RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485765.5

NISCH-209, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 4

Gene NISCH, Length 563 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-209ENST00000485765 SSPOA2VEC9 5147 aa8.99□□□□□ -0.97
NISCH-209ENST00000485765 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa8.95□□□□□ -0.98
NISCH-209ENST00000485765 COX7CP15954 63 aa8.92□□□□□ -0.98
NISCH-209ENST00000485765 C20orf197Q8N268 126 aa8.88□□□□□ -0.99
NISCH-209ENST00000485765 S4R3F8 94 aa8.87□□□□□ -0.99
NISCH-209ENST00000485765 LCA10Q71F78 164 aa8.84□□□□□ -0.99
NISCH-209ENST00000485765 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa8.83□□□□□ -1
NISCH-209ENST00000485765 CSAG1Q6PB30 78 aa8.82□□□□□ -1
NISCH-209ENST00000485765 SNURFQ9Y675 71 aa8.82□□□□□ -1
NISCH-209ENST00000485765 KLKP1Q107X0 134 aa8.8□□□□□ -1
NISCH-209ENST00000485765 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP8.79□□□□□ -1
NISCH-209ENST00000485765 NDUFC1O43677 76 aa8.78□□□□□ -1
NISCH-209ENST00000485765 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa8.77□□□□□ -1.01
NISCH-209ENST00000485765 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa8.73□□□□□ -1.01
NISCH-209ENST00000485765 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
NISCH-209ENST00000485765 A8MUN3 132 aa8.69□□□□□ -1.02
NISCH-209ENST00000485765 CCDC179H3BU77 68 aa8.68□□□□□ -1.02
NISCH-209ENST00000485765 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa8.65□□□□□ -1.02
NISCH-209ENST00000485765 SPRR2GQ9BYE4 73 aa8.6□□□□□ -1.03
NISCH-209ENST00000485765 H7BZZ5 65 aa8.59□□□□□ -1.03
NISCH-209ENST00000485765 PCP4P48539 62 aa8.59□□□□□ -1.03
NISCH-209ENST00000485765 ACYP2P14621 99 aa8.58□□□□□ -1.04
NISCH-209ENST00000485765 DMAC1Q96GE9 116 aa8.58□□□□□ -1.04
NISCH-209ENST00000485765 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa8.55□□□□□ -1.04
NISCH-209ENST00000485765 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
NISCH-209ENST00000485765 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa8.54□□□□□ -1.04
NISCH-209ENST00000485765 CYSTM1Q9H1C7 97 aa8.53□□□□□ -1.04
NISCH-209ENST00000485765 H0YAA0 97 aa8.51□□□□□ -1.05
NISCH-209ENST00000485765 MT1BP07438 61 aa8.51□□□□□ -1.05
NISCH-209ENST00000485765 TMEM258P61165 79 aa8.5□□□□□ -1.05
NISCH-209ENST00000485765 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
NISCH-209ENST00000485765 CRIPTQ9P021 101 aa8.49□□□□□ -1.05
NISCH-209ENST00000485765 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa8.48□□□□□ -1.05
NISCH-209ENST00000485765 Q5VV11 94 aa8.47□□□□□ -1.05
NISCH-209ENST00000485765 SPTSSBQ8NFR3 76 aa8.45□□□□□ -1.06
NISCH-209ENST00000485765 ADM2Q7Z4H4 148 aa8.37□□□□□ -1.07
NISCH-209ENST00000485765 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
NISCH-209ENST00000485765 COA5Q86WW8 74 aa8.36□□□□□ -1.07
NISCH-209ENST00000485765 A6NN06 94 aa8.32□□□□□ -1.08
NISCH-209ENST00000485765 KRTAP10-5P60370 271 aa8.29□□□□□ -1.08
NISCH-209ENST00000485765 SERP1Q9Y6X1 66 aa8.22□□□□□ -1.09
NISCH-209ENST00000485765 P0C880 135 aa8.21□□□□□ -1.1
NISCH-209ENST00000485765 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa8.21□□□□□ -1.1
NISCH-209ENST00000485765 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa8.2□□□□□ -1.1
NISCH-209ENST00000485765 SEC61GP60059 68 aa8.14□□□□□ -1.11
NISCH-209ENST00000485765 R4GN34 69 aa8.14□□□□□ -1.11
NISCH-209ENST00000485765 M0QZ58 72 aa8.07□□□□□ -1.12
NISCH-209ENST00000485765 PLAC4Q8WY50 150 aa8.04□□□□□ -1.12
NISCH-209ENST00000485765 RPS28P62857 69 aaKnown RBP8.02□□□□□ -1.13
