RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563200.5

PPP4C-205, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, human

TSL 5

Gene PPP4C, Length 1,447 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP4C-205	ENST00000563200	KRTAP19-6	Q3LI70	58 aa		10.17	□□□□□ -0.78
PPP4C-205	ENST00000563200	KRTAP3-1	Q9BYR8	98 aa		10.16	□□□□□ -0.78
PPP4C-205	ENST00000563200	MACF1	Q9UPN3	7388 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.78
PPP4C-205	ENST00000563200	KLKP1	Q107X0	134 aa		10.11	□□□□□ -0.79
PPP4C-205	ENST00000563200	ATP5E	P56381	51 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
PPP4C-205	ENST00000563200	TP53AIP1	Q9HCN2	124 aa		10.1	□□□□□ -0.79
PPP4C-205	ENST00000563200	C20orf197	Q8N268	126 aa		10.05	□□□□□ -0.8
PPP4C-205	ENST00000563200	SYNE2	Q8WXH0	6885 aa	Known RBP	10.05	□□□□□ -0.8
PPP4C-205	ENST00000563200	C1orf64	Q8NEQ6	169 aa		10.04	□□□□□ -0.8
PPP4C-205	ENST00000563200	C5orf47	Q569G3	176 aa		10.03	□□□□□ -0.8
PPP4C-205	ENST00000563200	SVIP	Q8NHG7	77 aa		10	□□□□□ -0.81
PPP4C-205	ENST00000563200		S4R3F8	94 aa		10	□□□□□ -0.81
PPP4C-205	ENST00000563200	LCA10	Q71F78	164 aa		9.97	□□□□□ -0.81
PPP4C-205	ENST00000563200	SERP1	Q9Y6X1	66 aa		9.96	□□□□□ -0.82
PPP4C-205	ENST00000563200		H7BZZ5	65 aa		9.95	□□□□□ -0.82
PPP4C-205	ENST00000563200	CSAG1	Q6PB30	78 aa		9.94	□□□□□ -0.82
PPP4C-205	ENST00000563200	OCR1	Q9BZK8	76 aa		9.93	□□□□□ -0.82
PPP4C-205	ENST00000563200	CYP4F30P	Q9H0H9	118 aa		9.93	□□□□□ -0.82
PPP4C-205	ENST00000563200	CYSTM1	Q9H1C7	97 aa		9.91	□□□□□ -0.82
PPP4C-205	ENST00000563200	TRAV22	A0A0B4J277	110 aa		9.87	□□□□□ -0.83
PPP4C-205	ENST00000563200	KRTAP3-3	Q9BYR6	98 aa		9.87	□□□□□ -0.83
PPP4C-205	ENST00000563200	LOC101927531	A0A1B0GV80	90 aa		9.83	□□□□□ -0.84
PPP4C-205	ENST00000563200	SPRR2G	Q9BYE4	73 aa		9.82	□□□□□ -0.84
PPP4C-205	ENST00000563200	SNURF	Q9Y675	71 aa		9.82	□□□□□ -0.84
PPP4C-205	ENST00000563200		H3BPC8	53 aa		9.81	□□□□□ -0.84
PPP4C-205	ENST00000563200	MT1B	P07438	61 aa		9.8	□□□□□ -0.84
PPP4C-205	ENST00000563200	SMIM26	A0A096LP01	95 aa		9.79	□□□□□ -0.84
PPP4C-205	ENST00000563200	KRTAP19-8	Q3LI54	63 aa		9.77	□□□□□ -0.85
PPP4C-205	ENST00000563200	MP68	P56378	58 aa		9.76	□□□□□ -0.85
PPP4C-205	ENST00000563200		Q5VV11	94 aa		9.73	□□□□□ -0.85
