RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560725.1

TMOD3-208, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 4

Gene TMOD3, Length 544 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-208ENST00000560725 J3KT08 172 aa2.62□□□□□ -1.99
TMOD3-208ENST00000560725 DNAL4O96015 105 aa2.62□□□□□ -1.99
TMOD3-208ENST00000560725 BAALC-AS2P0C853 105 aa2.62□□□□□ -1.99
TMOD3-208ENST00000560725 COX7BP24311 80 aa2.62□□□□□ -1.99
TMOD3-208ENST00000560725 KRTAP5-9P26371 169 aa2.62□□□□□ -1.99
TMOD3-208ENST00000560725 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP2.62□□□□□ -1.99
TMOD3-208ENST00000560725 NPC2P61916 151 aa2.62□□□□□ -1.99
TMOD3-208ENST00000560725 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa2.62□□□□□ -1.99
TMOD3-208ENST00000560725 HRCT1Q6UXD1 115 aa2.62□□□□□ -1.99
TMOD3-208ENST00000560725 SMIM11BQ8TCY0 68 aa2.62□□□□□ -1.99
TMOD3-208ENST00000560725 C9orf92A6NGG3 77 aa2.61□□□□□ -1.99
TMOD3-208ENST00000560725 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa2.61□□□□□ -1.99
TMOD3-208ENST00000560725 PDE6GP18545 87 aa2.61□□□□□ -1.99
TMOD3-208ENST00000560725 Q6JHZ5 121 aa2.61□□□□□ -1.99
TMOD3-208ENST00000560725 DEFB105AQ8NG35 78 aa2.61□□□□□ -1.99
TMOD3-208ENST00000560725 ORMDL1Q9P0S3 153 aa2.61□□□□□ -1.99
TMOD3-208ENST00000560725 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa2.6□□□□□ -1.99
TMOD3-208ENST00000560725 M0R2T5 61 aa2.6□□□□□ -1.99
TMOD3-208ENST00000560725 RPL37P61927 97 aaKnown RBP2.6□□□□□ -1.99
TMOD3-208ENST00000560725 RPS28P62857 69 aaKnown RBP2.6□□□□□ -1.99
TMOD3-208ENST00000560725 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa2.59□□□□□ -1.99
TMOD3-208ENST00000560725 UQCRQO14949 82 aa2.59□□□□□ -1.99
TMOD3-208ENST00000560725 CCKP06307 115 aa2.59□□□□□ -1.99
TMOD3-208ENST00000560725 COX6B2Q6YFQ2 88 aa2.59□□□□□ -1.99
TMOD3-208ENST00000560725 A8MUN3 132 aa2.58□□□□□ -2
TMOD3-208ENST00000560725 ATOX1O00244 68 aa2.58□□□□□ -2
TMOD3-208ENST00000560725 LINC00575Q6W349 94 aa2.58□□□□□ -2
TMOD3-208ENST00000560725 FSIP2Q5CZC0 6907 aa2.57□□□□□ -2
TMOD3-208ENST00000560725 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa2.57□□□□□ -2
TMOD3-208ENST00000560725 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa2.57□□□□□ -2
TMOD3-208ENST00000560725 F8WEM9 126 aa2.57□□□□□ -2
TMOD3-208ENST00000560725 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP2.57□□□□□ -2
TMOD3-208ENST00000560725 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa2.57□□□□□ -2
TMOD3-208ENST00000560725 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa2.56□□□□□ -2
TMOD3-208ENST00000560725 hADV29S1A0JD25 119 aa2.56□□□□□ -2
TMOD3-208ENST00000560725 COX7CP15954 63 aa2.56□□□□□ -2
TMOD3-208ENST00000560725 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa2.56□□□□□ -2
TMOD3-208ENST00000560725 Q6ZQT0 140 aa2.56□□□□□ -2
TMOD3-208ENST00000560725 C14orf132Q9NPU4 83 aa2.56□□□□□ -2
TMOD3-208ENST00000560725 LINC00846Q9NV44 126 aa2.56□□□□□ -2
TMOD3-208ENST00000560725 RBM3P98179 157 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
TMOD3-208ENST00000560725 SERP2Q8N6R1 65 aa2.55□□□□□ -2
TMOD3-208ENST00000560725 CCDC179H3BU77 68 aa2.54□□□□□ -2
TMOD3-208ENST00000560725 LCE1CQ5T751 118 aa2.54□□□□□ -2
TMOD3-208ENST00000560725 LCE1BQ5T7P3 118 aa2.54□□□□□ -2
TMOD3-208ENST00000560725 UBL5Q9BZL1 73 aa2.54□□□□□ -2
TMOD3-208ENST00000560725 PRO2289Q9P1D8 64 aa2.54□□□□□ -2
TMOD3-208ENST00000560725 A0A0G2JQZ4 141 aa2.53□□□□□ -2
TMOD3-208ENST00000560725 TMEM258P61165 79 aa2.53□□□□□ -2
TMOD3-208ENST00000560725 Q6ZQY7 126 aa2.52□□□□□ -2.01
