -1.26
CHTF18-217ENST00000567620 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa7.16□□□□□ -1.26
CHTF18-217ENST00000567620 A8MUN3 132 aa7.15□□□□□ -1.26
CHTF18-217ENST00000567620 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa7.15□□□□□ -1.26
CHTF18-217ENST00000567620 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa7.15□□□□□ -1.26
CHTF18-217ENST00000567620 LCE2BO14633 110 aa7.13□□□□□ -1.27
CHTF18-217ENST00000567620 H7BZZ5 65 aa7.12□□□□□ -1.27
CHTF18-217ENST00000567620 CYSTM1Q9H1C7 97 aa7.12□□□□□ -1.27
CHTF18-217ENST00000567620 DMAC1Q96GE9 116 aa7.11□□□□□ -1.27
CHTF18-217ENST00000567620 PCP4P48539 62 aa7.07□□□□□ -1.28
CHTF18-217ENST00000567620 USH2AO75445 5202 aa7.05□□□□□ -1.28
CHTF18-217ENST00000567620 ACYP2P14621 99 aa7.04□□□□□ -1.28
CHTF18-217ENST00000567620 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa7.02□□□□□ -1.29
CHTF18-217ENST00000567620 S4R3F8 94 aa7.02□□□□□ -1.29
CHTF18-217ENST00000567620 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
CHTF18-217ENST00000567620 TMEM258P61165 79 aa6.99□□□□□ -1.29
CHTF18-217ENST00000567620 CSAG1Q6PB30 78 aa6.97□□□□□ -1.29
CHTF18-217ENST00000567620 LCA10Q71F78 164 aa6.97□□□□□ -1.29
CHTF18-217ENST00000567620 SSPOA2VEC9 5147 aa6.97□□□□□ -1.29
CHTF18-217ENST00000567620 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
CHTF18-217ENST00000567620 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa6.92□□□□□ -1.3
CHTF18-217ENST00000567620 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa6.9□□□□□ -1.3
CHTF18-217ENST00000567620 COA5Q86WW8 74 aa6.88□□□□□ -1.31
CHTF18-217ENST00000567620 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa6.87□□□□□ -1.31
CHTF18-217ENST00000567620 SPTSSBQ8NFR3 76 aa6.87□□□□□ -1.31
CHTF18-217ENST00000567620 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa6.86□□□□□ -1.31
CHTF18-217ENST00000567620 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
CHTF18-217ENST00000567620 SERP1Q9Y6X1 66 aa6.76□□□□□ -1.33
CHTF18-217ENST00000567620 H0YAA0 97 aa6.74□□□□□ -1.33
CHTF18-217ENST00000567620 Q5VV11 94 aa6.74□□□□□ -1.33
CHTF18-217ENST00000567620 SPRR2GQ9BYE4 73 aa6.71□□□□□ -1.34
CHTF18-217ENST00000567620 A6NN06 94 aa6.66□□□□□ -1.34
CHTF18-217ENST00000567620 ADM2Q7Z4H4 148 aa6.66□□□□□ -1.34
CHTF18-217ENST00000567620 CRIPTQ9P021 101 aa6.66□□□□□ -1.34
CHTF18-217ENST00000567620 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
CHTF18-217ENST00000567620 MT1BP07438 61 aa6.65□□□□□ -1.34
CHTF18-217ENST00000567620 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa6.65□□□□□ -1.34
CHTF18-217ENST00000567620 RPS28P62857 69 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
CHTF18-217ENST00000567620 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
CHTF18-217ENST00000567620 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa6.61□□□□□ -1.35
CHTF18-217ENST00000567620 SEC61GP60059 68 aa6.6□□□□□ -1.35
CHTF18-217ENST00000567620 P0C880 135 aa6.56□□□□□ -1.36
CHTF18-217ENST00000567620 SMIM26A0A096LP01 95 aa6.55□□□□□ -1.36
CHTF18-217ENST00000567620 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa6.55□□□□□ -1.36
CHTF18-217ENST00000567620 A0A1B0GU69 56 aa6.54□□□□□ -1.36
CHTF18-217ENST00000567620 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa6.52□□□□□ -1.37
CHTF18-217ENST00000567620 V9GYY9 64 aa6.52□□□□□ -1.37
CHTF18-217ENST00000567620 KRTAP10-5P60370 271 aa6.51□□□□□ -1.37
CHTF18-217ENST00000567620 PRR15LQ9BU68 103 aa6.51□□□□□ -1.37
