RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511807.1

UBE2B-208, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 B, humanhuman

TSL 3

Gene UBE2B, Length 818 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2B-208ENST00000511807 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa5.84□□□□□ -1.47
UBE2B-208ENST00000511807 IGKV2-30P06310 120 aa5.84□□□□□ -1.47
UBE2B-208ENST00000511807 C7orf65Q6ZTY9 151 aa5.84□□□□□ -1.47
UBE2B-208ENST00000511807 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa5.83□□□□□ -1.48
UBE2B-208ENST00000511807 H3BPC8 53 aa5.83□□□□□ -1.48
UBE2B-208ENST00000511807 SERP2Q8N6R1 65 aa5.82□□□□□ -1.48
UBE2B-208ENST00000511807 LCE5AQ5TCM9 118 aa5.81□□□□□ -1.48
UBE2B-208ENST00000511807 C1orf64Q8NEQ6 169 aa5.81□□□□□ -1.48
UBE2B-208ENST00000511807 LINC00208Q96KT6 92 aa5.81□□□□□ -1.48
UBE2B-208ENST00000511807 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa5.78□□□□□ -1.48
UBE2B-208ENST00000511807 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa5.77□□□□□ -1.49
UBE2B-208ENST00000511807 PCP4P48539 62 aa5.76□□□□□ -1.49
UBE2B-208ENST00000511807 ANAPC13Q9BS18 74 aa5.76□□□□□ -1.49
UBE2B-208ENST00000511807 HRES1P13985 223 aa5.75□□□□□ -1.49
UBE2B-208ENST00000511807 COX7CP15954 63 aa5.74□□□□□ -1.49
UBE2B-208ENST00000511807 C20orf197Q8N268 126 aa5.72□□□□□ -1.49
UBE2B-208ENST00000511807 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa5.71□□□□□ -1.5
UBE2B-208ENST00000511807 FAM236CP0DP71 79 aa5.71□□□□□ -1.5
UBE2B-208ENST00000511807 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa5.71□□□□□ -1.5
UBE2B-208ENST00000511807 MPLKIPQ8TAP9 179 aa5.71□□□□□ -1.5
UBE2B-208ENST00000511807 C4orf26Q17RF5 130 aa5.69□□□□□ -1.5
UBE2B-208ENST00000511807 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
UBE2B-208ENST00000511807 KLKP1Q107X0 134 aa5.68□□□□□ -1.5
UBE2B-208ENST00000511807 SNURFQ9Y675 71 aa5.68□□□□□ -1.5
UBE2B-208ENST00000511807 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa5.67□□□□□ -1.5
UBE2B-208ENST00000511807 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa5.66□□□□□ -1.5
UBE2B-208ENST00000511807 NDUFC1O43677 76 aa5.63□□□□□ -1.51
UBE2B-208ENST00000511807 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa5.62□□□□□ -1.51
UBE2B-208ENST00000511807 A8MUN3 132 aa5.6□□□□□ -1.51
UBE2B-208ENST00000511807 CCDC179H3BU77 68 aa5.59□□□□□ -1.51
UBE2B-208ENST00000511807 MT2AP02795 61 aa5.59□□□□□ -1.51
UBE2B-208ENST00000511807 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa5.58□□□□□ -1.52
UBE2B-208ENST00000511807 H7BZZ5 65 aa5.55□□□□□ -1.52
UBE2B-208ENST00000511807 DMAC1Q96GE9 116 aa5.55□□□□□ -1.52
UBE2B-208ENST00000511807 MT1FP04733 61 aa5.54□□□□□ -1.52
UBE2B-208ENST00000511807 ACYP2P14621 99 aa5.53□□□□□ -1.52
UBE2B-208ENST00000511807 KRTAP10-10P60014 251 aa5.53□□□□□ -1.52
UBE2B-208ENST00000511807 CYSTM1Q9H1C7 97 aa5.52□□□□□ -1.53
UBE2B-208ENST00000511807 S4R3F8 94 aa5.51□□□□□ -1.53
UBE2B-208ENST00000511807 SSPOA2VEC9 5147 aa5.48□□□□□ -1.53
UBE2B-208ENST00000511807 USH2AO75445 5202 aa5.48□□□□□ -1.53
UBE2B-208ENST00000511807 LCA10Q71F78 164 aa5.46□□□□□ -1.54
UBE2B-208ENST00000511807 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
UBE2B-208ENST00000511807 CSAG1Q6PB30 78 aa5.45□□□□□ -1.54
UBE2B-208ENST00000511807 TMEM258P61165 79 aa5.44□□□□□ -1.54
UBE2B-208ENST00000511807 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa5.43□□□□□ -1.54
UBE2B-208ENST00000511807 SPTSSBQ8NFR3 76 aa5.41□□□□□ -1.54
UBE2B-208ENST00000511807 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP5.41□□□□□ -1.54