TMOD3-208ENST00000560725 DSCR8Q96T75 97 aa2.52□□□□□ -2.01
TMOD3-208ENST00000560725 KLKP1Q107X0 134 aa2.51□□□□□ -2.01
TMOD3-208ENST00000560725 Q96NJ1 140 aa2.51□□□□□ -2.01
TMOD3-208ENST00000560725 TRAV7A0A075B6U4 112 aa2.5□□□□□ -2.01
TMOD3-208ENST00000560725 NDUFC1O43677 76 aa2.49□□□□□ -2.01
TMOD3-208ENST00000560725 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP2.49□□□□□ -2.01
TMOD3-208ENST00000560725 OBSCNQ5VST9 7968 aa2.49□□□□□ -2.01
TMOD3-208ENST00000560725 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa2.48□□□□□ -2.01
TMOD3-208ENST00000560725 A0A087WVE0 104 aa2.47□□□□□ -2.01
TMOD3-208ENST00000560725 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa2.47□□□□□ -2.01
TMOD3-208ENST00000560725 PRR15Q8IV56 129 aa2.46□□□□□ -2.02
TMOD3-208ENST00000560725 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa2.46□□□□□ -2.02
TMOD3-208ENST00000560725 A0A087WSZ3 146 aa2.45□□□□□ -2.02
TMOD3-208ENST00000560725 H7BZZ5 65 aa2.45□□□□□ -2.02
TMOD3-208ENST00000560725 KRTAP12-3P60328 96 aa2.45□□□□□ -2.02
TMOD3-208ENST00000560725 LCA10Q71F78 164 aa2.45□□□□□ -2.02
TMOD3-208ENST00000560725 NREPQ16612 68 aa2.44□□□□□ -2.02
TMOD3-208ENST00000560725 BRK1Q8WUW1 75 aa2.44□□□□□ -2.02
TMOD3-208ENST00000560725 CYSTM1Q9H1C7 97 aa2.44□□□□□ -2.02
TMOD3-208ENST00000560725 SERP1Q9Y6X1 66 aa2.44□□□□□ -2.02
TMOD3-208ENST00000560725 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP2.42□□□□□ -2.02
TMOD3-208ENST00000560725 MT2AP02795 61 aa2.42□□□□□ -2.02
TMOD3-208ENST00000560725 C20orf197Q8N268 126 aa2.42□□□□□ -2.02
TMOD3-208ENST00000560725 TMEM254Q8TBM7 123 aa2.42□□□□□ -2.02
TMOD3-208ENST00000560725 LINC00472Q9H8W2 130 aa2.4□□□□□ -2.03
TMOD3-208ENST00000560725 NDUFB1O75438 58 aa2.39□□□□□ -2.03
TMOD3-208ENST00000560725 MT1FP04733 61 aa2.39□□□□□ -2.03
TMOD3-208ENST00000560725 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa2.39□□□□□ -2.03
TMOD3-208ENST00000560725 HCG22E2RYF7 251 aa2.38□□□□□ -2.03
TMOD3-208ENST00000560725 KRTAP12-1P59990 96 aa2.38□□□□□ -2.03
TMOD3-208ENST00000560725 LINC01554Q52M75 96 aa2.38□□□□□ -2.03
TMOD3-208ENST00000560725 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa2.38□□□□□ -2.03
TMOD3-208ENST00000560725 SPINK7P58062 85 aa2.37□□□□□ -2.03
TMOD3-208ENST00000560725 K7EQZ3 153 aa2.36□□□□□ -2.03
TMOD3-208ENST00000560725 USH2AO75445 5202 aa2.36□□□□□ -2.03
TMOD3-208ENST00000560725 SSPOA2VEC9 5147 aa2.35□□□□□ -2.03
TMOD3-208ENST00000560725 hDV103S1A0JD37 113 aa2.35□□□□□ -2.03
TMOD3-208ENST00000560725 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa2.35□□□□□ -2.03
TMOD3-208ENST00000560725 SNURFQ9Y675 71 aa2.35□□□□□ -2.03
TMOD3-208ENST00000560725 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa2.34□□□□□ -2.03
TMOD3-208ENST00000560725 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP2.34□□□□□ -2.04
TMOD3-208ENST00000560725 TRAV22A0A0B4J277 110 aa2.33□□□□□ -2.04
TMOD3-208ENST00000560725 Q1T7F1 81 aa2.33□□□□□ -2.04
TMOD3-208ENST00000560725 C7orf65Q6ZTY9 151 aa2.33□□□□□ -2.04
TMOD3-208ENST00000560725 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa2.32□□□□□ -2.04
TMOD3-208ENST00000560725 KRTAP12-4P60329 112 aa2.32□□□□□ -2.04
TMOD3-208ENST00000560725 CASC2Q6XLA1 102 aa2.32□□□□□ -2.04
TMOD3-208ENST00000560725 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP2.31□□□□□ -2.04
TMOD3-208ENST00000560725 WFDC13Q8IUB5 93 aa2.31□□□□□ -2.04
TMOD3-208ENST00000560725 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa2.3□□□□□ -2.04
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