CHTF18-217ENST00000567620 Q1T7F1 81 aa6.49□□□□□ -1.37
CHTF18-217ENST00000567620 R4GN34 69 aa6.46□□□□□ -1.38
CHTF18-217ENST00000567620 M0QZ58 72 aa6.44□□□□□ -1.38
CHTF18-217ENST00000567620 A0A1B0GU33 70 aa6.42□□□□□ -1.38
CHTF18-217ENST00000567620 PLAC4Q8WY50 150 aa6.42□□□□□ -1.38
CHTF18-217ENST00000567620 LINC01554Q52M75 96 aa6.36□□□□□ -1.39
CHTF18-217ENST00000567620 PRO2289Q9P1D8 64 aa6.36□□□□□ -1.39
CHTF18-217ENST00000567620 PSPHP1O15172 72 aa6.34□□□□□ -1.39
CHTF18-217ENST00000567620 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa6.33□□□□□ -1.4
CHTF18-217ENST00000567620 UQCR11O14957 56 aa6.29□□□□□ -1.4
CHTF18-217ENST00000567620 SPATA8Q6RVD6 105 aa6.29□□□□□ -1.4
CHTF18-217ENST00000567620 MT1XP80297 61 aa6.25□□□□□ -1.41
CHTF18-217ENST00000567620 NEBP20929 6669 aa6.2□□□□□ -1.42
CHTF18-217ENST00000567620 A0A0D9SG42 100 aa6.19□□□□□ -1.42
CHTF18-217ENST00000567620 MIR22HGQ0VDD5 57 aa6.19□□□□□ -1.42
CHTF18-217ENST00000567620 A6NED7 52 aa6.18□□□□□ -1.42
CHTF18-217ENST00000567620 KRTAP5-9P26371 169 aa6.18□□□□□ -1.42
CHTF18-217ENST00000567620 A8MU10 97 aa6.15□□□□□ -1.42
CHTF18-217ENST00000567620 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa6.11□□□□□ -1.43
CHTF18-217ENST00000567620 SPRR2FQ96RM1 72 aa6.11□□□□□ -1.43
CHTF18-217ENST00000567620 KRTAP12-1P59990 96 aa6.1□□□□□ -1.43
CHTF18-217ENST00000567620 KRTAP12-2P59991 146 aa6.08□□□□□ -1.44
CHTF18-217ENST00000567620 SPINT4Q6UDR6 99 aa6.08□□□□□ -1.44
CHTF18-217ENST00000567620 MUC12Q9UKN1 5478 aa6.07□□□□□ -1.44
CHTF18-217ENST00000567620 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa6.05□□□□□ -1.44
CHTF18-217ENST00000567620 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa6.04□□□□□ -1.44
CHTF18-217ENST00000567620 KMT2DO14686 5537 aa6.04□□□□□ -1.44
CHTF18-217ENST00000567620 SPRR2EP22531 72 aa6.02□□□□□ -1.45
CHTF18-217ENST00000567620 SPRR2BP35325 72 aa6.02□□□□□ -1.45
CHTF18-217ENST00000567620 SPRR2AP35326 72 aa6.02□□□□□ -1.45
CHTF18-217ENST00000567620 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa6.02□□□□□ -1.45
CHTF18-217ENST00000567620 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa6□□□□□ -1.45
CHTF18-217ENST00000567620 K7ERS5 55 aa6□□□□□ -1.45
CHTF18-217ENST00000567620 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa6□□□□□ -1.45
CHTF18-217ENST00000567620 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
CHTF18-217ENST00000567620 KRTAP10-12P60413 245 aa5.93□□□□□ -1.46
CHTF18-217ENST00000567620 MDN1Q9NU22 5596 aa5.92□□□□□ -1.46
CHTF18-217ENST00000567620 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa5.91□□□□□ -1.46
CHTF18-217ENST00000567620 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa5.91□□□□□ -1.46
CHTF18-217ENST00000567620 BRK1Q8WUW1 75 aa5.89□□□□□ -1.47
CHTF18-217ENST00000567620 LCE1AQ5T7P2 110 aa5.88□□□□□ -1.47
CHTF18-217ENST00000567620 SPRR2DP22532 72 aa5.81□□□□□ -1.48
CHTF18-217ENST00000567620 C10orf95Q9H7T3 257 aa5.79□□□□□ -1.48
CHTF18-217ENST00000567620 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa5.71□□□□□ -1.5
CHTF18-217ENST00000567620 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa5.71□□□□□ -1.5
CHTF18-217ENST00000567620 TNP1P09430 55 aa5.69□□□□□ -1.5
CHTF18-217ENST00000567620 ROMO1P60602 79 aa5.68□□□□□ -1.5
CHTF18-217ENST00000567620 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa5.64□□□□□ -1.51
CHTF18-217ENST00000567620 LCE3BQ5TA77 95 aa5.64□□□□□ -1.51
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