PPP4C-205	ENST00000563200		H0Y9P7	68 aa		9.7	□□□□□ -0.86
PPP4C-205	ENST00000563200	KRTAP6-3	Q3LI67	103 aa		9.68	□□□□□ -0.86
PPP4C-205	ENST00000563200		A6NN06	94 aa		9.64	□□□□□ -0.87
PPP4C-205	ENST00000563200	SPANXA2-OT1	Q8N9U9	137 aa		9.61	□□□□□ -0.87
PPP4C-205	ENST00000563200	CRIPT	Q9P021	101 aa		9.61	□□□□□ -0.87
PPP4C-205	ENST00000563200	KRTAP10-5	P60370	271 aa		9.56	□□□□□ -0.88
PPP4C-205	ENST00000563200		A8MUN3	132 aa		9.55	□□□□□ -0.88
PPP4C-205	ENST00000563200		H0YAA0	97 aa		9.55	□□□□□ -0.88
PPP4C-205	ENST00000563200	LINC00208	Q96KT6	92 aa		9.55	□□□□□ -0.88
PPP4C-205	ENST00000563200		V9GYY9	64 aa		9.53	□□□□□ -0.88
PPP4C-205	ENST00000563200		Q1T7F1	81 aa		9.44	□□□□□ -0.9
PPP4C-205	ENST00000563200	MUC12	Q9UKN1	5478 aa		9.42	□□□□□ -0.9
PPP4C-205	ENST00000563200	NEB	P20929	6669 aa		9.42	□□□□□ -0.9
PPP4C-205	ENST00000563200	ADM2	Q7Z4H4	148 aa		9.41	□□□□□ -0.9
PPP4C-205	ENST00000563200	PRO0628	Q9UI54	55 aa		9.4	□□□□□ -0.9
PPP4C-205	ENST00000563200	DMAC1	Q96GE9	116 aa		9.29	□□□□□ -0.92
PPP4C-205	ENST00000563200	KRTAP5-9	P26371	169 aa		9.25	□□□□□ -0.93
PPP4C-205	ENST00000563200	KMT2D	O14686	5537 aa		9.23	□□□□□ -0.93
PPP4C-205	ENST00000563200		P0C880	135 aa		9.22	□□□□□ -0.93
PPP4C-205	ENST00000563200	COA5	Q86WW8	74 aa		9.2	□□□□□ -0.94
PPP4C-205	ENST00000563200	BRK1	Q8WUW1	75 aa		9.2	□□□□□ -0.94
PPP4C-205	ENST00000563200	MT1X	P80297	61 aa		9.17	□□□□□ -0.94
PPP4C-205	ENST00000563200	KRTAP3-2	Q9BYR7	98 aa		9.17	□□□□□ -0.94
PPP4C-205	ENST00000563200		R4GN34	69 aa		9.16	□□□□□ -0.94
PPP4C-205	ENST00000563200	MDN1	Q9NU22	5596 aa		9.14	□□□□□ -0.95
PPP4C-205	ENST00000563200	PRO2289	Q9P1D8	64 aa		9.13	□□□□□ -0.95
PPP4C-205	ENST00000563200	PLAC4	Q8WY50	150 aa		9.12	□□□□□ -0.95
PPP4C-205	ENST00000563200	ACYP2	P14621	99 aa		9.11	□□□□□ -0.95
PPP4C-205	ENST00000563200		M0QZ58	72 aa		9.08	□□□□□ -0.96
PPP4C-205	ENST00000563200	LINC01558	Q9Y6Z2	57 aa		9.08	□□□□□ -0.96
PPP4C-205	ENST00000563200	PSPHP1	O15172	72 aa		9.06	□□□□□ -0.96
PPP4C-205	ENST00000563200	PRR15L	Q9BU68	103 aa		9.03	□□□□□ -0.96
PPP4C-205	ENST00000563200	CHKB-CPT1B	H3BT56	60 aa		9	□□□□□ -0.97
PPP4C-205	ENST00000563200	KRTAP12-2	P59991	146 aa		8.96	□□□□□ -0.98
PPP4C-205	ENST00000563200	KRTAP20-1	Q3LI63	56 aa		8.96	□□□□□ -0.98
PPP4C-205	ENST00000563200	LINC01554	Q52M75	96 aa		8.94	□□□□□ -0.98
