RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492539.5

NELFE-212, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 3

Gene NELFE, Length 583 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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NELFE-212ENST00000492539 C5orf47Q569G3 176 aa9.14□□□□□ -0.95
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NELFE-212ENST00000492539 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa9.06□□□□□ -0.96
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NELFE-212ENST00000492539 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP8.13□□□□□ -1.11
NELFE-212ENST00000492539 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa8.13□□□□□ -1.11
NELFE-212ENST00000492539 LINC01554Q52M75 96 aa8.11□□□□□ -1.11
NELFE-212ENST00000492539 SEC61GP60059 68 aa8.07□□□□□ -1.12
NELFE-212ENST00000492539 SERP1Q9Y6X1 66 aa8.05□□□□□ -1.12
NELFE-212ENST00000492539 TMEM258P61165 79 aa8.03□□□□□ -1.12
NELFE-212ENST00000492539 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa8□□□□□ -1.13
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NELFE-212ENST00000492539 A0A1B0GU69 56 aa7.91□□□□□ -1.14
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NELFE-212ENST00000492539 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa7.79□□□□□ -1.16
NELFE-212ENST00000492539 PRR15LQ9BU68 103 aa7.78□□□□□ -1.16
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NELFE-212ENST00000492539 SPINT4Q6UDR6 99 aa7.65□□□□□ -1.18
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NELFE-212ENST00000492539 Q1T7F1 81 aa7.5□□□□□ -1.21
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NELFE-212ENST00000492539 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa7.5□□□□□ -1.21
NELFE-212ENST00000492539 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa7.46□□□□□ -1.22
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NELFE-212ENST00000492539 RPS28P62857 69 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
NELFE-212ENST00000492539 MIR22HGQ0VDD5 57 aa7.38□□□□□ -1.23
NELFE-212ENST00000492539 LCE1DQ5T752 114 aa7.3□□□□□ -1.24
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