NISCH-209ENST00000485765 PRR15LQ9BU68 103 aa8.02□□□□□ -1.13
NISCH-209ENST00000485765 MT1XP80297 61 aa8.01□□□□□ -1.13
NISCH-209ENST00000485765 A0A1B0GU69 56 aa7.99□□□□□ -1.13
NISCH-209ENST00000485765 V9GYY9 64 aa7.99□□□□□ -1.13
NISCH-209ENST00000485765 PRO2289Q9P1D8 64 aa7.98□□□□□ -1.13
NISCH-209ENST00000485765 SMIM26A0A096LP01 95 aa7.96□□□□□ -1.14
NISCH-209ENST00000485765 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa7.93□□□□□ -1.14
NISCH-209ENST00000485765 LINC01554Q52M75 96 aa7.92□□□□□ -1.14
NISCH-209ENST00000485765 KRTAP5-9P26371 169 aa7.9□□□□□ -1.14
NISCH-209ENST00000485765 MUC12Q9UKN1 5478 aa7.87□□□□□ -1.15
NISCH-209ENST00000485765 NEBP20929 6669 aa7.87□□□□□ -1.15
NISCH-209ENST00000485765 Q1T7F1 81 aa7.86□□□□□ -1.15
NISCH-209ENST00000485765 A0A1B0GU33 70 aa7.81□□□□□ -1.16
NISCH-209ENST00000485765 KRTAP12-2P59991 146 aa7.81□□□□□ -1.16
NISCH-209ENST00000485765 KMT2DO14686 5537 aa7.79□□□□□ -1.16
NISCH-209ENST00000485765 PSPHP1O15172 72 aa7.73□□□□□ -1.17
NISCH-209ENST00000485765 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa7.72□□□□□ -1.17
NISCH-209ENST00000485765 UQCR11O14957 56 aa7.7□□□□□ -1.18
NISCH-209ENST00000485765 MDN1Q9NU22 5596 aa7.69□□□□□ -1.18
NISCH-209ENST00000485765 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa7.64□□□□□ -1.19
NISCH-209ENST00000485765 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP7.63□□□□□ -1.19
NISCH-209ENST00000485765 KRTAP10-12P60413 245 aa7.62□□□□□ -1.19
NISCH-209ENST00000485765 SPATA8Q6RVD6 105 aa7.62□□□□□ -1.19
NISCH-209ENST00000485765 SPRR2FQ96RM1 72 aa7.62□□□□□ -1.19
NISCH-209ENST00000485765 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa7.61□□□□□ -1.19
NISCH-209ENST00000485765 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa7.61□□□□□ -1.19
NISCH-209ENST00000485765 A6NED7 52 aa7.58□□□□□ -1.2
NISCH-209ENST00000485765 A0A0D9SG42 100 aa7.55□□□□□ -1.2
NISCH-209ENST00000485765 MIR22HGQ0VDD5 57 aa7.55□□□□□ -1.2
NISCH-209ENST00000485765 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa7.5□□□□□ -1.21
NISCH-209ENST00000485765 SPRR2EP22531 72 aa7.49□□□□□ -1.21
NISCH-209ENST00000485765 SPRR2BP35325 72 aa7.49□□□□□ -1.21
NISCH-209ENST00000485765 SPRR2AP35326 72 aa7.49□□□□□ -1.21
NISCH-209ENST00000485765 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa7.47□□□□□ -1.21
NISCH-209ENST00000485765 LCE1AQ5T7P2 110 aa7.45□□□□□ -1.22
NISCH-209ENST00000485765 SPINT4Q6UDR6 99 aa7.45□□□□□ -1.22
NISCH-209ENST00000485765 A8MU10 97 aa7.43□□□□□ -1.22
NISCH-209ENST00000485765 K7ERS5 55 aa7.43□□□□□ -1.22
NISCH-209ENST00000485765 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa7.38□□□□□ -1.23
NISCH-209ENST00000485765 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa7.38□□□□□ -1.23
NISCH-209ENST00000485765 KRTAP12-1P59990 96 aa7.36□□□□□ -1.23
NISCH-209ENST00000485765 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa7.35□□□□□ -1.23
NISCH-209ENST00000485765 SPRR2DP22532 72 aa7.24□□□□□ -1.25
NISCH-209ENST00000485765 BRK1Q8WUW1 75 aa7.23□□□□□ -1.25
NISCH-209ENST00000485765 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa7.16□□□□□ -1.26
NISCH-209ENST00000485765 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa7.15□□□□□ -1.26
NISCH-209ENST00000485765 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa7.15□□□□□ -1.26
NISCH-209ENST00000485765 MT1EP04732 61 aa7.08□□□□□ -1.28
NISCH-209ENST00000485765 LCE3BQ5TA77 95 aa7.04□□□□□ -1.28
NISCH-209ENST00000485765 C10orf95Q9H7T3 257 aa7.03□□□□□ -1.28
NISCH-209ENST00000485765 LCE5AQ5TCM9 118 aa7.02□□□□□ -1.29
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