PPP4C-205	ENST00000563200		A6NED7	52 aa		8.91	□□□□□ -0.98
PPP4C-205	ENST00000563200	SPRR2F	Q96RM1	72 aa		8.91	□□□□□ -0.98
PPP4C-205	ENST00000563200	CDC42SE1	Q9NRR8	79 aa		8.89	□□□□□ -0.99
PPP4C-205	ENST00000563200	SPTSSB	Q8NFR3	76 aa		8.88	□□□□□ -0.99
PPP4C-205	ENST00000563200	KRTAP8-1	Q8IUC2	63 aa		8.86	□□□□□ -0.99
PPP4C-205	ENST00000563200	KRTAP4-8	A0A0G2JLE6	195 aa		8.8	□□□□□ -1
PPP4C-205	ENST00000563200	KRTAP4-8	Q9BYQ9	185 aa		8.8	□□□□□ -1
PPP4C-205	ENST00000563200	SPRR2E	P22531	72 aa		8.78	□□□□□ -1
PPP4C-205	ENST00000563200	SPRR2B	P35325	72 aa		8.78	□□□□□ -1
PPP4C-205	ENST00000563200	SPRR2A	P35326	72 aa		8.78	□□□□□ -1
PPP4C-205	ENST00000563200	PMAIP1	Q13794	54 aa		8.78	□□□□□ -1
PPP4C-205	ENST00000563200		A0A1B0GU69	56 aa		8.75	□□□□□ -1.01
PPP4C-205	ENST00000563200	KRTAP10-7	P60409	375 aa	Predicted RBP	8.74	□□□□□ -1.01
PPP4C-205	ENST00000563200	KRTAP2-3	P0C7H8	128 aa		8.72	□□□□□ -1.01
PPP4C-205	ENST00000563200	LCE1A	Q5T7P2	110 aa		8.72	□□□□□ -1.01
PPP4C-205	ENST00000563200	KRTAP2-4	Q9BYR9	128 aa		8.72	□□□□□ -1.01
PPP4C-205	ENST00000563200	KRTAP10-12	P60413	245 aa		8.71	□□□□□ -1.01
PPP4C-205	ENST00000563200	SEC61G	P60059	68 aa		8.67	□□□□□ -1.02
PPP4C-205	ENST00000563200	UQCR11	O14957	56 aa		8.65	□□□□□ -1.02
PPP4C-205	ENST00000563200	KTN1-AS1	Q86SY8	53 aa		8.63	□□□□□ -1.03
PPP4C-205	ENST00000563200	KRTAP13-4	Q3LI77	160 aa		8.62	□□□□□ -1.03
PPP4C-205	ENST00000563200	SPATA8	Q6RVD6	105 aa		8.6	□□□□□ -1.03
PPP4C-205	ENST00000563200	MIR22HG	Q0VDD5	57 aa		8.54	□□□□□ -1.04
PPP4C-205	ENST00000563200		A8MU10	97 aa		8.51	□□□□□ -1.05
PPP4C-205	ENST00000563200	SPRR2D	P22532	72 aa		8.49	□□□□□ -1.05
PPP4C-205	ENST00000563200	KRTAP2-2	Q9BYT5	123 aa		8.45	□□□□□ -1.06
PPP4C-205	ENST00000563200	KRTAP2-1	Q9BYU5	128 aa		8.45	□□□□□ -1.06
PPP4C-205	ENST00000563200	CAMK2N1	Q7Z7J9	78 aa		8.39	□□□□□ -1.07
PPP4C-205	ENST00000563200		A0A1B0GU33	70 aa		8.29	□□□□□ -1.08
PPP4C-205	ENST00000563200		A0A0D9SG42	100 aa		8.28	□□□□□ -1.08
PPP4C-205	ENST00000563200	LCE3B	Q5TA77	95 aa		8.28	□□□□□ -1.08
PPP4C-205	ENST00000563200		K7ERS5	55 aa		8.24	□□□□□ -1.09
PPP4C-205	ENST00000563200	KRTAP19-7	Q3SYF9	63 aa		8.21	□□□□□ -1.09
PPP4C-205	ENST00000563200	KRTAP12-1	P59990	96 aa		8.16	□□□□□ -1.1

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39 ms