UBE2B-208ENST00000511807 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa5.4□□□□□ -1.54
UBE2B-208ENST00000511807 COA5Q86WW8 74 aa5.38□□□□□ -1.55
UBE2B-208ENST00000511807 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa5.35□□□□□ -1.55
UBE2B-208ENST00000511807 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP5.3□□□□□ -1.56
UBE2B-208ENST00000511807 H0YAA0 97 aa5.28□□□□□ -1.56
UBE2B-208ENST00000511807 SERP1Q9Y6X1 66 aa5.28□□□□□ -1.56
UBE2B-208ENST00000511807 ADM2Q7Z4H4 148 aa5.23□□□□□ -1.57
UBE2B-208ENST00000511807 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP5.22□□□□□ -1.57
UBE2B-208ENST00000511807 SEC61GP60059 68 aa5.2□□□□□ -1.58
UBE2B-208ENST00000511807 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa5.2□□□□□ -1.58
UBE2B-208ENST00000511807 RPS28P62857 69 aaKnown RBP5.17□□□□□ -1.58
UBE2B-208ENST00000511807 CRIPTQ9P021 101 aa5.16□□□□□ -1.58
UBE2B-208ENST00000511807 A0A1B0GU69 56 aa5.13□□□□□ -1.59
UBE2B-208ENST00000511807 P0C880 135 aa5.13□□□□□ -1.59
UBE2B-208ENST00000511807 SMIM26A0A096LP01 95 aa5.12□□□□□ -1.59
UBE2B-208ENST00000511807 A0A0A0MQY5 61 aa5.12□□□□□ -1.59
UBE2B-208ENST00000511807 PRR15LQ9BU68 103 aa5.12□□□□□ -1.59
UBE2B-208ENST00000511807 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa5.12□□□□□ -1.59
UBE2B-208ENST00000511807 V9GYY9 64 aa5.11□□□□□ -1.59
UBE2B-208ENST00000511807 R4GN34 69 aa5.09□□□□□ -1.59
UBE2B-208ENST00000511807 A6NN06 94 aa5.07□□□□□ -1.6
UBE2B-208ENST00000511807 Q1T7F1 81 aa5.06□□□□□ -1.6
UBE2B-208ENST00000511807 M0QZ58 72 aa5.05□□□□□ -1.6
UBE2B-208ENST00000511807 SPRR2GQ9BYE4 73 aa5.05□□□□□ -1.6
UBE2B-208ENST00000511807 A0A1B0GU33 70 aa5.04□□□□□ -1.6
UBE2B-208ENST00000511807 Q5VV11 94 aa5.04□□□□□ -1.6
UBE2B-208ENST00000511807 MT1BP07438 61 aa5.03□□□□□ -1.6
UBE2B-208ENST00000511807 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa4.99□□□□□ -1.61
UBE2B-208ENST00000511807 PSPHP1O15172 72 aa4.96□□□□□ -1.62
UBE2B-208ENST00000511807 LINC01554Q52M75 96 aa4.96□□□□□ -1.62
UBE2B-208ENST00000511807 KRTAP10-5P60370 271 aa4.95□□□□□ -1.62
UBE2B-208ENST00000511807 UQCR11O14957 56 aa4.94□□□□□ -1.62
UBE2B-208ENST00000511807 NEBP20929 6669 aa4.93□□□□□ -1.62
UBE2B-208ENST00000511807 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa4.93□□□□□ -1.62
UBE2B-208ENST00000511807 SPATA8Q6RVD6 105 aa4.93□□□□□ -1.62
UBE2B-208ENST00000511807 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa4.92□□□□□ -1.62
UBE2B-208ENST00000511807 PLAC4Q8WY50 150 aa4.9□□□□□ -1.63
UBE2B-208ENST00000511807 KRTAP5-9P26371 169 aa4.88□□□□□ -1.63
UBE2B-208ENST00000511807 A0A0D9SG42 100 aa4.87□□□□□ -1.63
UBE2B-208ENST00000511807 MIR22HGQ0VDD5 57 aa4.85□□□□□ -1.63
UBE2B-208ENST00000511807 A6NED7 52 aa4.84□□□□□ -1.63
UBE2B-208ENST00000511807 A8MU10 97 aa4.81□□□□□ -1.64
UBE2B-208ENST00000511807 MUC12Q9UKN1 5478 aa4.81□□□□□ -1.64
UBE2B-208ENST00000511807 SPINT4Q6UDR6 99 aa4.8□□□□□ -1.64
UBE2B-208ENST00000511807 KRTAP12-1P59990 96 aa4.77□□□□□ -1.65
UBE2B-208ENST00000511807 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa4.75□□□□□ -1.65
UBE2B-208ENST00000511807 PRO2289Q9P1D8 64 aa4.74□□□□□ -1.65
UBE2B-208ENST00000511807 KMT2DO14686 5537 aa4.74□□□□□ -1.65
UBE2B-208ENST00000511807 K7ERS5 55 aa4.73□□□□□ -1.65
UBE2B-208ENST00000511807 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa4.73□□□□□ -1.65
UBE2B-208ENST00000511807 KRTAP12-2P59991 146 aa4.73□□□□□ -1.65
UBE2B-208ENST00000511807 SPRR2FQ96RM1 72 aa4.73□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 151.9 ms